Биопайтон - Установка
В этом разделе объясняется, как установить Biopython на ваш компьютер. Его очень легко установить, и это займет не более пяти минут.
Step 1 - Проверка установки Python
Biopython разработан для работы с Python 2.5 или более поздними версиями. Итак, сначала необходимо установить python. Выполните следующую команду в командной строке -
> python --versionЭто определено ниже -
Он показывает версию python, если она установлена правильно. В противном случае загрузите последнюю версию python, установите ее и снова запустите команду.
Step 2 - Установка Biopython с помощью pip
Biopython легко установить с помощью pip из командной строки на всех платформах. Введите команду ниже -
> pip install biopythonНа вашем экране будет виден следующий ответ -
Для обновления более старой версии Biopython -
> pip install biopython –-upgradeНа вашем экране будет виден следующий ответ -
После выполнения этой команды старые версии Biopython и NumPy (от этого зависит Biopython) будут удалены перед установкой последних версий.
Step 3 - Проверка установки Biopython
Теперь вы успешно установили Biopython на свой компьютер. Чтобы убедиться, что Biopython установлен правильно, введите в консоли Python следующую команду:
Показывает версию Biopython.
Alternate Way − Installing Biopython using Source
Чтобы установить Biopython с использованием исходного кода, следуйте приведенным ниже инструкциям:
Загрузите последнюю версию Biopython по следующей ссылке - https://biopython.org/wiki/Download
На данный момент последняя версия biopython-1.72.
Загрузите файл и распакуйте сжатый архивный файл, перейдите в папку с исходным кодом и введите следующую команду -
> python setup.py buildЭто создаст Biopython из исходного кода, как показано ниже -
Теперь проверьте код, используя следующую команду -
> python setup.py test
Наконец, установите с помощью следующей команды -
> python setup.py install