Biopython - Cài đặt
Phần này giải thích cách cài đặt Biopython trên máy tính của bạn. Nó rất dễ cài đặt và sẽ không mất quá năm phút.
Step 1 - Xác minh cài đặt Python
Biopython được thiết kế để hoạt động với Python 2.5 hoặc các phiên bản cao hơn. Vì vậy, bắt buộc phải cài đặt python trước. Chạy lệnh dưới đây trong dấu nhắc lệnh của bạn -
> python --versionNó được định nghĩa dưới đây -
Nó hiển thị phiên bản của python, nếu được cài đặt đúng cách. Nếu không, hãy tải xuống phiên bản mới nhất của python, cài đặt nó và sau đó chạy lại lệnh.
Step 2 - Cài đặt Biopython bằng pip
Dễ dàng cài đặt Biopython bằng cách sử dụng pip từ dòng lệnh trên tất cả các nền tảng. Nhập lệnh dưới đây -
> pip install biopythonPhản hồi sau sẽ được hiển thị trên màn hình của bạn -
Để cập nhật phiên bản cũ hơn của Biopython -
> pip install biopython –-upgradePhản hồi sau sẽ được hiển thị trên màn hình của bạn -
Sau khi thực hiện lệnh này, các phiên bản cũ hơn của Biopython và NumPy (Biopython phụ thuộc vào nó) sẽ bị xóa trước khi cài đặt các phiên bản gần đây.
Step 3 - Xác minh cài đặt Biopython
Bây giờ, bạn đã cài đặt thành công Biopython trên máy của mình. Để xác minh rằng Biopython được cài đặt đúng cách, hãy nhập lệnh dưới đây trên bảng điều khiển python của bạn -
Nó hiển thị phiên bản của Biopython.
Alternate Way − Installing Biopython using Source
Để cài đặt Biopython bằng mã nguồn, hãy làm theo hướng dẫn sau:
Tải xuống bản phát hành gần đây của Biopython từ liên kết sau: https://biopython.org/wiki/Download
Hiện tại, phiên bản mới nhất là biopython-1.72.
Tải xuống tệp và giải nén tệp lưu trữ đã nén, chuyển vào thư mục mã nguồn và nhập lệnh dưới đây:
> python setup.py buildĐiều này sẽ xây dựng Biopython từ mã nguồn như dưới đây:
Bây giờ, hãy kiểm tra mã bằng lệnh dưới đây:
> python setup.py test
Cuối cùng, cài đặt bằng lệnh dưới đây -
> python setup.py install