Biopython - Kỹ thuật kiểm tra

Biopython có kịch bản thử nghiệm rộng rãi để kiểm tra phần mềm trong các điều kiện khác nhau để đảm bảo rằng phần mềm không có lỗi. Để chạy tập lệnh thử nghiệm, hãy tải xuống mã nguồn của Biopython và sau đó chạy lệnh dưới đây:

python run_tests.py

Thao tác này sẽ chạy tất cả các tập lệnh thử nghiệm và đưa ra kết quả sau:

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

Chúng tôi cũng có thể chạy tập lệnh thử nghiệm riêng lẻ như được chỉ định bên dưới -

python test_AlignIO.py

Phần kết luận

Như chúng ta đã tìm hiểu, Biopython là một trong những phần mềm quan trọng trong lĩnh vực tin sinh học. Được viết bằng python (dễ học và viết), Nó cung cấp chức năng mở rộng để xử lý bất kỳ phép tính và hoạt động nào trong lĩnh vực tin sinh học. Nó cũng cung cấp giao diện dễ dàng và linh hoạt cho hầu hết các phần mềm tin sinh học phổ biến để khai thác các chức năng của nó.