Biopython - Installation
In diesem Abschnitt wird erläutert, wie Sie Biopython auf Ihrem Computer installieren. Die Installation ist sehr einfach und dauert nicht länger als fünf Minuten.
Step 1 - Überprüfen der Python-Installation
Biopython wurde für Python 2.5 oder höhere Versionen entwickelt. Daher muss Python zuerst installiert werden. Führen Sie den folgenden Befehl in Ihrer Eingabeaufforderung aus -
> python --version
Es ist unten definiert -
Es zeigt die Version von Python, wenn es richtig installiert ist. Laden Sie andernfalls die neueste Version von Python herunter, installieren Sie sie und führen Sie den Befehl erneut aus.
Step 2 - Installieren von Biopython mit pip
Es ist einfach, Biopython mit pip über die Befehlszeile auf allen Plattformen zu installieren. Geben Sie den folgenden Befehl ein -
> pip install biopython
Die folgende Antwort wird auf Ihrem Bildschirm angezeigt:
Zum Aktualisieren einer älteren Version von Biopython -
> pip install biopython –-upgrade
Die folgende Antwort wird auf Ihrem Bildschirm angezeigt:
Nach dem Ausführen dieses Befehls werden die älteren Versionen von Biopython und NumPy (Biopython hängt davon ab) entfernt, bevor die neuesten Versionen installiert werden.
Step 3 - Überprüfen der Biopython-Installation
Jetzt haben Sie Biopython erfolgreich auf Ihrem Computer installiert. Geben Sie den folgenden Befehl auf Ihrer Python-Konsole ein, um zu überprüfen, ob Biopython ordnungsgemäß installiert ist.
Es zeigt die Version von Biopython.
Alternate Way − Installing Biopython using Source
Befolgen Sie die folgenden Anweisungen, um Biopython mithilfe des Quellcodes zu installieren:
Laden Sie die aktuelle Version von Biopython über den folgenden Link herunter: https://biopython.org/wiki/Download
Ab sofort ist die neueste Version biopython-1.72.
Laden Sie die Datei herunter und entpacken Sie die komprimierte Archivdatei, wechseln Sie in den Quellcode-Ordner und geben Sie den folgenden Befehl ein:
> python setup.py build
Dadurch wird Biopython aus dem unten angegebenen Quellcode erstellt.
Testen Sie nun den Code mit dem folgenden Befehl:
> python setup.py test
Zum Schluss installieren Sie mit dem folgenden Befehl -
> python setup.py install