Biopython - Installation

In diesem Abschnitt wird erläutert, wie Sie Biopython auf Ihrem Computer installieren. Die Installation ist sehr einfach und dauert nicht länger als fünf Minuten.

Step 1 - Überprüfen der Python-Installation

Biopython wurde für Python 2.5 oder höhere Versionen entwickelt. Daher muss Python zuerst installiert werden. Führen Sie den folgenden Befehl in Ihrer Eingabeaufforderung aus -

> python --version

Es ist unten definiert -

Es zeigt die Version von Python, wenn es richtig installiert ist. Laden Sie andernfalls die neueste Version von Python herunter, installieren Sie sie und führen Sie den Befehl erneut aus.

Step 2 - Installieren von Biopython mit pip

Es ist einfach, Biopython mit pip über die Befehlszeile auf allen Plattformen zu installieren. Geben Sie den folgenden Befehl ein -

> pip install biopython

Die folgende Antwort wird auf Ihrem Bildschirm angezeigt:

Zum Aktualisieren einer älteren Version von Biopython -

> pip install biopython –-upgrade

Die folgende Antwort wird auf Ihrem Bildschirm angezeigt:

Nach dem Ausführen dieses Befehls werden die älteren Versionen von Biopython und NumPy (Biopython hängt davon ab) entfernt, bevor die neuesten Versionen installiert werden.

Step 3 - Überprüfen der Biopython-Installation

Jetzt haben Sie Biopython erfolgreich auf Ihrem Computer installiert. Geben Sie den folgenden Befehl auf Ihrer Python-Konsole ein, um zu überprüfen, ob Biopython ordnungsgemäß installiert ist.

Es zeigt die Version von Biopython.

Alternate Way − Installing Biopython using Source

Befolgen Sie die folgenden Anweisungen, um Biopython mithilfe des Quellcodes zu installieren:

Laden Sie die aktuelle Version von Biopython über den folgenden Link herunter: https://biopython.org/wiki/Download

Ab sofort ist die neueste Version biopython-1.72.

Laden Sie die Datei herunter und entpacken Sie die komprimierte Archivdatei, wechseln Sie in den Quellcode-Ordner und geben Sie den folgenden Befehl ein:

> python setup.py build

Dadurch wird Biopython aus dem unten angegebenen Quellcode erstellt.

Testen Sie nun den Code mit dem folgenden Befehl:

> python setup.py test

Zum Schluss installieren Sie mit dem folgenden Befehl -

> python setup.py install