Biopython - Técnicas de Teste

Biopython tem um extenso script de teste para testar o software em diferentes condições para garantir que o software esteja livre de erros. Para executar o script de teste, baixe o código-fonte do Biopython e execute o comando abaixo -

python run_tests.py

Isso executará todos os scripts de teste e fornecerá a seguinte saída -

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

Também podemos executar um script de teste individual conforme especificado abaixo -

python test_AlignIO.py

Conclusão

Como vimos, Biopython é um dos softwares importantes no campo da bioinformática. Por ser escrito em python (fácil de aprender e escrever), oferece ampla funcionalidade para lidar com qualquer computação e operação no campo da bioinformática. Ele também fornece uma interface fácil e flexível para quase todos os softwares de bioinformática populares para explorar sua funcionalidade.