Biopython - Kurulum
Bu bölüm, makinenize Biopython'u nasıl kuracağınızı açıklar. Kurulumu çok kolaydır ve beş dakikadan fazla sürmez.
Step 1 - Python Kurulumunu Doğrulama
Biopython, Python 2.5 veya daha yüksek sürümlerle çalışmak üzere tasarlanmıştır. Bu nedenle, önce python'un yüklenmesi zorunludur. Komut isteminizde aşağıdaki komutu çalıştırın -
> python --versionAşağıda tanımlanmıştır -
Düzgün kurulursa python sürümünü gösterir. Aksi takdirde, python'un en son sürümünü indirin, kurun ve ardından komutu yeniden çalıştırın.
Step 2 - Biopython'u pip kullanarak kurma
Tüm platformlarda komut satırından pip kullanarak Biopython kurmak kolaydır. Aşağıdaki komutu yazın -
> pip install biopythonAşağıdaki yanıt ekranınızda görülecektir -
Biopython'un eski bir sürümünü güncellemek için -
> pip install biopython –-upgradeAşağıdaki yanıt ekranınızda görülecektir -
Bu komutu çalıştırdıktan sonra, son sürümleri yüklemeden önce Biopython ve NumPy'nin eski sürümleri (Biopython buna bağlıdır) kaldırılacaktır.
Step 3 - Biopython Kurulumunu Doğrulama
Şimdi, Biopython'u makinenize başarıyla yüklediniz. Biopython'un düzgün kurulduğunu doğrulamak için python konsolunuzda aşağıdaki komutu yazın -
Biopython sürümünü gösterir.
Alternate Way − Installing Biopython using Source
Biopython'u kaynak kodunu kullanarak kurmak için aşağıdaki talimatları izleyin -
Aşağıdaki bağlantıdan Biopython'un son sürümünü indirin - https://biopython.org/wiki/Download
Şu an itibariyle en son sürüm biopython-1.72.
Dosyayı indirin ve sıkıştırılmış arşiv dosyasını açın, kaynak kod klasörüne gidin ve aşağıdaki komutu yazın -
> python setup.py buildBu, Biopython'u aşağıda verildiği gibi kaynak kodundan oluşturacaktır -
Şimdi, aşağıdaki komutu kullanarak kodu test edin -
> python setup.py test
Son olarak, aşağıdaki komutu kullanarak kurun -
> python setup.py install