Biopython - Kurulum

Bu bölüm, makinenize Biopython'u nasıl kuracağınızı açıklar. Kurulumu çok kolaydır ve beş dakikadan fazla sürmez.

Step 1 - Python Kurulumunu Doğrulama

Biopython, Python 2.5 veya daha yüksek sürümlerle çalışmak üzere tasarlanmıştır. Bu nedenle, önce python'un yüklenmesi zorunludur. Komut isteminizde aşağıdaki komutu çalıştırın -

> python --version

Aşağıda tanımlanmıştır -

Düzgün kurulursa python sürümünü gösterir. Aksi takdirde, python'un en son sürümünü indirin, kurun ve ardından komutu yeniden çalıştırın.

Step 2 - Biopython'u pip kullanarak kurma

Tüm platformlarda komut satırından pip kullanarak Biopython kurmak kolaydır. Aşağıdaki komutu yazın -

> pip install biopython

Aşağıdaki yanıt ekranınızda görülecektir -

Biopython'un eski bir sürümünü güncellemek için -

> pip install biopython –-upgrade

Aşağıdaki yanıt ekranınızda görülecektir -

Bu komutu çalıştırdıktan sonra, son sürümleri yüklemeden önce Biopython ve NumPy'nin eski sürümleri (Biopython buna bağlıdır) kaldırılacaktır.

Step 3 - Biopython Kurulumunu Doğrulama

Şimdi, Biopython'u makinenize başarıyla yüklediniz. Biopython'un düzgün kurulduğunu doğrulamak için python konsolunuzda aşağıdaki komutu yazın -

Biopython sürümünü gösterir.

Alternate Way − Installing Biopython using Source

Biopython'u kaynak kodunu kullanarak kurmak için aşağıdaki talimatları izleyin -

Aşağıdaki bağlantıdan Biopython'un son sürümünü indirin - https://biopython.org/wiki/Download

Şu an itibariyle en son sürüm biopython-1.72.

Dosyayı indirin ve sıkıştırılmış arşiv dosyasını açın, kaynak kod klasörüne gidin ve aşağıdaki komutu yazın -

> python setup.py build

Bu, Biopython'u aşağıda verildiği gibi kaynak kodundan oluşturacaktır -

Şimdi, aşağıdaki komutu kullanarak kodu test edin -

> python setup.py test

Son olarak, aşağıdaki komutu kullanarak kurun -

> python setup.py install