Biopython - Instalación
Esta sección explica cómo instalar Biopython en su máquina. Es muy fácil de instalar y no tardará más de cinco minutos.
Step 1 - Verificación de la instalación de Python
Biopython está diseñado para funcionar con Python 2.5 o versiones superiores. Entonces, es obligatorio que Python se instale primero. Ejecute el siguiente comando en su símbolo del sistema:
> python --versionSe define a continuación:
Muestra la versión de Python, si está instalada correctamente. De lo contrario, descargue la última versión de Python, instálela y luego ejecute el comando nuevamente.
Step 2 - Instalación de Biopython usando pip
Es fácil instalar Biopython usando pip desde la línea de comando en todas las plataformas. Escriba el siguiente comando:
> pip install biopythonLa siguiente respuesta se verá en su pantalla:
Para actualizar una versión anterior de Biopython:
> pip install biopython –-upgradeLa siguiente respuesta se verá en su pantalla:
Después de ejecutar este comando, las versiones anteriores de Biopython y NumPy (Biopython depende de él) se eliminarán antes de instalar las versiones recientes.
Step 3 - Verificación de la instalación de Biopython
Ahora, ha instalado Biopython con éxito en su máquina. Para verificar que Biopython esté instalado correctamente, escriba el siguiente comando en su consola de Python:
Muestra la versión de Biopython.
Alternate Way − Installing Biopython using Source
Para instalar Biopython usando el código fuente, siga las instrucciones a continuación:
Descargue la versión reciente de Biopython desde el siguiente enlace: https://biopython.org/wiki/Download
A partir de ahora, la última versión es biopython-1.72.
Descargue el archivo y descomprima el archivo comprimido, muévase a la carpeta del código fuente y escriba el siguiente comando:
> python setup.py buildEsto construirá Biopython a partir del código fuente como se indica a continuación:
Ahora, pruebe el código usando el siguiente comando:
> python setup.py test
Finalmente, instale usando el siguiente comando:
> python setup.py install