Biopython - Instalación

Esta sección explica cómo instalar Biopython en su máquina. Es muy fácil de instalar y no tardará más de cinco minutos.

Step 1 - Verificación de la instalación de Python

Biopython está diseñado para funcionar con Python 2.5 o versiones superiores. Entonces, es obligatorio que Python se instale primero. Ejecute el siguiente comando en su símbolo del sistema:

> python --version

Se define a continuación:

Muestra la versión de Python, si está instalada correctamente. De lo contrario, descargue la última versión de Python, instálela y luego ejecute el comando nuevamente.

Step 2 - Instalación de Biopython usando pip

Es fácil instalar Biopython usando pip desde la línea de comando en todas las plataformas. Escriba el siguiente comando:

> pip install biopython

La siguiente respuesta se verá en su pantalla:

Para actualizar una versión anterior de Biopython:

> pip install biopython –-upgrade

La siguiente respuesta se verá en su pantalla:

Después de ejecutar este comando, las versiones anteriores de Biopython y NumPy (Biopython depende de él) se eliminarán antes de instalar las versiones recientes.

Step 3 - Verificación de la instalación de Biopython

Ahora, ha instalado Biopython con éxito en su máquina. Para verificar que Biopython esté instalado correctamente, escriba el siguiente comando en su consola de Python:

Muestra la versión de Biopython.

Alternate Way − Installing Biopython using Source

Para instalar Biopython usando el código fuente, siga las instrucciones a continuación:

Descargue la versión reciente de Biopython desde el siguiente enlace: https://biopython.org/wiki/Download

A partir de ahora, la última versión es biopython-1.72.

Descargue el archivo y descomprima el archivo comprimido, muévase a la carpeta del código fuente y escriba el siguiente comando:

> python setup.py build

Esto construirá Biopython a partir del código fuente como se indica a continuación:

Ahora, pruebe el código usando el siguiente comando:

> python setup.py test

Finalmente, instale usando el siguiente comando:

> python setup.py install