Biopython - Técnicas de prueba

Biopython tiene un script de prueba extenso para probar el software en diferentes condiciones para asegurarse de que el software esté libre de errores. Para ejecutar el script de prueba, descargue el código fuente de Biopython y luego ejecute el siguiente comando:

python run_tests.py

Esto ejecutará todos los scripts de prueba y dará el siguiente resultado:

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

También podemos ejecutar un script de prueba individual como se especifica a continuación:

python test_AlignIO.py

Conclusión

Como hemos aprendido, Biopython es uno de los software importantes en el campo de la bioinformática. Al estar escrito en python (fácil de aprender y escribir), proporciona una amplia funcionalidad para hacer frente a cualquier cálculo y operación en el campo de la bioinformática. También proporciona una interfaz fácil y flexible para casi todo el software de bioinformática popular para explotar su funcionalidad también.