R - Bazy danych
Dane są Relacyjne systemy baz danych są przechowywane w znormalizowanym formacie. Tak więc, aby wykonać obliczenia statystyczne, będziemy potrzebować bardzo zaawansowanych i złożonych zapytań Sql. Ale R może łatwo łączyć się z wieloma relacyjnymi bazami danych, takimi jak MySql, Oracle, serwer SQL itp. I pobierać z nich rekordy jako ramkę danych. Gdy dane są dostępne w środowisku R, stają się normalnym zestawem danych R i można nimi manipulować lub analizować za pomocą wszystkich potężnych pakietów i funkcji.
W tym samouczku będziemy używać MySql jako naszej referencyjnej bazy danych do łączenia się z R.
Pakiet RMySQL
R ma wbudowany pakiet o nazwie „RMySQL”, który zapewnia natywną łączność między bazą danych MySql. Możesz zainstalować ten pakiet w środowisku R za pomocą następującego polecenia.
install.packages("RMySQL")
Łączenie R z MySql
Po zainstalowaniu pakietu tworzymy obiekt połączenia w R, aby połączyć się z bazą danych. Pobiera nazwę użytkownika, hasło, nazwę bazy danych i nazwę hosta jako dane wejściowe.
# Create a connection Object to MySQL database.
# We will connect to the sampel database named "sakila" that comes with MySql installation.
mysqlconnection = dbConnect(MySQL(), user = 'root', password = '', dbname = 'sakila',
host = 'localhost')
# List the tables available in this database.
dbListTables(mysqlconnection)
Kiedy wykonujemy powyższy kod, daje on następujący wynik -
[1] "actor" "actor_info"
[3] "address" "category"
[5] "city" "country"
[7] "customer" "customer_list"
[9] "film" "film_actor"
[11] "film_category" "film_list"
[13] "film_text" "inventory"
[15] "language" "nicer_but_slower_film_list"
[17] "payment" "rental"
[19] "sales_by_film_category" "sales_by_store"
[21] "staff" "staff_list"
[23] "store"
Zapytania do tabel
Możemy wysyłać zapytania do tabel bazy danych w MySql za pomocą funkcji dbSendQuery(). Zapytanie jest wykonywane w MySql, a zestaw wyników jest zwracany za pomocą Rfetch()funkcjonować. Wreszcie jest przechowywany jako ramka danych w R.
# Query the "actor" tables to get all the rows.
result = dbSendQuery(mysqlconnection, "select * from actor")
# Store the result in a R data frame object. n = 5 is used to fetch first 5 rows.
data.frame = fetch(result, n = 5)
print(data.fame)
Kiedy wykonujemy powyższy kod, daje on następujący wynik -
actor_id first_name last_name last_update
1 1 PENELOPE GUINESS 2006-02-15 04:34:33
2 2 NICK WAHLBERG 2006-02-15 04:34:33
3 3 ED CHASE 2006-02-15 04:34:33
4 4 JENNIFER DAVIS 2006-02-15 04:34:33
5 5 JOHNNY LOLLOBRIGIDA 2006-02-15 04:34:33
Zapytanie z klauzulą filtru
Aby otrzymać wynik, możemy przekazać dowolne prawidłowe zapytanie wybierające.
result = dbSendQuery(mysqlconnection, "select * from actor where last_name = 'TORN'")
# Fetch all the records(with n = -1) and store it as a data frame.
data.frame = fetch(result, n = -1)
print(data)
Kiedy wykonujemy powyższy kod, daje on następujący wynik -
actor_id first_name last_name last_update
1 18 DAN TORN 2006-02-15 04:34:33
2 94 KENNETH TORN 2006-02-15 04:34:33
3 102 WALTER TORN 2006-02-15 04:34:33
Aktualizacja wierszy w tabelach
Możemy zaktualizować wiersze w tabeli MySQL, przekazując zapytanie aktualizujące do funkcji dbSendQuery ().
dbSendQuery(mysqlconnection, "update mtcars set disp = 168.5 where hp = 110")
Po wykonaniu powyższego kodu możemy zobaczyć zaktualizowaną tabelę w środowisku MySql.
Wstawianie danych do tabel
dbSendQuery(mysqlconnection,
"insert into mtcars(row_names, mpg, cyl, disp, hp, drat, wt, qsec, vs, am, gear, carb)
values('New Mazda RX4 Wag', 21, 6, 168.5, 110, 3.9, 2.875, 17.02, 0, 1, 4, 4)"
)
Po wykonaniu powyższego kodu możemy zobaczyć wiersz wstawiony do tabeli w środowisku MySql.
Tworzenie tabel w MySql
Możemy tworzyć tabele w MySql za pomocą funkcji dbWriteTable(). Zastępuje tabelę, jeśli już istnieje, i przyjmuje ramkę danych jako dane wejściowe.
# Create the connection object to the database where we want to create the table.
mysqlconnection = dbConnect(MySQL(), user = 'root', password = '', dbname = 'sakila',
host = 'localhost')
# Use the R data frame "mtcars" to create the table in MySql.
# All the rows of mtcars are taken inot MySql.
dbWriteTable(mysqlconnection, "mtcars", mtcars[, ], overwrite = TRUE)
Po wykonaniu powyższego kodu możemy zobaczyć tabelę utworzoną w środowisku MySql.
Upuszczanie tabel w MySql
Możemy upuścić tabele w bazie danych MySql, przekazując instrukcję drop table do dbSendQuery () w taki sam sposób, w jaki użyliśmy jej do odpytywania danych z tabel.
dbSendQuery(mysqlconnection, 'drop table if exists mtcars')
Po wykonaniu powyższego kodu widzimy, że tabela jest upuszczana w środowisku MySql.