Получить Dockerfile из пакета bioconda

Question

Пакеты Bioconda имеют связанные изображения контейнеров. Например, bioconductor-csawесть изображение quay.io/biocontainers/bioconductor-csaw.

Хотелось бы настроить изображение, в частности, добавить rstudio.

Можно ли связать Dockerfile с образом пакета bioconda?

Как вы предлагаете приступить к настройке изображения?

Answer 1

Dockerfile создается galaxy-utils, поэтому я не совсем уверен, как он выглядит. Однако вы должны иметь возможность сгенерировать такой "многомерный" контейнер, как описано здесь . Короче, что-то вроде:

mulled-build build 'bioconductor-csaw=someversion--somebuildnumber' 'someotherpackage=someversion--somebuildnumber' ...

Вероятно, для этого потребуется установить переменную среды CONDA_IMAGE. В настоящее время Bioconda устанавливает это значение quay.io/dpryan79/mulled_container:latest.