मोल्डन प्रारूप में लिखी गई कक्षीय जानकारी से इलेक्ट्रॉनिक घनत्व की गणना / कल्पना करना
मैं सूत्र द्वारा मोल्डेन प्रारूप में लिखी गई कक्षीय जानकारी से इलेक्ट्रॉन घनत्व प्राप्त करने की कोशिश कर रहा हूं, $$ \rho(\mathbf{r}) = \sum_{i}^{occ} |\phi_{i}(\mathbf{r})|^{2}. \tag{1} $$
क्या इस नौकरी को संभालने के लिए कोई पोस्ट-प्रोसेसिंग प्रोग्राम है?
मुझे विश्वास है कि मैं अपने दम पर एक स्क्रिप्ट बना सकता हूं, क्योंकि मोल्डन फ़ाइल जीटीओ के गुणांक प्रदान करती है, लेकिन यह जांचना चाहती है कि क्या पहले से ही काम कर रहे उदाहरण हैं।
यह वांछनीय होगा कि अंतिम घनत्व फ़ंक्शन डेटा सामान्य विज़ुअलाइज़ेशन सॉफ़्टवेयर (जैसे कि मोल्डन, वीएमडी, आदि) के साथ संगत प्रारूप में है, लेकिन मुझे लगता है कि यह कल्पना की जा सकती है यदि इसे 3 डी ग्रिड में दर्शाया जाए।
जवाब
मैं अत्यधिक cclib की सलाह देता हूं जो मोल्डन को पढ़ सकता है और घनत्व की गणना कर सकता है।
जब मैंने उनका उपयोग नहीं किया है, तो मुझे पूरा यकीन है कि आप ऐसा कर सकते हैं:
- ऑर्बिटक
- होर्टन
निस्संदेह अन्य उपकरण हैं - मोल्डेन क्वांटम रासायनिक इंटरचेंज के लिए एक सुंदर मानक प्रारूप है।