Como resolver o TypeError cif2cell?

Question

Encontrei um erro ao usar cif2cell ao cobrir um arquivo CIF de COD para o formato quântico ESPRESSO. O erro é o seguinte.

comando digitado: $cif2cell crystal.cif -p quantum-espresso -o crystal.in

***Aviso: A verificação da operação do grupo espacial falhou para o símbolo Hall -P 1 (símbolo HM P-1). ***Aviso: Ocupações do site não encontradas, assumindo que todas as ocupações = 1. Traceback (última chamada mais recente): Arquivo “/usr/local/bin/cif2cell”, linha 1574, em docstring = StandardDocstring() Arquivo “/usr/ local/bin/cif2cell”, linha 1021, em StandardDocstring tmpstring2 += “. Número de referência: “+ref.databasecode TypeError: deve ser str, não NoneType

Isso parece ser um bug na plataforma Quantum Mobile também.

Answer 1

Existe uma maneira de contornar isso, você pode incluir um código de banco de dados NULL [usando a palavra-chave _cod_database_code ] sob a palavra-chave data_global em CIF e funcionará.

exemplo:

data_global
_cod_database_code               None

Isso funcionou para mim. Como o cod_databse_code é apenas para imprimir os primeiros comentários no arquivo de entrada criado pelo cif2cell, ele resolverá o problema sem afetar as informações do cristal que pretendemos fornecer.