Erro Pyspark S3: java.lang.NoClassDefFoundError: com / amazonaws / services / s3 / model / MultiObjectDeleteException

Oct 27 2020

Falha ao configurar um cluster spark que pode ler arquivos AWS s3. Os softwares que usei são os seguintes:

  1. hadoop-aws-3.2.0.jar
  2. aws-java-sdk-1.11.887.jar
  3. spark-3.0.1-bin-hadoop3.2.tgz

Usando a versão Python: Python 3.8.6

from pyspark.sql import SparkSession, SQLContext
from pyspark.sql.types import *
from pyspark.sql.functions import *
import sys

spark = (SparkSession.builder
         .appName("AuthorsAges")
         .appName('SparkCassandraApp')
         .getOrCreate())


spark._jsc.hadoopConfiguration().set("fs.s3a.access.key", "access-key")
spark._jsc.hadoopConfiguration().set("fs.s3a.secret.key", "secret-key")
spark._jsc.hadoopConfiguration().set("fs.s3a.impl","org.apache.hadoop.fs.s3a.S3AFileSystem")
spark._jsc.hadoopConfiguration().set("com.amazonaws.services.s3.enableV4", "true")
spark._jsc.hadoopConfiguration().set("fs.s3a.aws.credentials.provider","org.apache.hadoop.fs.s3a.BasicAWSCredentialsProvider")
spark._jsc.hadoopConfiguration().set("fs.s3a.endpoint", "")


input_file='s3a://spark-test-data/Fire_Department_Calls_for_Service.csv'

file_schema = StructType([StructField("Call_Number",StringType(),True),
        StructField("Unit_ID",StringType(),True),
        StructField("Incident_Number",StringType(),True),
...
...
# Read file into a Spark DataFrame
input_df = (spark.read.format("csv") \
            .option("header", "true") \
            .schema(file_schema) \
            .load(input_file))

O código falha quando começa a executar o spark.read.format. Parece que ele não consegue encontrar a classe. java.lang.NoClassDefFoundError: com.amazonaws.services.s3.model.MultiObjectDeleteException

  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/local/spark/spark-3.0.1-bin-hadoop3.2/python/pyspark/sql/readwriter.py", line 178, in load
    return self._df(self._jreader.load(path))
  File "/usr/local/spark/spark-3.0.1-bin-hadoop3.2/python/lib/py4j-0.10.9-src.zip/py4j/java_gateway.py", line 1304, in __call__
  File "/usr/local/spark/spark-3.0.1-bin-hadoop3.2/python/pyspark/sql/utils.py", line 128, in deco
    return f(*a, **kw)
  File "/usr/local/spark/spark-3.0.1-bin-hadoop3.2/python/lib/py4j-0.10.9-src.zip/py4j/protocol.py", line 326, in get_return_value
py4j.protocol.Py4JJavaError: An error occurred while calling o51.load.
: java.lang.NoClassDefFoundError: com/amazonaws/services/s3/model/MultiObjectDeleteException
    at java.lang.Class.forName0(Native Method)
    at java.lang.Class.forName(Class.java:348)
    at org.apache.hadoop.conf.Configuration.getClassByNameOrNull(Configuration.java:2532)
    at org.apache.hadoop.conf.Configuration.getClassByName(Configuration.java:2497)
    at org.apache.hadoop.conf.Configuration.getClass(Configuration.java:2593)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.getFileSystemClass(FileSystem.java:3269)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.createFileSystem(FileSystem.java:3301)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.access$200(FileSystem.java:124) at org.apache.hadoop.fs.FileSystem$Cache.getInternal(FileSystem.java:3352)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem$Cache.get(FileSystem.java:3320) at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.get(FileSystem.java:479) at org.apache.hadoop.fs.Path.getFileSystem(Path.java:361) at org.apache.spark.sql.execution.streaming.FileStreamSink$.hasMetadata(FileStreamSink.scala:46)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.DataSource.resolveRelation(DataSource.scala:366)
    at org.apache.spark.sql.DataFrameReader.loadV1Source(DataFrameReader.scala:297)
    at org.apache.spark.sql.DataFrameReader.$anonfun$load$2(DataFrameReader.scala:286) at scala.Option.getOrElse(Option.scala:189) at org.apache.spark.sql.DataFrameReader.load(DataFrameReader.scala:286) at org.apache.spark.sql.DataFrameReader.load(DataFrameReader.scala:232) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62) at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43) at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498) at py4j.reflection.MethodInvoker.invoke(MethodInvoker.java:244) at py4j.reflection.ReflectionEngine.invoke(ReflectionEngine.java:357) at py4j.Gateway.invoke(Gateway.java:282) at py4j.commands.AbstractCommand.invokeMethod(AbstractCommand.java:132) at py4j.commands.CallCommand.execute(CallCommand.java:79) at py4j.GatewayConnection.run(GatewayConnection.java:238) at java.lang.Thread.run(Thread.java:748) Caused by: java.lang.ClassNotFoundException: com.amazonaws.services.s3.model.MultiObjectDeleteException at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:382) at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:418) at sun.misc.Launcher$AppClassLoader.loadClass(Launcher.java:352)
    at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:351)

Tenho tentado encontrar a combinação certa para os potes acima e python, mas não consegui encontrar a combinação certa. Estou recebendo todos os tipos de NoClassDefFoundError, então decidi usar as versões mais recentes de todos os jars e python que listei acima, mas ainda sem sucesso.

Gostaria de saber quais versões de jars e python você usou para configurar com êxito um cluster que é capaz de acessar s3 usando s3a via pyspark? Obrigado antecipadamente pela resposta / ajuda.

Respostas

1 stevel Oct 30 2020 at 15:02

O Hadoop 3.2 foi construído contra 1.11.563; coloque o sdk sombreado completo dessa versão específica em seu classpath "aws-java-sdk-bundle" e tudo ficará bem.

O SDK era "exigente" no passado ... e a atualização invariavelmente causa surpresas. Para o curioso Qualificando uma atualização do SDK da AWS . Provavelmente é hora de alguém fazer isso de novo.

1 PrateekDubey Oct 31 2020 at 19:02

Consegui resolver esse problema no Spark 3.0 / Hadoop 3.2. Documentei minha resposta aqui também - AWS EKS Spark 3.0, Hadoop 3.2 Error - NoClassDefFoundError: com / amazonaws / services / s3 / model / MultiObjectDeleteException

Use o seguinte pacote AWS Java SDK e este problema será resolvido -

aws-java-sdk-bundle-1.11.874.jar (https://mvnrepository.com/artifact/com.amazonaws/aws-java-sdk-bundle/1.11.874)

banjoman Oct 27 2020 at 23:04

Então, limpei tudo e reinstalei as seguintes versões dos jars e funcionou: hadoop-aws-2.7.4.jar, aws-java-sdk-1.7.4.2.jar. Versão de instalação do Spark: spark-2.4.7-bin-hadoop2.7. Versão Python: Python 3.6.