MeshFunction em SmoothDensityHistogram

Oct 22 2020

Eu gostaria de fazer um SmoothDensityHistogramde um conjunto de dados onde também possa visualizar o nível de probabilidade dentro de certas regiões (concêntricas). Aqui está o código:

somePoints = 
  RandomReal[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, .8], 1000];

SmoothDensityHistogram[somePoints,
 Automatic, "PDF",
 ColorFunction -> "DarkBands",
 BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
 FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]],
 ImageSize -> 800,
 AspectRatio -> 0.5,
 PlotRange -> All,
 MeshStyle -> Black,
 Mesh -> 5]

O problema que tenho é indicar a probabilidade circundada por cada linha de malha diretamente com um rótulo no gráfico (semelhante ao que ContourPlotfaz). Estou procurando, MeshFunctionmas não consigo chegar aos resultados que estou procurando. Idealmente, também sou capaz de decidir as linhas de malha que são traçadas (por exemplo, correspondendo a probabilidades de 60% e 80%).

EDIT
Eu também tentei a abordagem descrita aqui:

Linhas de contorno sobre SmoothDensityHistogram

funciona bem para identificar as linhas da malha. No entanto, ainda não consigo descobrir como rotulá-los de acordo com a probabilidade de que eles circundam (20, 40, 60 e 80% no exemplo):

  RandomReal[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, .8], 1000];
d = SmoothKernelDistribution[somePoints];

Show[SmoothDensityHistogram[somePoints,
  Automatic, "PDF",
  ColorFunction -> "DarkBands",
  BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
  FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]],
  ImageSize -> 800,
  AspectRatio -> 0.5,
  PlotRange -> All,
  MeshStyle -> Black,
  Mesh -> 0],
 
 ContourPlot[PDF[d, {x, y}], {x, -4, 4}, {y, -5, 5},
  PlotRange -> All,
  Contours -> 
   Function[{min, max}, 
    Rescale[{0.2, 0.4, 0.6, 0.8}, {0, 1}, {min, max}]],
  ContourShading -> None,
  ContourStyle -> {{Black, AbsoluteThickness[3]}}]]

Respostas

3 JimB Oct 22 2020 at 05:21

Combinando os dois links nos comentários, pode-se fazer o seguinte:

(* Generate some data *)
SeedRandom[12345];
somePoints = RandomVariate[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, 0.8], 1000];

(* Construct smooth kernel distribution *)
d = SmoothKernelDistribution[somePoints];

(* Find the pdf values on a fine grid and sort by value of pdf *)
pdf = Reverse[Sort[Flatten[Table[PDF[d, {x, y}], {x, -7, 3, 0.05}, {y, -3, 6, 0.05}]]]];
(* Obtain cdf of those values *)
cdf = Accumulate[pdf]/Total[pdf];

(* Give labels for probabilities of interest *)
probabilities = {"0.2", "0.4", "0.6", "0.8"};

(* Determine contours associated with each probability *)
contours = pdf[[Flatten[Table[FirstPosition[cdf, p_ /; p >= alpha], {alpha, ToExpression[probabilities]}]]]];

(* Construct link between the contours and the probability labels along with the desired style of text *)
link = AssociationThread[contours -> probabilities];
f = Text[Style[link[#3], 15, Bold, Red], {#1, #2}] &;

(* Plot results *)
Show[SmoothDensityHistogram[somePoints, Automatic, "PDF", ColorFunction -> "DarkBands",
  BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
  FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]], ImageSize -> 800,
  AspectRatio -> 0.5, PlotRange -> All, MeshStyle -> Black, Mesh -> 0],
 ContourPlot[PDF[d, {x, y}], {x, -7, 3}, {y, -3, 6}, PlotRange -> All,
  Contours -> contours, ContourLabels -> f, ContourShading -> None,
  ContourStyle -> {{Black, AbsoluteThickness[3]}}]]