अन्य चचेरे भाइयों के आपसी संबंधों के आधार पर केवल चचेरे भाई से संबंध का निर्धारण

Aug 17 2020

पृष्ठभूमि

मैं 23andMe.com पर वंशावली पर शोध कर रहा हूं, नए चचेरे भाइयों को खोजने और मेरे लिए उनके रिश्तों को निर्धारित करने की कोशिश कर रहा हूं। सभी साइट मुझे देती है लोगों की एक सूची और मेरे लिए उनके चचेरे भाई-रिश्ते की भविष्यवाणी (एक CSV फ़ाइल के रूप में डाउनलोड करने योग्य), एक पृष्ठ के साथ जहां मैं हमारे बीच आम रिश्तेदारों की सूची देख सकता हूं और उनके साथ उनके पूर्वानुमानित रिश्ते की तुलना कर सकता हूं (डाउनलोड करने योग्य नहीं, उदाहरण के लिए व्यक्ति X के पृष्ठ पर यह कहा जाएगा, "व्यक्ति Y-- आप: 2 चचेरे भाई, X: 3 चचेरे भाई")। दुर्भाग्य से, मेरी संस्कृति में, ऐतिहासिक रूप से भेदभाव के कारण एक महत्वपूर्ण मात्रा में एंडोगैमी है, इसलिए "दूर के चचेरे भाई" का मतलब शायद 10 वीं + चचेरे भाई, या अधिक हो सकता है। अपने उद्देश्यों के लिए, मैं इसे असंबंधित मतलब के लिए लेता हूं। यह सबसे अच्छा मैं कर सकता हूं, यह देखते हुए कि 23andMe किसी दिए गए व्यक्ति के संबंध में सभी सामान्य रिश्तेदारों के संरचित डेटा सेट तक पहुंच नहीं देता है, जिससे किसी अन्य रिश्तेदार के रिश्तेदार की कमी के आधार पर सत्तारूढ़ संबंधित संभावना की संभावना को दूर किया जा सकता है। आम रिश्तेदारों ने सेट किया। इसलिए, यदि मैं व्यक्ति Z की प्रोफ़ाइल पर देखता हूं कि वे मेरे पिता की तरफ से मेरे कई चचेरे भाइयों के लिए दूर के चचेरे भाई हैं, और वे व्यक्ति के 3 जी चचेरे भाई हैं, जिनके बारे में मैं अनिश्चित हूं, तो मैं यह कारण बताऊंगा कि व्यक्ति Z अपनी मां की तरफ है , जैसा व्यक्ति ए।

मुसीबत

सूचना के बारे में तर्क के रूप में "यदि आप X के साथ 2 चचेरे भाई हैं और Y, Z, A, और B के साथ दूर हैं, और X C के साथ 3rd चचेरे भाई हैं, D के साथ 4th, और E के साथ दूर हैं, तो शायद कनेक्शन ... "अत्यधिक कठिन हो गया है और परिणामों के एक smidgeon का उत्पादन नहीं किया है।

सवाल

क्या एक चचेरे भाई के लिए सटीक व्यक्ति-से-व्यक्ति के संबंध को पूरी तरह से निर्धारित करना संभव है, जो पारस्परिक चचेरे भाई बनाम आपके रिश्ते के लिए आपसी चचेरे भाई, और उन चचेरे भाइयों से अन्य चचेरे भाई, आदि के संबंध पर आधारित है? यदि हां, तो कोई व्यक्ति संबंध का निर्धारण कैसे करेगा?

यदि यह स्पष्ट नहीं था, तो यहां एक उदाहरण है प्रश्न का वर्णन करने के लिए:

मान लीजिए कि मैं और 3 चचेरे भाई एक्स नहीं जानते कि हम कैसे संबंधित हैं, लेकिन शेयर चचेरे भाई ए: एक्स ए के साथ 2 चचेरे भाई हैं, मैं ए के साथ 4 वें चचेरे भाई हूं। साझा चचेरे भाई बी के साथ एक्स भी 3 चचेरे भाई हैं, और बी 2 चचेरे भाई हैं (साझा) चचेरे भाई के साथ, जो मुझे पता है कि मेरे पिता की तरफ से मेरा दूसरा चचेरा भाई है, आदि इस प्रक्रिया से पर्याप्त समय गुजरता है और जानकारी को दस्तावेजीकरण करता है जैसे मैं जाता हूं या एक पेड़ पर इसे रेखांकन करते हुए, क्या मैं यह घटा सकता हूं, उदाहरण के लिए, चचेरे भाई एक्स मेरे पैतृक दादी के चचेरे भाई होने चाहिए? संभव है कि? मैं वह कैसे कर सकता हूं?

अब तक की प्रगति

कभी-कभी आप जो कुछ भी करते हैं उससे अधिक नहीं जानते हैं कि आप क्या करते हैं, और अक्सर यह भविष्य के अनुसंधान की दिशा को स्पष्ट करता है जब आप जो नहीं जानते उस पर स्पष्ट हो जाते हैं, इसलिए यहां है

जो मैं नहीं जानता

समस्या पर लंबे समय तक विचार करने के बाद, मेरा निष्कर्ष यह निकला कि निम्नलिखित चार प्रश्न इस बात के दिल में हैं कि क्या इस प्रश्न का उत्तर दिया जा सकता है और यह कैसे किया जाएगा (हो सकता है कि मैं गलत हूं और ये इसके दिल में नहीं हैं) :

मैं यह कैसे निर्धारित करूं कि दो लोग एक ही दादा-दादी से आए हैं?
मैं कैसे निर्धारित करता हूं कि प्रत्येक व्यक्ति उन दादा-दादी से किस तरफ से उतरता है। (यानी एक्स के नाना और वाई के नाना)?
मैं उन रिश्तों पर नज़र कैसे रखूँ (विशेष रूप से महत्वपूर्ण अगर मैं इसे करने के लिए एक कार्यक्रम लिखूँ)?
सामान्य तौर पर, आप लोगों के चचेरे भाई के रिश्ते को जानने से वास्तव में कितना निर्धारित कर सकते हैं? क्या इनमें से कोई भी चीज निर्धारित करना संभव है?

मुझे क्या पता

मैंने अब तक क्या निर्धारित किया है:

दिया गया: A, C का nth चचेरा भाई है और B, C का nth चचेरा भाई है

आत्मविश्वास से कहना है कि A, B, और C एक ही nth-great-grandparents साझा करते हैं: A और B को एक दूसरे के साथ nth cousins भी होना चाहिए।

लेकिन शायद ही कभी ऐसा होता है, और इस तरह, यह नियम मुझे बहुत दूर नहीं ले जाता है। यह अभी भी मददगार नहीं है क्योंकि यह नहीं समझाता है कि यह निर्धारित कैसे किया जाए कि आम दादा-दादी किस पक्ष से हैं।

समाधान की एकरसता कोई बाधा नहीं है

भले ही मेरे प्रश्न का उत्तर एक ऐसी विधि है जिसमें बहुत परीक्षण और त्रुटि, एकरसता, आदि शामिल है, जब तक कि यह कठोर तरीके से (गणितीय प्रकार की समझ में), जैसे कि उस समय का 100% काम करेगा जब इसका अनुसरण किया जाता है अंत तक, मैं इसे एक कंप्यूटर को सिखा सकता हूं और उन परिणामों को अपने हाथ से बने ग्राफ जनरेटिंग प्रोग्राम में भेज सकता हूं, इसके लिए कोड की कुछ पंक्तियों को कॉल करके:

    graph.addEdge("Grandmother #1" ,"Father #1")
    graph.addEdge("Grandmother #1", "Father #2")
    graph.addEdge("Grandmother #1", "Childless #3")
    graph.addEdge("Father #1", "Jimmy")
    graph.addEdge("Father #2", "Sally")
    graph.addEdge("Jimmy","Son #1")
    graph.addEdge("Jimmy","Son #2")
    graph.addEdge("Jimmy","Son #3")

यह वही है जो उपरोक्त पंक्तियाँ बनाता है:

कभी-कभी "100% काम करना" का अर्थ होगा यह निर्धारित करना कि कुछ निर्धारित नहीं किया जा सकता है। ठीक है। मैं यह मान लेना चाहूंगा कि पर्याप्त क्रॉस-रेफ़रिंग के साथ, पूरी तस्वीर का पता लगाया जा सकता है। मुझे लगता है कि यह कार्यक्रम कई लोगों के लिए उपयोगी होगा, इसलिए यदि मुझे इसे बनाने में मदद मिलती है तो मैं इसे वितरित करना पसंद करूंगा ताकि अन्य लोग इससे लाभान्वित हो सकें।
पुनश्च: मैंने कुछ लिखा

जवाब

1 PeterKühne Aug 18 2020 at 08:59

ऐसा लगता है कि डीएनए पेंटर क्या अजीब हैं ( वाट ) उपकरण मदद की हो सकती है। यह आपको यह पता लगाने में मदद करता है कि एक लक्षित व्यक्ति ऐसे अन्य लोगों के समूह से कैसे संबंधित है, जिनके संबंध पहले से ही ज्ञात हैं, जो उनके डीएनए पर आधारित है। आप इसके बारे में और अधिक यहाँ पढ़ सकते हैं ।

एक संस्करण 2 भी है जो वर्तमान में बीटा में है, लेकिन मैं इसमें नई सुविधाओं के लिए बात नहीं कर सकता।

1 cleaverkin Aug 18 2020 at 18:35

यद्यपि वाटो पेड़ों को आपकी सबसे अच्छी आशा के रूप में (मेरे सहित) सुझाव दिया गया है, मुझे विश्वास नहीं है कि यहां तक कि वे आपके द्वारा प्रस्तावित प्रस्ताव के लिए पर्याप्त होंगे। मैं यहाँ तक दावा करूँगा कि यह केवल डीएनए मिलान डेटा का उपयोग करके मज़बूती से नहीं किया जा सकता है। एक बार जब आप माता-पिता / बच्चे, भाई-बहन, और शायद 1 चचेरे भाई के करीबी रिश्तों से परे हो जाते हैं, तो कई संभावित रिश्ते हैं जो समान रूप से उनके बीच अंतर करने के लिए एक ही सीएम रेंज साझा करते हैं।

मान लीजिए कि आप अपने उदाहरण में एक पेड़ का निर्माण करने वाले थे, तो प्रत्येक नमूना जोड़ी (एन / 2 तुलना) की एक जोड़ीदार तुलना करें और साझा सीएम टूल (और, बीटीडब्ल्यू) का उपयोग करके संभावनाओं को देखें, यदि आप कुछ लागू कर सकते हैं यह स्वचालित रूप से होता है, आप शायद इसे बेच सकते हैं)। जैसे ही नमूनों की संख्या बढ़ती है, समग्र वृक्ष में त्रुटि की संभावना तेजी से बढ़ती है, और जबकि पेड़ में गलत प्लेसमेंट के लिए उम्मीदवारों को निर्धारित करना संभव हो सकता है, तो आप कभी भी निश्चित नहीं हो सकते हैं कि आपकी उच्चतम संभावना परिकल्पना किसी भी सटीक रूप से दर्शाती है निकालता है या आधे चचेरे भाई (या डबल चचेरे भाई - अगर, जैसा कि आप कहते हैं, आपकी संस्कृति में बहुत कुछ है, तो सभी मैच संदिग्ध हैं)।

यही कारण है कि डीएनए वंशावली को पारंपरिक "पेपर ट्रेल" अनुसंधान के प्रतिस्थापन के रूप में कभी भी अनुशंसित नहीं किया गया है, क्योंकि यह कम से कम भविष्य में नहीं हो सकता है। यहां तक कि क्रोमोसोम ब्राउज़रों और नमूनों में सेगमेंट के अनुरेखण के साथ, आप वास्तव में साबित कर सकते हैं कि आम पूर्वजों के पास कौन है, और संभवतः कितनी दूर है।

मुझे एहसास है कि मेरे औचित्य से मेरे सहयोगियों और मैं "कल्पना की कमी से प्रमाण" कह सकता हूं, (जैसा कि "मैं कल्पना नहीं कर सकता कि यह संभवतः कैसे काम कर सकता है"), इसलिए यदि कोई भी मेरे तर्क में एक महत्वपूर्ण दोष को इंगित कर सकता है , कृपया ऐसा करें (यह किसी और के रूप में मेरी मदद करता है)।