Como excluir uma seleção com Avogadro2 (Ubuntu 20.x)?
Por motivos que não entendi, o Avogadro foi retirado do Ubuntu 20.xe o pacote disponível Avogadro2é outro ramo do pacote, que infelizmente não cobre todos os recursos. Como parece impossível instalar aquela versão mais antiga, porém mais poderosa, do Avogadro no último Ubuntu, alguém sabe se ainda é possível deletar átomos selecionados? Estou realmente surpreso que um recurso tão básico tenha sido "perdido".
Basicamente, você pode clicar e selecionar átomos (embora eles não apareçam selecionados para nenhum estilo de exibição, exceto "bola e pau"), mas se você pressionar CANCELAR, o modelo inteiro será excluído (todos os átomos). Eu estava usando muito esse recurso para manipular estruturas via GUI e agora não posso continuar a menos que use minha distribuição Ubuntu mais antiga.
Respostas
Sim, eu vi sua postagem no fórum - não tenho certeza por que esse commit não apareceu, mas eu tenho um pull-request agora.
O longo e o curto é que, enquanto as principais "entranhas" de Avogadro 2 estão terminadas, há um monte de pequenas peças que precisam ser feitas (caso em questão). A ajuda é sempre bem-vinda - há muitas tarefas que podem ser realizadas em poucas horas para qualquer pessoa interessada.
Nesse ínterim, encontrei algumas soluções e estou listando-as aqui para outros usuários, já que, francamente, poucos pacotes permitem selecionar átomos e excluí-los facilmente (via mouse).
você pode usar
chimera, pois oferece o mesmo recurso por meio de CTRL + mouse:https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/data/downloads/1.15/linux_x86_64.html e, em seguida, menu Ações -> Átomos / Ligações -> excluir.se ainda quiser usar
avogadro2no Linux, você pode excluir os átomos um por um clicando com o botão direito no modo "Desenhar":https://discuss.avogadro.cc/t/delete-some-atoms-in-a-supercell/341/2