Plote várias linhas de série temporal em 3D com ggplot / plotly

Nov 16 2020

Eu tenho um quadro de dados contendo diferentes sinais de série temporal que estou tentando plotar em 3D, com o eixo x representando o tempo, o eixo Y representando um valor padronizado para todas as linhas e o eixo Z mostrando cada linha . Aqui está um exemplo do que quero dizer.

Eu tenho um trecho de código que estou tentando configurar agora para gerá-lo corretamente, mas não tenho certeza de como atribuir corretamente as variáveis ​​y e z. O df contém 5 colunas; Tempo + 4 sinais de série temporal diferentes.

plot_ly(
  data = df,
  x = df$Time,
  y = scale(df),
  z = names(df),
  type = 'scatter3d',
  mode = 'lines',
  color = c('red', 'blue', 'yellow', 'green'))

Dataframe é assim:

      Time       coup.nu          Coup.nuti       coup.Ca       coup.B
1  198.001  0.0002630826       0.0003027965  2.141347e-07            1
2  198.002  0.0002630829       0.0003027953  2.141379e-07            1
3  198.003  0.0002630833       0.0003027940  2.141412e-07            1
4  198.004  0.0002630836       0.0003027928  2.141444e-07            1
5  198.005  0.0002630840       0.0003027916  2.141477e-07            1

Estou tentando usar plotly ou ggplot para executar a renderização. Obrigado pela ajuda!

Eu obtive isso de: https://www.r-bloggers.com/2016/06/3d-density-plot-in-r-with-plotly/

Respostas

ismirsehregal Nov 18 2020 at 08:19

Em um caso como este, você deve reformatar seus dados de uma largura para outra usando, por exemplo melt:

library(plotly)
library(reshape2)

DF <- data.frame(
        Time = c(198.001, 198.002, 198.003, 198.004, 198.005),
     coup.nu = c(0.000263083,0.000263083,0.000263083, 0.000263084,0.000263084),
   Coup.nuti = c(0.000302797,0.000302795,0.000302794, 0.000302793,0.000302792),
     coup.Ca = c(2.14e-07, 2.14e-07, 2.14e-07, 2.14e-07, 2.14e-07),
      coup.B = c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L)
)
DF_long <- melt(DF, id.vars=c("Time"))

plot_ly(
  data = DF_long,
  type = 'scatter3d',
  mode = 'lines',
  x = ~ Time,
  y = ~ value,
  z = ~ variable,
  color = ~ variable,
  colors = c('red', 'blue', 'yellow', 'green'))

Se você quiser evitar a remodelagem, data.framepoderá usar add_tracepara adicionar um novo traço para cada coluna de seus dados.