bash mengekstrak baris pertama dari tabel [duplikat]

Question

Pertanyaan kedua untuk ancaman file log untuk pola tabel. Saya berurusan dengan analisis sejumlah besar file teks dlg yang terletak di dalam workdir. Setiap file memiliki tabel (biasanya terletak di ujung log) dalam format berikut:

 RMSD TABLE
    __________


_____________________________________________________________________
     |      |      |           |         |                 |
Rank | Sub- | Run  | Binding   | Cluster | Reference       | Grep
     | Rank |      | Energy    | RMSD    | RMSD            | Pattern
_____|______|______|___________|_________|_________________|___________
   1      1      7       -1.43      0.00    178.12           RANKING
   1      2     18       -0.96      1.88    177.35           RANKING
   2      1      4       -0.97      0.00    178.43           RANKING
   3      1     13       -0.60      0.00    178.03           RANKING
   4      1      5       -0.56      0.00    198.10           RANKING
   5      1     16       +0.01      0.00    189.71           RANKING
   6      1      3       +0.06      0.00    176.95           RANKING
   7      1     19       +0.10      0.00    177.27           RANKING
   8      1     17       +0.13      0.00    177.60           RANKING
   9      1      8       +0.20      0.00    177.05           RANKING
  10      1     20       +0.27      0.00    177.43           RANKING
  11      1     10       +0.34      0.00    176.33           RANKING
  12      1      6       +0.37      0.00    177.30           RANKING
  13      1      9       +0.44      0.00    175.48           RANKING
  14      1      2       +0.46      0.00    175.67           RANKING
  15      1     11       +0.84      0.00    177.52           RANKING
  15      2     12       +1.31      1.95    178.03           RANKING
  16      1     14       +1.29      0.00    201.01           RANKING
  17      1     15       +1.65      0.00    175.50           RANKING
  18      1      1       +1.96      0.00    186.83           RANKING

Run time 3.909 sec
Idle time 0.817 sec

Tujuannya adalah untuk mengulang semua file .dlg dan mengambil satu baris dari tabel yang sesuai dengan baris pertamanya (mengabaikan header) menghapus kolom terakhir (biasanya disediakan untuk pengenalan grep). Pada contoh di atas dari tabel ini adalah baris ketiga.

      1      1      7       -1.43      0.00    178.12

Kemudian saya perlu menambahkan baris ini ke final_log.txt bersama dengan nama file log (yang harus ditentukan sebelumnya). Berdasarkan pengalaman saya baru-baru ini, model yang mungkin untuk alur kerja BASH saya (untuk ancaman beberapa file) mungkin:

#!/bin/bash
#name of the folder containing all *.dlg filles to be analysed
prot='7000'
#path to the folder with these *.dlg filles
FILES=$PWD/${prot}/*.dlg
#make a final log
echo 'This is a list of processed filles' > $PWD/final_results.log # we loop over all *.dlg filles in order to extract Clustering Histogram to the final LOG file for f in $FILES
do
  file_name2=$(basename "$f")
  file_name="${file_name2/.dlg}" echo "Processing of $f..."
  # here is an expression for GREP to take the line from the table and save it to >> $PWD/final_results.log
done

Answer 1

bagaimana memulainya - dengan asumsi melongo dengan nextfiledukungan:

gawk '$1~/[[:digit:]]/{ print FILENAME, substr($0,1,match($0,/[[:blank:]]+[^[:blank:]]+$/)-1);nextfile}' *.dlg