Dapatkan Dockerfile dari paket bioconda
Paket bioconda memiliki gambar kontainer yang terkait. Misal bioconductor-csawpunya image quay.io/biocontainers/bioconductor-csaw.
Saya ingin menyesuaikan gambar, khususnya, saya ingin menambahkan rstudio.
Apakah mungkin untuk mendapatkan Dockerfile yang terkait dengan image dari paket bioconda?
Bagaimana saran Anda untuk melanjutkan menyesuaikan gambar?
Jawaban
Dockerfile dihasilkan oleh galaxy-utils, jadi saya tidak sepenuhnya yakin seperti apa tampilannya. Namun, Anda harus dapat membuat wadah "mulled" seperti yang didokumentasikan di sini . Singkatnya, sesuatu dari bentuk:
mulled-build build 'bioconductor-csaw=someversion--somebuildnumber' 'someotherpackage=someversion--somebuildnumber' ...
Itu mungkin membutuhkan pengaturan variabel lingkungan CONDA_IMAGE. Bioconda saat ini menetapkannya menjadi quay.io/dpryan79/mulled_container:latest.