metafor zero variance level 2
Saya mengalami varian nol di level 2 untuk analisis meta 3 level dengan metafor (rma.mv) di mana ukuran efek (esid) dikelompokkan dalam studi (studyid). Ini dataframe saya:
studyid <- c(1,1,1,1,3,3,4,5,5,5,5,6,6,7,7,7,7,7,7,7,7,8,8,9,10,10,10,10,11,11,11,11,12,12,13,13,14,14,
15,15,18,18,18,18,19,19,19,20,20,20,20,21,21,21,21,22,22,22,23,23,23,24,24,25,28,28,28,
29,29,30,30,30,31,32,32,34,34)
esid <- c(1:77)
yi <- c(4.20,2.90,2.70,3.90,1.40,0.80,11.40,5.00,21.50,20.84,28.73,7.40,4.00,1.38,0.47,1.44,0.46,1.63,
0.46,0.67,0.41,9.24,9.27,8.80,27.30,22.83,18.25,20.08,0.94,0.97,0.77,0.88,14.00,10.40,0.52,0.86,
29.39,33.82,15.30,15.92,45.60,63.10,46.40,44.60,0.10,0.11,0.12,0.17,0.26,0.26,0.31,8.20,1.80,
1.70,9.58,10.15,8.05,0.53,18.95,17.44,23.50,12.62,15.62,4.60,35.10,44.85,33.30,13.30,11.90,0.34,
0.35,0.26,0.69,0.50,0.62,23.80,20.40)
vi <- c(2.90,2.20,2.10,3.00,2.00,1.00,11.03,8.49,16.97,20.00,26.06,3.70,4.00,0.47,0.33,0.74,0.36,0.75,
0.33,0.44,0.37,7.60,5.63,8.80,12.01,13.15,14.41,11.57,0.57,0.76,0.43,0.62,3.50,3.00,0.59,0.65,
10.00,11.30,6.20,6.44,23.04,27.68,17.54,13.04,0.22,0.25,0.24,0.17,0.42,0.17,0.28,7.20,2.00,2.10,
10.08,5.30,3.75,0.68,6.70,6.53,5.74,13.91,31.65,4.10,7.54,12.81,5.28,8.20,7.70,0.25,0.28,0.19,
0.56,0.46,0.37,23.10,15.90)
df <- data.frame(authoryr,studyid,esid,yi,vi)
Berikut adalah kode dan keluaran metafor saya:
overall <- rma.mv(yi, vi,
data = df,
level = 95,
method = "REML",
slab = authoryr,
tdist = TRUE,
random = list(~ 1 | esid,
~ 1 | studyid))
summary(overall)
Multivariate Meta-Analysis Model (k = 77; method: REML)
logLik Deviance AIC BIC AICc
-229.2872 458.5745 464.5745 471.5667 464.9078
Variance Components:
estim sqrt nlvls fixed factor
sigma^2.1 0.0000 0.0000 77 no esid
sigma^2.2 147.3645 12.1394 28 no studyid
Test for Heterogeneity:
Q(df = 76) = 1930.1990, p-val < .0001
Model Results:
estimate se tval pval ci.lb ci.ub
10.7087 2.3165 4.6229 <.0001 6.0951 15.3224 ***
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Inspeksi visual dari ukuran efek mentah menunjukkan adanya perbedaan dalam studi jadi saya tidak yakin apa yang salah dengan data (atau kode) saya. Saya menghargai panduan apa pun tentang solusi dari komunitas.
Jawaban
Ada perbedaan yang sangat besar di antara studi, tetapi perkiraan dalam studi tidak bervariasi lebih dari yang diharapkan berdasarkan variabilitas pengambilan sampel mereka saja. Lihat:
forest(overall, efac=c(0,0.5))
abline(h=nrow(df) - cumsum(rle(df$studyid)$length) + 0.5, lty="dotted")
Jadi tampaknya sangat masuk akal bagi saya bahwa estimasi varians antar-studi sangat besar sedangkan estimasi varians dalam studi pada dasarnya adalah 0.