¿Cómo calcular RMSD con GLIDE?

Aug 24 2020

Necesito calcular el RMSD entre un ligando cocristalizado y mis ligandos y un ligando no cocristalizado con GLIDE, pero no sé cómo. ¿Alguien podría explicarme cómo hacerlo? Muchas gracias de antemano.

Respuestas

3 Camps Aug 25 2020 at 02:10

El software GLIDE no se utiliza para el cálculo de RMSD. GLIDE se dedica al acoplamiento de proteínas/ligandos pequeños (rígido/rígido y flexible/rígido).

Puede calcular el RMSD a mano, utilizando las interfaces MAESTRO, CHIMERA y VMD (todas gratuitas para académicos) entre muchos otros software (también gratuitos).

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