Groupby avec somme sur Julia Dataframe

Oct 06 2020

J'essaie de faire un groupby + sum sur un Julia Dataframe avec des valeurs Int et String

Par exemple, df:

│ Row │ A      │ B      │ C     │ D      │
│     │ String │ String │ Int64 │ String │
├─────┼────────┼────────┼───────┼────────┤
│ 1   │ x1     │ a      │ 12    │ green  │
│ 2   │ x2     │ a      │ 7     │ blue   │
│ 3   │ x1     │ b      │ 5     │ red    │
│ 4   │ x2     │ a      │ 4     │ blue   │
│ 5   │ x1     │ b      │ 9     │ yellow │

Pour ce faire en Python, la commande peut être:

df_group = df.groupby(['A', 'B']).sum().reset_index()

J'obtiendrai le résultat de sortie suivant avec les étiquettes de colonne initiales:

    A  B   C
0  x1  a  12
1  x1  b  14
2  x2  a  11

J'aimerais faire la même chose avec Julia. J'ai essayé de cette façon, sans succès:

df_group = aggregate(df, ["A", "B"], sum)

MethodError: aucune méthode correspondant à + (:: String, :: String)

Avez-vous une idée d'une façon de faire cela avec Julia?

Réponses

2 BogumiłKamiński Oct 06 2020 at 21:12

Essayez (en fait, au lieu de colonnes sans chaîne, vous voulez probablement des colonnes numériques):

numcols = names(df, findall(x -> eltype(x) <: Number, eachcol(df)))
combine(groupby(df, ["A", "B"]), numcols .=> sum .=> numcols)

et si vous souhaitez autoriser les missingvaleurs (et les ignorer lors d'une sommation), alors:

numcols = names(df, findall(x -> eltype(x) <: Union{Missing,Number}, eachcol(df)))
combine(groupby(df, ["A", "B"]), numcols .=> sum∘skipmissing .=> numcols)
2 AndrejOskin Oct 06 2020 at 21:13

Julia DataFrames prend en charge la logique split-apply-combine , similaire aux pandas, donc l'agrégation ressemble

using DataFrames

df = DataFrame(:A => ["x1", "x2", "x1", "x2", "x1"], 
               :B => ["a", "a", "b", "a", "b"],
               :C => [12, 7, 5, 4, 9],
               :D => ["green", "blue", "red", "blue", "yellow"])

gdf = groupby(df, [:A, :B])
combine(gdf, :C => sum)

Avec le résultat

julia> combine(gdf, :C => sum)
3×3 DataFrame
│ Row │ A      │ B      │ C_sum │
│     │ String │ String │ Int64 │
├─────┼────────┼────────┼───────┤
│ 1   │ x1     │ a      │ 12    │
│ 2   │ x2     │ a      │ 11    │
│ 3   │ x1     │ b      │ 14    │

Vous pouvez ignorer la création de gdfà l'aide de Pipe.jl ou Underscores.jl

using Underscores

@_ groupby(df, [:A, :B]) |> combine(__, :C => sum)

Vous pouvez donner un nom à la nouvelle colonne avec la syntaxe suivante

julia> @_ groupby(df, [:A, :B]) |> combine(__, :C => sum => :C)
3×3 DataFrame
│ Row │ A      │ B      │ C     │
│     │ String │ String │ Int64 │
├─────┼────────┼────────┼───────┤
│ 1   │ x1     │ a      │ 12    │
│ 2   │ x2     │ a      │ 11    │
│ 3   │ x1     │ b      │ 14    │