รับ Dockerfile ของแพ็คเกจ bioconda

Sep 16 2020

แพ็คเกจ Bioconda มีรูปภาพคอนเทนเนอร์ที่เกี่ยวข้อง เช่นมีภาพbioconductor-csawquay.io/biocontainers/bioconductor-csaw

ฉันต้องการปรับแต่งภาพโดยเฉพาะฉันต้องการเพิ่ม rstudio

เป็นไปได้ที่จะรับ Dockerfile ที่เชื่อมโยงกับรูปภาพของแพ็คเกจ bioconda หรือไม่?

คุณแนะนำให้ดำเนินการปรับแต่งภาพอย่างไร?

คำตอบ

1 DevonRyan Sep 16 2020 at 15:59

Dockerfile สร้างขึ้นโดย galaxy-utils ดังนั้นฉันไม่แน่ใจว่ามันมีลักษณะอย่างไร แต่คุณควรจะสามารถที่จะสร้างเช่น "mulled ภาชนะ" เป็นเอกสารที่นี่ ในระยะสั้นบางสิ่งในรูปแบบ:

mulled-build build 'bioconductor-csaw=someversion--somebuildnumber' 'someotherpackage=someversion--somebuildnumber' ...

อาจต้องมีการตั้งค่าตัวแปรสภาพแวดล้อม CONDA_IMAGE Bioconda quay.io/dpryan79/mulled_container:latestขณะนี้ชุดที่