MeshFunction en SmoothDensityHistogram

Oct 22 2020

Me gustaría crear un SmoothDensityHistogramconjunto de datos donde también pueda visualizar el nivel de probabilidad dentro de ciertas regiones (concéntricas). Aquí está el código:

somePoints = 
  RandomReal[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, .8], 1000];

SmoothDensityHistogram[somePoints,
 Automatic, "PDF",
 ColorFunction -> "DarkBands",
 BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
 FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]],
 ImageSize -> 800,
 AspectRatio -> 0.5,
 PlotRange -> All,
 MeshStyle -> Black,
 Mesh -> 5]

El problema que tengo es indicar la probabilidad rodeada por cada línea de malla directamente con una etiqueta en el gráfico (similar a lo que ContourPlothace). Estoy investigando MeshFunctionpero no puedo llegar a los resultados que estoy buscando. Idealmente, también puedo decidir las líneas de malla que se trazan (por ejemplo, correspondientes a probabilidades del 60% y 80%).

EDITAR
También probé el enfoque descrito aquí:

Líneas de contorno sobre SmoothDensityHistogram

funciona bien para identificar las líneas de malla. Sin embargo, todavía no puedo averiguar cómo etiquetarlos de acuerdo con la probabilidad de que rodeen (20, 40, 60 y 80% en el ejemplo):

  RandomReal[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, .8], 1000];
d = SmoothKernelDistribution[somePoints];

Show[SmoothDensityHistogram[somePoints,
  Automatic, "PDF",
  ColorFunction -> "DarkBands",
  BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
  FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]],
  ImageSize -> 800,
  AspectRatio -> 0.5,
  PlotRange -> All,
  MeshStyle -> Black,
  Mesh -> 0],
 
 ContourPlot[PDF[d, {x, y}], {x, -4, 4}, {y, -5, 5},
  PlotRange -> All,
  Contours -> 
   Function[{min, max}, 
    Rescale[{0.2, 0.4, 0.6, 0.8}, {0, 1}, {min, max}]],
  ContourShading -> None,
  ContourStyle -> {{Black, AbsoluteThickness[3]}}]]

Respuestas

3 JimB Oct 22 2020 at 05:21

Combinando los dos enlaces en los comentarios, se puede realizar lo siguiente:

(* Generate some data *)
SeedRandom[12345];
somePoints = RandomVariate[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, 0.8], 1000];

(* Construct smooth kernel distribution *)
d = SmoothKernelDistribution[somePoints];

(* Find the pdf values on a fine grid and sort by value of pdf *)
pdf = Reverse[Sort[Flatten[Table[PDF[d, {x, y}], {x, -7, 3, 0.05}, {y, -3, 6, 0.05}]]]];
(* Obtain cdf of those values *)
cdf = Accumulate[pdf]/Total[pdf];

(* Give labels for probabilities of interest *)
probabilities = {"0.2", "0.4", "0.6", "0.8"};

(* Determine contours associated with each probability *)
contours = pdf[[Flatten[Table[FirstPosition[cdf, p_ /; p >= alpha], {alpha, ToExpression[probabilities]}]]]];

(* Construct link between the contours and the probability labels along with the desired style of text *)
link = AssociationThread[contours -> probabilities];
f = Text[Style[link[#3], 15, Bold, Red], {#1, #2}] &;

(* Plot results *)
Show[SmoothDensityHistogram[somePoints, Automatic, "PDF", ColorFunction -> "DarkBands",
  BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
  FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]], ImageSize -> 800,
  AspectRatio -> 0.5, PlotRange -> All, MeshStyle -> Black, Mesh -> 0],
 ContourPlot[PDF[d, {x, y}], {x, -7, 3}, {y, -3, 6}, PlotRange -> All,
  Contours -> contours, ContourLabels -> f, ContourShading -> None,
  ContourStyle -> {{Black, AbsoluteThickness[3]}}]]