bash extraction de la première ligne du tableau [dupliquer]

Question

Une deuxième question pour la menace des fichiers journaux pour les modèles de table. Je traite de l'analyse d'un grand nombre de fichiers texte dlg situés dans le répertoire de travail. Chaque fichier possède une table (généralement située à la fin du journal) au format suivant:

 RMSD TABLE
    __________


_____________________________________________________________________
     |      |      |           |         |                 |
Rank | Sub- | Run  | Binding   | Cluster | Reference       | Grep
     | Rank |      | Energy    | RMSD    | RMSD            | Pattern
_____|______|______|___________|_________|_________________|___________
   1      1      7       -1.43      0.00    178.12           RANKING
   1      2     18       -0.96      1.88    177.35           RANKING
   2      1      4       -0.97      0.00    178.43           RANKING
   3      1     13       -0.60      0.00    178.03           RANKING
   4      1      5       -0.56      0.00    198.10           RANKING
   5      1     16       +0.01      0.00    189.71           RANKING
   6      1      3       +0.06      0.00    176.95           RANKING
   7      1     19       +0.10      0.00    177.27           RANKING
   8      1     17       +0.13      0.00    177.60           RANKING
   9      1      8       +0.20      0.00    177.05           RANKING
  10      1     20       +0.27      0.00    177.43           RANKING
  11      1     10       +0.34      0.00    176.33           RANKING
  12      1      6       +0.37      0.00    177.30           RANKING
  13      1      9       +0.44      0.00    175.48           RANKING
  14      1      2       +0.46      0.00    175.67           RANKING
  15      1     11       +0.84      0.00    177.52           RANKING
  15      2     12       +1.31      1.95    178.03           RANKING
  16      1     14       +1.29      0.00    201.01           RANKING
  17      1     15       +1.65      0.00    175.50           RANKING
  18      1      1       +1.96      0.00    186.83           RANKING

Run time 3.909 sec
Idle time 0.817 sec

Le but est de boucler sur tous les fichiers .dlg et de prendre la seule ligne du tableau correspondant à sa première ligne (en ignorant l'en-tête) en engageant la dernière colonne (normalement fournie pour la reconnaissance de grep). Dans l'exemple ci-dessus du tableau, il s'agit de la troisième ligne.

      1      1      7       -1.43      0.00    178.12

Ensuite, je dois ajouter cette ligne au final_log.txt avec le nom du fichier journal (qui devrait être spécifié avant). Sur la base de mon expérience très récente, un modèle possible pour mon flux de travail BASH (pour la menace de plusieurs fichiers) peut être:

#!/bin/bash
#name of the folder containing all *.dlg filles to be analysed
prot='7000'
#path to the folder with these *.dlg filles
FILES=$PWD/${prot}/*.dlg
#make a final log
echo 'This is a list of processed filles' > $PWD/final_results.log # we loop over all *.dlg filles in order to extract Clustering Histogram to the final LOG file for f in $FILES
do
  file_name2=$(basename "$f")
  file_name="${file_name2/.dlg}" echo "Processing of $f..."
  # here is an expression for GREP to take the line from the table and save it to >> $PWD/final_results.log
done

Answer 1

que diriez-vous de commencer - en supposant que gawk avec le nextfilesupport:

gawk '$1~/[[:digit:]]/{ print FILENAME, substr($0,1,match($0,/[[:blank:]]+[^[:blank:]]+$/)-1);nextfile}' *.dlg