MeshFunction dans SmoothDensityHistogram

Oct 22 2020

Je voudrais faire un SmoothDensityHistogramd'un ensemble de données où je peux également visualiser le niveau de probabilité à l'intérieur de certaines régions (concentriques). Voici le code:

somePoints = 
  RandomReal[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, .8], 1000];

SmoothDensityHistogram[somePoints,
 Automatic, "PDF",
 ColorFunction -> "DarkBands",
 BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
 FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]],
 ImageSize -> 800,
 AspectRatio -> 0.5,
 PlotRange -> All,
 MeshStyle -> Black,
 Mesh -> 5]

Le problème que j'ai est d'indiquer la probabilité encerclée par chaque ligne de maillage directement avec une étiquette sur le graphique (similaire à ce que ContourPlotfait). Je regarde MeshFunctionmais je ne parviens pas aux résultats que je recherche. Idéalement, je suis également capable de décider des lignes de maillage qui sont tracées (par exemple correspondant à des probabilités de 60% et 80%).

EDIT
J'ai également essayé l'approche décrite ici:

Lignes de contour sur SmoothDensityHistogram

cela fonctionne bien pour identifier les lignes de maillage. Cependant, je n'arrive toujours pas à comprendre comment les étiqueter en fonction de la probabilité qu'ils encerclent (20, 40, 60 et 80% dans l'exemple):

  RandomReal[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, .8], 1000];
d = SmoothKernelDistribution[somePoints];

Show[SmoothDensityHistogram[somePoints,
  Automatic, "PDF",
  ColorFunction -> "DarkBands",
  BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
  FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]],
  ImageSize -> 800,
  AspectRatio -> 0.5,
  PlotRange -> All,
  MeshStyle -> Black,
  Mesh -> 0],
 
 ContourPlot[PDF[d, {x, y}], {x, -4, 4}, {y, -5, 5},
  PlotRange -> All,
  Contours -> 
   Function[{min, max}, 
    Rescale[{0.2, 0.4, 0.6, 0.8}, {0, 1}, {min, max}]],
  ContourShading -> None,
  ContourStyle -> {{Black, AbsoluteThickness[3]}}]]

Réponses

3 JimB Oct 22 2020 at 05:21

En combinant les deux liens dans les commentaires, on peut effectuer les opérations suivantes:

(* Generate some data *)
SeedRandom[12345];
somePoints = RandomVariate[BinormalDistribution[{-2, 2}, {1, 1}, 0.8], 1000];

(* Construct smooth kernel distribution *)
d = SmoothKernelDistribution[somePoints];

(* Find the pdf values on a fine grid and sort by value of pdf *)
pdf = Reverse[Sort[Flatten[Table[PDF[d, {x, y}], {x, -7, 3, 0.05}, {y, -3, 6, 0.05}]]]];
(* Obtain cdf of those values *)
cdf = Accumulate[pdf]/Total[pdf];

(* Give labels for probabilities of interest *)
probabilities = {"0.2", "0.4", "0.6", "0.8"};

(* Determine contours associated with each probability *)
contours = pdf[[Flatten[Table[FirstPosition[cdf, p_ /; p >= alpha], {alpha, ToExpression[probabilities]}]]]];

(* Construct link between the contours and the probability labels along with the desired style of text *)
link = AssociationThread[contours -> probabilities];
f = Text[Style[link[#3], 15, Bold, Red], {#1, #2}] &;

(* Plot results *)
Show[SmoothDensityHistogram[somePoints, Automatic, "PDF", ColorFunction -> "DarkBands",
  BaseStyle -> {FontSize -> 34, FontFamily -> "Arial"},
  FrameStyle -> Directive[Black, AbsoluteThickness[3]], ImageSize -> 800,
  AspectRatio -> 0.5, PlotRange -> All, MeshStyle -> Black, Mesh -> 0],
 ContourPlot[PDF[d, {x, y}], {x, -7, 3}, {y, -3, 6}, PlotRange -> All,
  Contours -> contours, ContourLabels -> f, ContourShading -> None,
  ContourStyle -> {{Black, AbsoluteThickness[3]}}]]