Как сгруппировать один столбец, смещенный в разные интервалы, от другого в пандах?
У меня есть следующий pd.DataFrame:
source = pd.DataFrame([[0.99, 0.98, 0.93, 0.81, 0.85, 0.71, 0.7, 0.69, 0.68, 0.66],
[100, 12, 312, 23, 2, 12, 32, 21, 21, 21]]).T
Я хотел бы как можно быстрее преобразовать его в:
desired_result = pd.DataFrame([[0.9, 0.8, 0.7, 0.6], [424, 25, 44, 63]]).T
Где выше, я определяю интервал, 0.1
который я применяю к столбцу 0
к source
фрейму данных и суммирую 1
столбец того же фрейма данных. По идее, это должно работать с разными интервалами.
Что пробовал:
Я думал об использовании,
pd.cut
но, похоже, это не то, что я ищу.Я знаю, что если я добавлю новый столбец
source
с повторяющимися значениями 0,9, 0,8, 0,7 и 0,6 в соответствующих строках, тогда я смогу использоватьgroupby
этот новый столбец, а затемsum
, но мне интересно, есть ли более чистый и быстрый способ сделать это? например, что-то вроде этого:
interval = 0.1
source['ints'] = (source[0] / interval).astype(int)
result = source.groupby(source['ints']).sum().reset_index()
result
Однако приведенное выше не сработает, если я, например, изменил интервал с 0,1 на 0,05.
Любая помощь будет оценена.
Ответы
Для скорости: всегда старайтесь векторизовать все, что вы можете, и избегайте apply
как можно большего.
Вот более быстрый способ (заслуга @DavidErickson sort=False
):
interval = 0.1
source.groupby(np.trunc(source[0] / interval) * interval, sort=False)[1].sum().reset_index()
# out:
0 1
0 0.9 424.0
1 0.8 25.0
2 0.7 12.0
3 0.6 95.0
Разница в скорости может быть довольно значительной для больших df
.
Попробуйте использовать 1 миллион строк, сгруппированных в 10 КБ:
source = pd.DataFrame(np.random.normal(scale=1000, size=(int(1e6), 2)))
%%timeit
# ... (as above)
26.7 ms ± 292 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
С apply
вместо этого:
1.51 s ± 11 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
(В 50 раз медленнее).
Вы можете использовать custom_round
функцию, которую я сделал 3 модификации изhttps://stackoverflow.com/a/40372261/6366770:
- Я использовал
np.floor
вместо тогоround
, чтобы спуститься как хочешь. - Это испортит значения, которые находятся на «границе» бункера, поэтому я добавляю
+ base/100
(так0.9
было бы0.9 + .009 = 0.909
и округлял до .9 вместо некорректного до 0.8), чтобы оно было чуть выше границы и округлялось правильно. Я думаю, это тебя накроет. Вы можете сделать это1 / 1000
на всякий случай. - Ответ, который я искал
int
, поэтому удаленint
, поскольку мы смотрим на округление с плавающей запятой
source = pd.DataFrame(np.random.normal(scale=1000, size=(int(1e6), 2)))
def custom_round(x, y, base):
return source.groupby((base * np.floor((x + (base / 100)) / base)), sort=False)[y].sum()
%timeit custom_round(source[0], 1, .1)
89.8 ms ± 1.14 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
На моем компьютере принятый ответ медленнее:
102 ms ± 1.86 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)