¿Cómo eliminar una selección con Avogadro2 (Ubuntu 20.x)?

Dec 23 2020

Por una razón que no entendí, Avogadro se ha eliminado de Ubuntu 20.xy el paquete disponible Avogadro2es en cambio otra rama del paquete, que desafortunadamente no cubre todas las características. Como parece imposible instalar esa versión más antigua pero más poderosa de Avogadro en el último Ubuntu, ¿alguien sabe si todavía es posible eliminar los átomos seleccionados? Estoy realmente sorprendido de que se haya "perdido" una característica tan básica.

Básicamente, puede hacer clic y seleccionar átomos (aunque no aparecen seleccionados para ningún estilo de visualización, excepto "bola y palo"), pero luego, si presiona CANCELAR, se elimina todo el modelo (todos los átomos). Estaba usando mucho esta función para manipular estructuras a través de GUI y ahora no puedo continuar a menos que use mi distribución de Ubuntu anterior.

Respuestas

7 GeoffHutchison Dec 25 2020 at 03:23

Sí, vi tu publicación en el foro, no estoy seguro de por qué esa confirmación no llegó, pero ahora tengo una solicitud de extracción.

Lo largo y lo corto es que si bien las "tripas" principales de Avogadro 2 están terminadas, hay muchas piezas pequeñas que deben hacerse (por ejemplo). La ayuda siempre es bienvenida: hay muchas tareas que pueden realizarse en unas pocas horas para cualquier persona interesada.

6 gluuke Dec 23 2020 at 22:25

Mientras tanto, he encontrado un par de soluciones y las estoy enumerando aquí para otros usuarios, ya que, francamente, no muchos paquetes permiten seleccionar fácilmente (con el mouse) átomos y eliminarlos.

  1. puede usar, chimeraya que ofrece la misma función a través de CTRL + mouse:https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/data/downloads/1.15/linux_x86_64.html y luego menú Acciones -> Átomos / Enlaces -> eliminar.

  2. Si aún desea usarlo avogadro2en Linux, puede eliminar los átomos uno por uno haciendo clic con el botón derecho en el modo "Dibujar":https://discuss.avogadro.cc/t/delete-some-atoms-in-a-supercell/341/2