Écritures très lentes sur MySQL 8 - en attente de validation du gestionnaire

Aug 15 2020

J'ai installé l'installation docker de MySQL 8 sur un périphérique de bord qui a les deux tables suivantes pour écrire

video_paths | CREATE TABLE `video_paths` (
  `entry` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `timestamp` bigint(20) NOT NULL,
  `duration` int(11) NOT NULL,
  `path` varchar(255) NOT NULL,
  `motion` int(11) NOT NULL DEFAULT '0',
  `cam_id` varchar(255) NOT NULL DEFAULT '',
  `hd` tinyint(1) NOT NULL DEFAULT '0',
  PRIMARY KEY (`entry`),
  KEY `cam_id` (`cam_id`),
  KEY `timestamp` (`timestamp`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=7342309 DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_0900_ai_ci

ET

CREATE TABLE `tracker` (
  `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `table_name` varchar(255) NOT NULL,
  `primary_key_name` varchar(255) NOT NULL,
  `pointer` int(11) NOT NULL DEFAULT '0',
  PRIMARY KEY (`id`),
  UNIQUE KEY `table_name` (`table_name`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=4 DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_0900_ai_ci

Les requêtes suivantes sont exécutées toutes les quelques secondes pour jusqu'à 32 caméras et prennent beaucoup de temps, comme indiqué par le journal des requêtes lentes.

UPDATE tracker SET pointer = 7342046 WHERE table_name = 'video_paths'

INSERT INTO video_paths (timestamp,duration,path,cam_id,hd) VALUES (1597548365000,5000,'/s/ss/x-0/v/2020-08-16/3/1.ts','x-1',1)

La plupart du temps est passé dans l' waiting for handler commitÉtat

La taille totale de mes données (tables + index) est d'environ 1 Go et les paramètres suivants sont activés pour optimiser l'écriture

skip-log-bin- Désactivé le journal de la corbeille car je n'ai pas de réplique et donc pas d'utilisation pour cela innodb_flush_log_at_trx_commit =2- J'optimise pour les performances plutôt que la cohérence ici. range_optimizer_max_mem_size =0Comme mentionné dans cette question , j'ai autorisé la mémoire maximale à l'optimiseur de plage. inndo_buffer_pool_size= 512Mb- Cela devrait suffire pour mes données ?.
innodb_log_file_size= 96Mb* 2 fichiers

Je vois des requêtes qui prennent parfois jusqu'à 90-100 secondes.

SET timestamp=1597549337;
INSERT INTO video_paths (timestamp,duration,path,cam_id,hd) VALUES (1597548365000,5000,'/s/ss/x-0/v/2020-08-16/3/1.ts','x-1',1);
# Time: 2020-08-16T03:42:24.533408Z
# Query_time: 96.712976  Lock_time: 0.000033 Rows_sent: 0  Rows_examined: 0

--- UPDATE --- Voici le fichier my.cnf complet

my.cnf

[mysqld]
pid-file        = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock
datadir         = /var/lib/mysql
secure-file-priv= NULL
# Disabling symbolic-links is recommended to prevent assorted security risks
symbolic-links=0

skip-log-bin
innodb_buffer_pool_size=536870912
innodb_log_file_size=100663296

# Custom config should go here
!includedir /etc/mysql/conf.d/

conf.d/docker.cnf 
[mysqld]
skip-host-cache
skip-name-resolve 

Le conteneur Docker utilise le mode hôte, donc une mémoire complète de 15 Go est disponible pour le conteneur.

--- UPDATE 2 --- Après avoir augmenté le innodb_buffer_poo_sizeà 2 Go comme suggéré par @fyrye, les instructions ont maintenant commencé à rester bloquées au STATE = UPDATElieu de waiting for handler commit.

---- UPDATE 3 --- On dirait que le CPU est à l'origine du goulot d'étranglement

** ---- UPDATE 4 ---- ** Informations supplémentaires

  1. Taille du bélier
              total        used        free      shared  buff/cache   available
Mem:          15909        1711        9385        2491        4813       11600
Swap:             0           0           0
  1. Aucun périphérique SSD / NVMe connecté
  2. SHOW GLOBAL STATUS - https://pastebin.com/vtWi0PUq
  3. SHOW GLOBAL VARIABLES - https://pastebin.com/MUZeG959
  4. SHOW FULL PROCESSLIST - https://pastebin.com/eebEcYk7
  5. htop - htopvoici pour le système Edge qui a 4 autres conteneurs en cours d'exécution qui incluent l'application principale, ffmpeg, mqtt, etc.
  6. ulimit -a:
core file size          (blocks, -c) 0
data seg size           (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority             (-e) 0
file size               (blocks, -f) unlimited
pending signals                 (-i) 62576
max locked memory       (kbytes, -l) 64
max memory size         (kbytes, -m) unlimited
open files                      (-n) 1024
pipe size            (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues     (bytes, -q) 819200
real-time priority              (-r) 0
stack size              (kbytes, -s) 8192
cpu time               (seconds, -t) unlimited
max user processes              (-u) 62576
virtual memory          (kbytes, -v) unlimited
file locks                      (-x) unlimited
  1. opstat -xm 5 4
Linux 4.15.0-106-generic (xxxx)    08/18/2020  _x86_64_    (4 CPU)

avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
         26.97    0.00   22.36   22.53    0.00   28.14

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
loop0             0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     3.20     0.00    2.40    2.40    0.00   0.00   0.00
sda              13.78     9.89   32.24   11.44     0.37     4.10   209.51    47.52 1079.07   44.07 3994.87  22.39  97.81

avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
         19.71    0.00   27.85   40.87    0.00   11.57

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
loop0             0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
sda               0.00     0.00    1.40    4.60     0.03     2.71   934.93   142.66 24221.33  666.29 31390.26 166.67 100.00

avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
         20.16    0.00   26.77   28.30    0.00   24.77

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
loop0             0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
sda               0.00     0.00    8.80    5.60     0.03     3.45   496.11   141.28 12507.78  194.00 31858.00  69.44 100.00
  1. mpstat -P ALL 5 3
Linux 4.15.0-106-generic (sn-1f0ce8)    08/18/2020  _x86_64_    (4 CPU)

02:15:47 PM  CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
02:15:52 PM  all   21.48    0.00   20.40   29.01    0.00    7.94    0.00    0.00    0.00   21.17
02:15:52 PM    0   24.95    0.00   20.86    5.32    0.00    0.61    0.00    0.00    0.00   48.26
02:15:52 PM    1   17.59    0.00   18.81   57.67    0.00    5.93    0.00    0.00    0.00    0.00
02:15:52 PM    2   21.28    0.00   17.36    0.21    0.00   24.79    0.00    0.00    0.00   36.36
02:15:52 PM    3   22.34    0.00   24.59   52.46    0.00    0.61    0.00    0.00    0.00    0.00

02:15:52 PM  CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
02:15:57 PM  all   20.56    0.00   20.00   28.26    0.00    7.08    0.00    0.00    0.00   24.10
02:15:57 PM    0   24.44    0.00   18.89   12.32    0.00    0.21    0.00    0.00    0.00   44.15
02:15:57 PM    1   17.73    0.00   15.46   33.20    0.00    4.95    0.00    0.00    0.00   28.66
02:15:57 PM    2   18.93    0.00   22.22   12.35    0.00   22.84    0.00    0.00    0.00   23.66
02:15:57 PM    3   21.06    0.00   23.31   55.21    0.00    0.41    0.00    0.00    0.00    0.00

02:15:57 PM  CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
02:16:02 PM  all   21.81    0.00   18.32   26.42    0.00    7.03    0.00    0.00    0.00   26.42
02:16:02 PM    0   26.43    0.00   19.67    0.20    0.00    0.41    0.00    0.00    0.00   53.28
02:16:02 PM    1   20.57    0.00   17.11   45.21    0.00    5.30    0.00    0.00    0.00   11.81
02:16:02 PM    2   19.67    0.00   16.74    0.21    0.00   21.97    0.00    0.00    0.00   41.42
02:16:02 PM    3   20.45    0.00   19.84   58.91    0.00    0.81    0.00    0.00    0.00    0.00

Average:     CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
Average:     all   21.28    0.00   19.57   27.90    0.00    7.35    0.00    0.00    0.00   23.90
Average:       0   25.27    0.00   19.81    5.94    0.00    0.41    0.00    0.00    0.00   48.57
Average:       1   18.63    0.00   17.13   45.39    0.00    5.39    0.00    0.00    0.00   13.45
Average:       2   19.96    0.00   18.78    4.28    0.00   23.20    0.00    0.00    0.00   33.77
Average:       3   21.28    0.00   22.57   55.54    0.00    0.61    0.00    0.00    0.00    0.00

Réponses

3 WilsonHauck Aug 19 2020 at 15:26

Suggestions à considérer pour votre section my.cnf [mysqld]

log_error=/var/lib/mysql/sn-1f0ce8-error.log  # from stderr to have a visible error log
innodb_lru_scan_depth=100  # from 1024 to conserve 90% CPU cycles used for function
innodb_io_capacity=1900  # from 200 to allow more IOPSecond to your storage device
innodb_flush_neighbors=2  # from 0 to expedite writing to current extent
innodb_innodb_max_dirty_pages_pct_lwm=1  # from 10 percent to expedite writes
innodb_innodb_max_dirty_pages_pct=1  # from 90 percent to reduce innodb_buffer_pool_pages_dirty count
innodb_change_buffer_max_size=50  # from 25 percent to expedite your high volume activity

Vous constaterez que ces suggestions réduiront l'occupation du processeur et accéléreront l'achèvement des requêtes.

Pour des suggestions supplémentaires, consultez le profil, le profil de réseau pour les informations de contact et les scripts utilitaires téléchargeables gratuitement pour vous aider à améliorer les performances.