Larghezza trama violino in ggplot
Sto cercando di tracciare una trama completa di violino accanto a più trame di mezzo violino usando ggplot. Sto tracciando l'intera trama del violino usando geom_violin () e tracciando la trama del mezzo violino usando geom_violinhalf dal pacchetto "see", con scale = 'width'. Tuttavia, questo ha prodotto una figura con l'intera trama del violino che appare significativamente più sottile rispetto alle trame del mezzo violino, come si vede nel codice sottostante. Ho provato le tre opzioni di "ridimensionamento" integrate in ggplot.
Esiste un modo per tracciare un complotto completo di violino e più trame di mezzo violino utilizzando una funzione? O c'è un modo diverso in cui posso impostare manualmente la larghezza dell'intera trama del violino?
Grazie!
#install.packages("vioplot")
#install.packages('ggplot2')
#install.packages('scales')
library(ggplot2)
library(vioplot)
library(scales)
df1 = as.data.frame(matrix(NA, nrow = 1000, ncol = 2))
colnames(df1) = c('x','y')
df1[,2] = rnorm(1000,10,5)
df1[,1] = rep(-5, 1000)
df2 = as.data.frame(matrix(NA, nrow = 10000, ncol = 2))
colnames(df2) = c('x','y')
df2[,1] = sample(seq(0,70,5),10000,replace=TRUE)
df2[,2] = rnorm(10000,10,5)
df = rbind(df1, df2)
ggplot(df, aes(x=x,y=y))+
geom_violinhalf(data=subset(df,df$x != -5), aes(x=x, group = x), scale = 'width', fill = alpha('red', 0.2), color = alpha('red',0.2))+ geom_violin(data = subset(df, df$x== -5), color = alpha('red', 0.2), fill = alpha('red', 0.2))+
geom_point(size = 1.2, col = alpha('grey', 0.2))+
theme_classic()
MODIFICARE
Il codice precedente non era corretto, ci scusiamo. Come potrebbe essere espanso il primo violino se il dataframe fosse invece il seguente, con ciascuna delle trame del violino raggruppata per "d" invece che per "x":
df1 = as.data.frame(matrix(NA, nrow = 10000, ncol = 3))
colnames(df1) = c('d','y','x')
df1[,2] = rnorm(10000,10,5)
df1[,1] = sample(seq(-5,70,.1),10000, replace=TRUE)
for(i in 1:nrow(df1)){
if(df1[i,'d'] < 0){df1[i,"x"] <- -5}else
if(df1[i,"d"] >= 0 & df1[i,"d"] < 5){df1[i,"x"] <- 0}else
if(df1[i,"d"] >= 5 & df1[i,"d"] < 10){df1[i,"x"] <- 5}else
if(df1[i,"d"] >= 10 & df1[i,"d"] < 15){df1[i,"x"] <- 10}else
if(df1[i,"d"] >=15 & df1[i,"d"] < 20){df1[i,"x"] <- 15}else
if(df1[i,"d"] >= 20 & df1[i,"d"] < 25){df1[i,"x"] <- 20}else
if(df1[i,"d"] >= 25 & df1[i,"d"] < 30){df1[i,"x"] <- 25}else
if(df1[i,"d"] >= 30 & df1[i,"d"] < 35){df1[i,"x"] <- 30}else
if(df1[i,"d"] >= 35 & df1[i,"d"] < 40){df1[i,"x"] <- 35}else
if(df1[i,"d"] >= 40 & df1[i,"d"] < 45){df1[i,"x"] <- 40}else
if(df1[i,"d"] >= 45 & df1[i,"d"] < 50){df1[i,"x"] <- 45}else
if(df1[i,"d"] >= 50 & df1[i,"d"] < 55){df1[i,"x"] <- 50}else
if(df1[i,"d"] >= 55 & df1[i,"d"] < 60){df1[i,"x"] <- 55}else
if(df1[i,"d"] >= 60 & df1[i,"d"] < 65){df1[i,"x"] <- 60}else
if(df1[i,"d"] >= 65 & df1[i,"d"] < 70){df1[i,"x"] <- 65}else
if(df1[i,"d"] >= 70 & df1[i,"d"] < 75){df1[i,"x"] <- 70}else
if(df1[i,"d"] >= 75 & df1[i,"d"] < 80){df1[i,"x"] <- 75}}
Risposte
Le larghezze verranno equalizzate per impostazione predefinita se converti x in un fattore:
ggplot(df, aes(x=factor(x),y=y)) +
geom_violinhalf(data=subset(df,df$x != -5), aes(group = x), scale = 'width', fill = alpha('red', 0.2), color = alpha('red',0.2)) + geom_violin(data = subset(df, df$x== -5),
color = alpha('red', 0.2), fill = alpha('red', 0.2)) +
geom_point(size = 1.2, col = alpha('grey', 0.2)) +
theme_classic()
In alternativa, puoi mantenere un valore xnumerico e utilizzare il widthparametro di geom_violin. Qui lo imposterò un po 'troppo largo a width = 8scopo dimostrativo, ma l'ideale sembra essere width = 5:
ggplot(df, aes(x = x, y = y)) +
geom_violinhalf(data = subset(df,df$x != -5), aes(group = x), scale = 'width', fill = alpha('red', 0.2), color = alpha('red',0.2)) + geom_violin(data = subset(df, df$x == -5), width = 8,
color = alpha('red', 0.2), fill = alpha('red', 0.2)) +
geom_point(size = 1.2, col = alpha('grey', 0.2)) +
theme_classic()
MODIFICARE
Per aggiungere i punti dalla colonna d, possiamo fare:
ggplot(df1, aes(x=x,y=y)) +
geom_violinhalf(data=subset(df1,df1$x != -5), aes(group = x), scale = 'width', fill = alpha('red', 0.2), color = alpha('red',0.2)) + geom_violin(data = subset(df1, df1$x== -5), width = 5,
color = alpha('red', 0.2), fill = alpha('red', 0.2)) +
geom_point(aes(x = d), size = 1.2, col = alpha('grey', 0.2)) +
theme_classic()