Come ruotare un dataframe?

Nov 07 2017
  • Cos'è pivot?
  • Come faccio a ruotare?
  • È questo un perno?
  • Dal formato lungo al grande formato?

Ho visto molte domande che pongono sulle tabelle pivot. Anche se non sanno che stanno chiedendo informazioni sulle tabelle pivot, di solito lo sono. È praticamente impossibile scrivere una domanda e una risposta canoniche che comprenda tutti gli aspetti del pivot ...

... Ma ci proverò.


Il problema con le domande e le risposte esistenti è che spesso la domanda è focalizzata su una sfumatura che il PO ha difficoltà a generalizzare per utilizzare un certo numero di buone risposte esistenti. Tuttavia, nessuna delle risposte cerca di fornire una spiegazione esauriente (perché è un compito arduo)

Guarda alcuni esempi dalla mia ricerca su Google

  1. Come ruotare un dataframe in Panda?
  • Buona domanda e risposta. Ma la risposta risponde solo alla domanda specifica con poche spiegazioni.
  1. panda tabella pivot al frame di dati
  • In questa domanda, l'OP si occupa dell'output del pivot. Vale a dire come appaiono le colonne. OP voleva che assomigliasse a R. Questo non è molto utile per gli utenti di panda.
  1. panda ruotando un dataframe, righe duplicate
  • Un'altra domanda decente, ma la risposta si concentra su un metodo, vale a dire pd.DataFrame.pivot

Quindi, ogni volta che qualcuno cerca pivot, ottiene risultati sporadici che probabilmente non risponderanno alla loro domanda specifica.


Impostare

Potresti notare che ho chiamato in modo evidente le mie colonne e i valori delle colonne pertinenti in modo che corrispondano a come farò perno nelle risposte seguenti.

import numpy as np
import pandas as pd
from numpy.core.defchararray import add

np.random.seed([3,1415])
n = 20

cols = np.array(['key', 'row', 'item', 'col'])
arr1 = (np.random.randint(5, size=(n, 4)) // [2, 1, 2, 1]).astype(str)

df = pd.DataFrame(
    add(cols, arr1), columns=cols
).join(
    pd.DataFrame(np.random.rand(n, 2).round(2)).add_prefix('val')
)
print(df)

     key   row   item   col  val0  val1
0   key0  row3  item1  col3  0.81  0.04
1   key1  row2  item1  col2  0.44  0.07
2   key1  row0  item1  col0  0.77  0.01
3   key0  row4  item0  col2  0.15  0.59
4   key1  row0  item2  col1  0.81  0.64
5   key1  row2  item2  col4  0.13  0.88
6   key2  row4  item1  col3  0.88  0.39
7   key1  row4  item1  col1  0.10  0.07
8   key1  row0  item2  col4  0.65  0.02
9   key1  row2  item0  col2  0.35  0.61
10  key2  row0  item2  col1  0.40  0.85
11  key2  row4  item1  col2  0.64  0.25
12  key0  row2  item2  col3  0.50  0.44
13  key0  row4  item1  col4  0.24  0.46
14  key1  row3  item2  col3  0.28  0.11
15  key0  row3  item1  col1  0.31  0.23
16  key0  row0  item2  col3  0.86  0.01
17  key0  row4  item0  col3  0.64  0.21
18  key2  row2  item2  col0  0.13  0.45
19  key0  row2  item0  col4  0.37  0.70

Domande)

  1. Perché ottengo ValueError: Index contains duplicate entries, cannot reshape

  2. Come faccio a ruotare in modo dftale che i colvalori siano colonne, i rowvalori siano l'indice e la media val0siano i valori?

     col   col0   col1   col2   col3  col4
     row                                  
     row0  0.77  0.605    NaN  0.860  0.65
     row2  0.13    NaN  0.395  0.500  0.25
     row3   NaN  0.310    NaN  0.545   NaN
     row4   NaN  0.100  0.395  0.760  0.24
    
  3. Come faccio a ruotare in modo dftale che i colvalori siano colonne, i rowvalori siano l'indice, la media dei val0valori e i valori mancanti siano 0?

     col   col0   col1   col2   col3  col4
     row                                  
     row0  0.77  0.605  0.000  0.860  0.65
     row2  0.13  0.000  0.395  0.500  0.25
     row3  0.00  0.310  0.000  0.545  0.00
     row4  0.00  0.100  0.395  0.760  0.24
    
  4. Posso ottenere qualcosa di diverso mean, come forse sum?

     col   col0  col1  col2  col3  col4
     row                               
     row0  0.77  1.21  0.00  0.86  0.65
     row2  0.13  0.00  0.79  0.50  0.50
     row3  0.00  0.31  0.00  1.09  0.00
     row4  0.00  0.10  0.79  1.52  0.24
    
  5. Posso fare più di un'aggregazione alla volta?

            sum                          mean                           
     col   col0  col1  col2  col3  col4  col0   col1   col2   col3  col4
     row                                                                
     row0  0.77  1.21  0.00  0.86  0.65  0.77  0.605  0.000  0.860  0.65
     row2  0.13  0.00  0.79  0.50  0.50  0.13  0.000  0.395  0.500  0.25
     row3  0.00  0.31  0.00  1.09  0.00  0.00  0.310  0.000  0.545  0.00
     row4  0.00  0.10  0.79  1.52  0.24  0.00  0.100  0.395  0.760  0.24
    
  6. Posso aggregare su più colonne di valori?

           val0                             val1                          
     col   col0   col1   col2   col3  col4  col0   col1  col2   col3  col4
     row                                                                  
     row0  0.77  0.605  0.000  0.860  0.65  0.01  0.745  0.00  0.010  0.02
     row2  0.13  0.000  0.395  0.500  0.25  0.45  0.000  0.34  0.440  0.79
     row3  0.00  0.310  0.000  0.545  0.00  0.00  0.230  0.00  0.075  0.00
     row4  0.00  0.100  0.395  0.760  0.24  0.00  0.070  0.42  0.300  0.46
    
  7. Può suddividere per più colonne?

     item item0             item1                         item2                   
     col   col2  col3  col4  col0  col1  col2  col3  col4  col0   col1  col3  col4
     row                                                                          
     row0  0.00  0.00  0.00  0.77  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.605  0.86  0.65
     row2  0.35  0.00  0.37  0.00  0.00  0.44  0.00  0.00  0.13  0.000  0.50  0.13
     row3  0.00  0.00  0.00  0.00  0.31  0.00  0.81  0.00  0.00  0.000  0.28  0.00
     row4  0.15  0.64  0.00  0.00  0.10  0.64  0.88  0.24  0.00  0.000  0.00  0.00
    
  8. O

     item      item0             item1                         item2                  
     col        col2  col3  col4  col0  col1  col2  col3  col4  col0  col1  col3  col4
     key  row                                                                         
     key0 row0  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.86  0.00
          row2  0.00  0.00  0.37  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.50  0.00
          row3  0.00  0.00  0.00  0.00  0.31  0.00  0.81  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00
          row4  0.15  0.64  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.24  0.00  0.00  0.00  0.00
     key1 row0  0.00  0.00  0.00  0.77  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.81  0.00  0.65
          row2  0.35  0.00  0.00  0.00  0.00  0.44  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.13
          row3  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.28  0.00
          row4  0.00  0.00  0.00  0.00  0.10  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00
     key2 row0  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.40  0.00  0.00
          row2  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.13  0.00  0.00  0.00
          row4  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.64  0.88  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00
    
  9. Posso aggregare la frequenza con cui la colonna e le righe ricorrono insieme, ovvero "tabulazione incrociata"?

     col   col0  col1  col2  col3  col4
     row                               
     row0     1     2     0     1     1
     row2     1     0     2     1     2
     row3     0     1     0     2     0
     row4     0     1     2     2     1
    
  10. Come posso convertire un DataFrame da lungo a largo ruotando SOLO su due colonne? Dato,

    np.random.seed([3, 1415])
    df2 = pd.DataFrame({'A': list('aaaabbbc'), 'B': np.random.choice(15, 8)})        
    df2        
       A   B
    0  a   0
    1  a  11
    2  a   2
    3  a  11
    4  b  10
    5  b  10
    6  b  14
    7  c   7
    

    L'atteso dovrebbe assomigliare a qualcosa

          a     b    c
    0   0.0  10.0  7.0
    1  11.0  10.0  NaN
    2   2.0  14.0  NaN
    3  11.0   NaN  NaN
    
  11. Come appiattisco l'indice multiplo in un indice singolo dopo pivot

    A partire dal

       1  2   
       1  1  2        
    a  2  1  1
    b  2  1  0
    c  1  0  0
    

    Per

       1|1  2|1  2|2               
    a    2    1    1
    b    2    1    0
    c    1    0    0
    

Risposte

333 piRSquared Nov 07 2017 at 15:00

Iniziamo rispondendo alla prima domanda:

Domanda 1

Perché ottengo ValueError: Index contains duplicate entries, cannot reshape

Ciò si verifica perché i panda stanno tentando di reindicizzare un oggetto columnso indexcon voci duplicate. Esistono diversi metodi da utilizzare che possono eseguire un pivot. Alcuni di essi non sono adatti a quando sono presenti duplicati delle chiavi su cui viene chiesto di ruotare. Per esempio. Considera pd.DataFrame.pivot. So che ci sono voci duplicate che condividono i valori rowe col:

df.duplicated(['row', 'col']).any()

True

Quindi quando pivotuso

df.pivot(index='row', columns='col', values='val0')

Ottengo l'errore di cui sopra. In effetti, ottengo lo stesso errore quando provo a eseguire la stessa attività con:

df.set_index(['row', 'col'])['val0'].unstack()

Ecco un elenco di modi di dire che possiamo usare per fare perno

  1. pd.DataFrame.groupby + pd.DataFrame.unstack
    • Buon approccio generale per eseguire praticamente qualsiasi tipo di perno
    • Specificare tutte le colonne che costituiranno i livelli di riga pivot e i livelli di colonna in un gruppo da. Puoi seguirlo selezionando le colonne rimanenti che desideri aggregare e le funzioni che desideri eseguire l'aggregazione. Infine, unstacki livelli che vuoi essere nell'indice della colonna.
  2. pd.DataFrame.pivot_table
    • Una versione glorificata di groupbycon API più intuitive. Per molte persone, questo è l'approccio preferito. Ed è l'approccio previsto dagli sviluppatori.
    • Specificare il livello di riga, i livelli di colonna, i valori da aggregare e le funzioni per eseguire le aggregazioni.
  3. pd.DataFrame.set_index + pd.DataFrame.unstack
    • Comodo e intuitivo per alcuni (me compreso). Impossibile gestire chiavi raggruppate duplicate.
    • Simile al groupbyparadigma, specifichiamo tutte le colonne che alla fine saranno livelli di riga o di colonna e le impostiamo come indice. Abbiamo quindi unstacki livelli che vogliamo nelle colonne. Se i livelli di indice rimanenti oi livelli di colonna non sono univoci, questo metodo avrà esito negativo.
  4. pd.DataFrame.pivot
    • Molto simile a set_indexin quanto condivide la limitazione della chiave duplicata. Anche l'API è molto limitata. Si richiede solo valori scalari per index, columns, values.
    • Simile al pivot_tablemetodo in quanto selezioniamo righe, colonne e valori su cui ruotare. Tuttavia, non possiamo aggregare e se le righe o le colonne non sono univoche, questo metodo fallirà.
  5. pd.crosstab
    • Questa una versione specializzata pivot_tablee nella sua forma più pura è il modo più intuitivo per eseguire diverse attività.
  6. pd.factorize + np.bincount
    • Questa è una tecnica molto avanzata che è molto oscura ma è molto veloce. Non può essere utilizzato in tutte le circostanze, ma quando può essere utilizzato e ti senti a tuo agio nell'usarlo, raccoglierai i frutti delle prestazioni.
  7. pd.get_dummies + pd.DataFrame.dot
    • Lo uso per eseguire abilmente la tabulazione incrociata.

Esempi

Quello che farò per ogni risposta e domanda successiva è rispondere usando pd.DataFrame.pivot_table. Quindi fornirò alternative per eseguire la stessa operazione.

Domanda 3

Come faccio a ruotare in modo dftale che i colvalori siano colonne, i rowvalori siano l'indice, la media dei val0valori e i valori mancanti siano 0?

  • pd.DataFrame.pivot_table

    • fill_valuenon è impostato di default. Tendo a impostarlo in modo appropriato. In questo caso l'ho impostato su 0. Si noti che ho saltato la domanda 2 poiché è la stessa di questa risposta senza l'estensionefill_value
    • aggfunc='mean'è l'impostazione predefinita e non ho dovuto impostarla. L'ho incluso per essere esplicito.

      df.pivot_table(
          values='val0', index='row', columns='col',
          fill_value=0, aggfunc='mean')
      
      col   col0   col1   col2   col3  col4
      row                                  
      row0  0.77  0.605  0.000  0.860  0.65
      row2  0.13  0.000  0.395  0.500  0.25
      row3  0.00  0.310  0.000  0.545  0.00
      row4  0.00  0.100  0.395  0.760  0.24
      
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(['row', 'col'])['val0'].mean().unstack(fill_value=0)
    
  • pd.crosstab

    pd.crosstab(
        index=df['row'], columns=df['col'],
        values=df['val0'], aggfunc='mean').fillna(0)
    

Domanda 4

Posso ottenere qualcosa di diverso mean, come forse sum?

  • pd.DataFrame.pivot_table

    df.pivot_table(
        values='val0', index='row', columns='col',
        fill_value=0, aggfunc='sum')
    
    col   col0  col1  col2  col3  col4
    row                               
    row0  0.77  1.21  0.00  0.86  0.65
    row2  0.13  0.00  0.79  0.50  0.50
    row3  0.00  0.31  0.00  1.09  0.00
    row4  0.00  0.10  0.79  1.52  0.24
    
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(['row', 'col'])['val0'].sum().unstack(fill_value=0)
    
  • pd.crosstab

    pd.crosstab(
        index=df['row'], columns=df['col'],
        values=df['val0'], aggfunc='sum').fillna(0)
    

Domanda 5

Posso fare più di un'aggregazione alla volta?

Si noti che per pivot_tablee crosstabavevo bisogno di passare l'elenco di invocabili. D'altra parte, groupby.aggè in grado di accettare stringhe per un numero limitato di funzioni speciali. groupby.aggavrebbe anche preso gli stessi invocabili che abbiamo passato agli altri, ma spesso è più efficiente sfruttare i nomi delle funzioni stringa poiché ci sono efficienze da ottenere.

  • pd.DataFrame.pivot_table

    df.pivot_table(
        values='val0', index='row', columns='col',
        fill_value=0, aggfunc=[np.size, np.mean])
    
         size                      mean                           
    col  col0 col1 col2 col3 col4  col0   col1   col2   col3  col4
    row                                                           
    row0    1    2    0    1    1  0.77  0.605  0.000  0.860  0.65
    row2    1    0    2    1    2  0.13  0.000  0.395  0.500  0.25
    row3    0    1    0    2    0  0.00  0.310  0.000  0.545  0.00
    row4    0    1    2    2    1  0.00  0.100  0.395  0.760  0.24
    
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(['row', 'col'])['val0'].agg(['size', 'mean']).unstack(fill_value=0)
    
  • pd.crosstab

    pd.crosstab(
        index=df['row'], columns=df['col'],
        values=df['val0'], aggfunc=[np.size, np.mean]).fillna(0, downcast='infer')
    

Domanda 6

Posso aggregare su più colonne di valori?

  • pd.DataFrame.pivot_tablepassiamo values=['val0', 'val1']ma avremmo potuto lasciarlo completamente fuori

    df.pivot_table(
        values=['val0', 'val1'], index='row', columns='col',
        fill_value=0, aggfunc='mean')
    
          val0                             val1                          
    col   col0   col1   col2   col3  col4  col0   col1  col2   col3  col4
    row                                                                  
    row0  0.77  0.605  0.000  0.860  0.65  0.01  0.745  0.00  0.010  0.02
    row2  0.13  0.000  0.395  0.500  0.25  0.45  0.000  0.34  0.440  0.79
    row3  0.00  0.310  0.000  0.545  0.00  0.00  0.230  0.00  0.075  0.00
    row4  0.00  0.100  0.395  0.760  0.24  0.00  0.070  0.42  0.300  0.46
    
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(['row', 'col'])['val0', 'val1'].mean().unstack(fill_value=0)
    

Domanda 7

Può suddividere per più colonne?

  • pd.DataFrame.pivot_table

    df.pivot_table(
        values='val0', index='row', columns=['item', 'col'],
        fill_value=0, aggfunc='mean')
    
    item item0             item1                         item2                   
    col   col2  col3  col4  col0  col1  col2  col3  col4  col0   col1  col3  col4
    row                                                                          
    row0  0.00  0.00  0.00  0.77  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.605  0.86  0.65
    row2  0.35  0.00  0.37  0.00  0.00  0.44  0.00  0.00  0.13  0.000  0.50  0.13
    row3  0.00  0.00  0.00  0.00  0.31  0.00  0.81  0.00  0.00  0.000  0.28  0.00
    row4  0.15  0.64  0.00  0.00  0.10  0.64  0.88  0.24  0.00  0.000  0.00  0.00
    
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(
        ['row', 'item', 'col']
    )['val0'].mean().unstack(['item', 'col']).fillna(0).sort_index(1)
    

Domanda 8

Può suddividere per più colonne?

  • pd.DataFrame.pivot_table

    df.pivot_table(
        values='val0', index=['key', 'row'], columns=['item', 'col'],
        fill_value=0, aggfunc='mean')
    
    item      item0             item1                         item2                  
    col        col2  col3  col4  col0  col1  col2  col3  col4  col0  col1  col3  col4
    key  row                                                                         
    key0 row0  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.86  0.00
         row2  0.00  0.00  0.37  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.50  0.00
         row3  0.00  0.00  0.00  0.00  0.31  0.00  0.81  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00
         row4  0.15  0.64  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.24  0.00  0.00  0.00  0.00
    key1 row0  0.00  0.00  0.00  0.77  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.81  0.00  0.65
         row2  0.35  0.00  0.00  0.00  0.00  0.44  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.13
         row3  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.28  0.00
         row4  0.00  0.00  0.00  0.00  0.10  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00
    key2 row0  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.40  0.00  0.00
         row2  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.13  0.00  0.00  0.00
         row4  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00  0.64  0.88  0.00  0.00  0.00  0.00  0.00
    
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(
        ['key', 'row', 'item', 'col']
    )['val0'].mean().unstack(['item', 'col']).fillna(0).sort_index(1)
    
  • pd.DataFrame.set_index perché il set di chiavi è unico sia per le righe che per le colonne

    df.set_index(
        ['key', 'row', 'item', 'col']
    )['val0'].unstack(['item', 'col']).fillna(0).sort_index(1)
    

Domanda 9

Posso aggregare la frequenza con cui la colonna e le righe ricorrono insieme, ovvero "tabulazione incrociata"?

  • pd.DataFrame.pivot_table

    df.pivot_table(index='row', columns='col', fill_value=0, aggfunc='size')
    
        col   col0  col1  col2  col3  col4
    row                               
    row0     1     2     0     1     1
    row2     1     0     2     1     2
    row3     0     1     0     2     0
    row4     0     1     2     2     1
    
  • pd.DataFrame.groupby

    df.groupby(['row', 'col'])['val0'].size().unstack(fill_value=0)
    
  • pd.crosstab

    pd.crosstab(df['row'], df['col'])
    
  • pd.factorize + np.bincount

    # get integer factorization `i` and unique values `r`
    # for column `'row'`
    i, r = pd.factorize(df['row'].values)
    # get integer factorization `j` and unique values `c`
    # for column `'col'`
    j, c = pd.factorize(df['col'].values)
    # `n` will be the number of rows
    # `m` will be the number of columns
    n, m = r.size, c.size
    # `i * m + j` is a clever way of counting the 
    # factorization bins assuming a flat array of length
    # `n * m`.  Which is why we subsequently reshape as `(n, m)`
    b = np.bincount(i * m + j, minlength=n * m).reshape(n, m)
    # BTW, whenever I read this, I think 'Bean, Rice, and Cheese'
    pd.DataFrame(b, r, c)
    
          col3  col2  col0  col1  col4
    row3     2     0     0     1     0
    row2     1     2     1     0     2
    row0     1     0     1     2     1
    row4     2     2     0     1     1
    
  • pd.get_dummies

    pd.get_dummies(df['row']).T.dot(pd.get_dummies(df['col']))
    
          col0  col1  col2  col3  col4
    row0     1     2     0     1     1
    row2     1     0     2     1     2
    row3     0     1     0     2     0
    row4     0     1     2     2     1
    

Domanda 10

Come posso convertire un DataFrame da lungo a largo ruotando SOLO su due colonne?

Il primo passaggio è assegnare un numero a ciascuna riga: questo numero sarà l'indice di riga di quel valore nel risultato pivot. Questo viene fatto usando GroupBy.cumcount:

df2.insert(0, 'count', df.groupby('A').cumcount())
df2

   count  A   B
0      0  a   0
1      1  a  11
2      2  a   2
3      3  a  11
4      0  b  10
5      1  b  10
6      2  b  14
7      0  c   7

Il secondo passaggio consiste nell'usare la colonna appena creata come indice da chiamare DataFrame.pivot.

df2.pivot(*df)
# df.pivot(index='count', columns='A', values='B')

A         a     b    c
count                 
0       0.0  10.0  7.0
1      11.0  10.0  NaN
2       2.0  14.0  NaN
3      11.0   NaN  NaN

Domanda 11

Come appiattisco l'indice multiplo in un indice singolo dopo pivot

Se columnsdigita objectcon stringajoin

df.columns = df.columns.map('|'.join)

altro format

df.columns = df.columns.map('{0[0]}|{0[1]}'.format) 
6 Ch3steR Jun 05 2020 at 23:08

Per estendere la risposta di @ piRSquared un'altra versione della domanda 10

Domanda 10.1

DataFrame:

d = data = {'A': {0: 1, 1: 1, 2: 1, 3: 2, 4: 2, 5: 3, 6: 5},
 'B': {0: 'a', 1: 'b', 2: 'c', 3: 'a', 4: 'b', 5: 'a', 6: 'c'}}
df = pd.DataFrame(d)

   A  B
0  1  a
1  1  b
2  1  c
3  2  a
4  2  b
5  3  a
6  5  c

Produzione:

   0     1     2
A
1  a     b     c
2  a     b  None
3  a  None  None
5  c  None  None

Utilizzando df.groupbyepd.Series.tolist

t = df.groupby('A')['B'].apply(list)
out = pd.DataFrame(t.tolist(),index=t.index)
out
   0     1     2
A
1  a     b     c
2  a     b  None
3  a  None  None
5  c  None  None

O un'alternativa molto migliore utilizzando pd.pivot_tablecondf.squeeze.

t = df.pivot_table(index='A',values='B',aggfunc=list).squeeze()
out = pd.DataFrame(t.tolist(),index=t.index)