Usando R com instalação de notebook Jupyter

Aug 18 2020

Instalei o R a partir do site oficial e desejo usá-lo a partir do jupyter notebook e do jupyterlab. Para isso instalei o IRkernal em R usando:

install.packages('IRkernel')

e quando digito IRkernel::installspec(user = FALSE)para tornar a instalação visível globalmente, recebo o seguinte erro:

Error in IRkernel::installspec(user = FALSE) : 
  jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 127.
In addition: Warning message:
In system2("jupyter", c("kernelspec", "--version"), FALSE, FALSE) :
  '"jupyter"' not found

Tenho a instalação do jupyter no miniconda e não quero usar a distribuição conda do R. O que devo fazer?

Respostas

1 JaydevSinghRao Aug 18 2020 at 07:42

O comando para configurar o IRkernel deve ser executado no mesmo ambiente da instalação do jupyter. Devido a isso, ele não funcionará diretamente com R.exe. Para isso, você deve executar o comando IRkernel::installspec(user=False) no prompt do Anaconda .