Kuzenle ilişkiyi yalnızca diğer kuzenlerle karşılıklı ilişkilere dayanarak belirleme
Arka fon
23andMe.com'da şecere araştırıyorum, yeni kuzenler bulmaya ve benimle ilişkilerini belirlemeye çalışıyorum. Tüm site bana, insanların ve benimle tahmin edilen kuzen ilişkilerinin bir listesi (CSV dosyası olarak indirilebilir) ile aramızdaki ortak akrabaların bir listesini ve onlarla tahmin edilen ilişkilerinin bir karşılaştırmasını görebileceğim bir sayfadır. (indirilemez, örneğin X kişisinin sayfasında "kişi Y - Siz: 2. kuzen, X: 3. kuzen" yazacaktır). Ne yazık ki benim kültürümde, ayrımcılık nedeniyle tarihsel olarak önemli miktarda iç eşlilik olmuştur, bu nedenle "Uzak kuzen" muhtemelen 10. kuzenler veya daha fazlası anlamına gelebilir. Benim amaçlarım için, alakasız olduğunu kabul ediyorum. 23andMe'nin belirli bir kişiye ilişkin tüm ortak akrabaların yapılandırılmış bir veri setine erişim sağlamaması ve böylece başka bir akrabada akraba bulunmamasına bağlı olarak akraba olma olasılığını ortadan kaldırması göz önüne alındığında, yapabileceğim en iyi şey budur ortak akraba seti. Dolayısıyla, Z kişisinin profilinde, babam tarafından kuzenlerimin birçoğunun uzak kuzenleri olduklarını ve emin olmadığım A kişisinin 3. kuzenleri olduklarını görürsem, Z kişisinin annemin tarafında olduğunu düşünürüm. A kişisi gibi
Sorun
"X ile 2. kuzenseniz ve Y, Z, A ve B ile uzaktaysanız ve X, C ile 3. kuzen, D ile 4. ve E ile uzaksa, o zaman belki bağlantı şu şekildedir: ... "son derece zorlaştı ve hiçbir sonuç vermedi.
Soru
Bir kuzenle tam olarak bir kuzenle olan ilişkinizi, yalnızca sizin ortak kuzenlerle olan ilişkinize karşı onların karşılıklı kuzenlerle ve bu kuzenlerin diğer kuzenlerle olan ilişkisine vb. Göre belirlemek mümkün müdür? Öyleyse, ilişkiyi nasıl belirleyeceğiz?
Bu net değilse, soruyu açıklamak için bir örnek
verelim : Diyelim ki ben ve 3. kuzen X nasıl akraba olduğumuzu bilmiyoruz, ancak kuzen A'yı paylaşıyoruz: X, A ile 2. kuzenlerim, A ile 4. kuzenlerim. X aynı zamanda ortak kuzen B'nin 3. kuzenidir ve B, babamdan 2. kuzenim olduğunu bildiğim (paylaşılan) kuzenim C ile 2. kuzenidir. Bu süreci yeterince uygulayarak ve giderken bilgileri belgeleyerek veya Bir ağaç üzerinde grafiğini çizdiğimde, örneğin kuzen X'in babaannemin baba tarafından kuzeni olması gerektiği sonucuna varabilir miyim? Mümkün mü? Bunu nasıl yapabilirim?
Şimdiye kadar ilerleme
Bazen yaptıklarınızdan çok bilmediğiniz şeylerden daha fazlasını öğrenirsiniz ve genellikle bilmediklerinizi netleştirdiğinizde gelecekteki araştırma yönünü daha net hale getirir.
Ne bilmiyorum
Sorunu uzun süre düşündükten sonra, vardığım sonuç, aşağıdaki dört sorunun sorunun yanıtlanıp cevaplanamayacağının ve nasıl yapılacağının özünde olduğuydu (belki yanılıyorum ve bunlar onun merkezinde değil) :
- İki kişinin aynı büyükanne ve büyükbabadan gelip gelmediğini nasıl belirleyebilirim?
- Her bir kişinin bu büyükanne ve büyükbabalardan hangi taraftan geldiğini nasıl belirleyebilirim? (yani X'in anne tarafından büyükbabası ve Y'nin anneannesi)?
- Bu ilişkileri nasıl takip edebilirim (özellikle bunu yapmak için bir program yazacaksam önemlidir)?
- Genel olarak, kuzeninin insanlarla olan ilişkisini bilmekle gerçekten ne kadarını anlayabilirsiniz? Bunlardan herhangi birinin belirlenmesi mümkün mü?
Ne biliyorum
Şimdiye kadar belirlediklerim:
Verilen: A, C'nin n'inci kuzenidir ve B, C'nin n'inci kuzenidir.
- A, B ve C'nin aynı n'inci büyük-büyükanne-büyükbabayı paylaştığını güvenle söylemek için: A ve B aynı zamanda birbirleriyle n'inci kuzenler olmalıdır.
Ancak bu nadiren olur ve bu nedenle bu kural beni çok ileri götürmez. Aynı zamanda, ortak büyükanne ve büyükbabaların hangi taraftan geldiklerini nasıl belirleyeceğini açıklamadığı için henüz yararlı değil.
Çözümün monotonluğu bir engel değil
Sorumun cevabı çok fazla deneme yanılma, monotonluk vb. İçeren bir yöntem olsa bile, titizlikle metodik olduğu sürece (matematiksel anlamda), takip edildiğinde% 100 işe yarayacak sonuna kadar, bunu bir bilgisayara öğretebilir ve bu sonuçları, aşağıdaki gibi birkaç satır kod çağırarak el yapımı grafik oluşturma programıma gönderebilirim:
graph.addEdge("Grandmother #1" ,"Father #1")
graph.addEdge("Grandmother #1", "Father #2")
graph.addEdge("Grandmother #1", "Childless #3")
graph.addEdge("Father #1", "Jimmy")
graph.addEdge("Father #2", "Sally")
graph.addEdge("Jimmy","Son #1")
graph.addEdge("Jimmy","Son #2")
graph.addEdge("Jimmy","Son #3")
Yukarıdaki satırların yarattığı şey budur:
Bazen "% 100 çalışmak" bir şeyin belirlenemeyeceğini belirlemek anlamına gelir. Bu iyi. Yeterli çapraz referansla tüm resmin anlaşılabileceğini varsaymak isterim. Bu programın birçok insan için yararlı olacağını varsayıyorum, bu yüzden onu oluşturmak için yardım alırsam, başkalarının da yararlanabilmesi için onu dağıtmayı çok isterim.
Not: Bazılarını yazdım
Yanıtlar
Gibi geliyor DNA Ressam 'Oran (Are de ne WATO ) aracı yardımı olabilir. Hedef kişinin, DNA'larına dayanarak, ilişkisi önceden bilinen bir dizi başka insanla nasıl ilişkili olduğunu anlamanıza yardımcı olur. Bu konuda daha fazla bilgi bulabilirsiniz burada .
Ayrıca şu anda beta sürümünde olan bir sürüm 2 var, ancak sahip olduğu yeni özelliklerle konuşamıyorum.
WATO ağaçları en iyi umudunuz olarak (benim tarafımdan da dahil olmak üzere) önerilmiş olsa da, önerdiğiniz görev için yeterli olacağına inanmıyorum. Sadece DNA eşleşme verileri kullanılarak güvenilir bir şekilde yapılamayacağını iddia edecek kadar ileri gideceğim. Ebeveyn / çocuk, kardeş ve belki de birinci kuzen arasındaki yakın ilişkilerin ötesine geçtiğinizde, aralarında güvenilir bir şekilde ayrım yapmak için aynı cM aralığını paylaşan çok fazla olası ilişki vardır.
Örneğinizdeki gibi bir ağaç oluşturduğunuzu varsayalım, sonra her bir örnek çifti için ikili bir karşılaştırma yapın (N! / 2 karşılaştırmaları) ve Paylaşılan cM aracını kullanarak olasılıkları arayın (ve, btw, bir şey uygulayabilirseniz bunu otomatik olarak yaparsa, muhtemelen satabilirsiniz). Örnek sayısı arttıkça, genel ağaçtaki hata olasılığı daha hızlı artar ve ağaçta yanlış yerleştirme için adaylar belirlemek mümkün olsa da, en yüksek olasılık hipotezinizin herhangi bir şeyi doğru şekilde yansıttığından asla emin olamazsınız. kuzenleri veya yarı kuzenleri (veya çift kuzenleri - dediğiniz gibi, kültürünüzde çok fazla iç eşlilik varsa, o zaman tüm eşleşmeler şüphelidir).
Bu nedenle DNA şeceresi, geleneksel "kağıt izi" araştırmalarının yerini alması için asla tavsiye edilmemiştir, çünkü en azından öngörülebilir gelecekte olamaz. Kromozom tarayıcıları ve numuneler arasında bölümlerin izini sürerken bile, gerçekten kanıtlayabileceğiniz tek şey kimin ortak atalara sahip olduğu ve muhtemelen ne kadar eski olduğu.
Gerekçemin, meslektaşlarım ve benim "hayal gücümün eksikliğinden kanıtlama" olarak adlandırdığım şeyden zarar görebileceğini anlıyorum ("Bunun nasıl işe yarayacağını hayal edemiyorum" da olduğu gibi), bu nedenle herhangi biri argümanımdaki önemli bir kusuru işaret edebilirse lütfen öyle yapın (herkes kadar bana da yardımcı olur).