Genişden uzun biçime dönme ve ardından sütunları iç içe yerleştirme

Jan 04 2021

Geniş formatta gelen veriler bana verildi. Her satır, geçerli tablonun dışındaki bir değişkenle ve bu değişkenle ilgili olası değerlerle ilgilidir. Şunları yapmaya çalışıyorum: (1) uzun biçime dönme ve (2) özetlenmiş değerleri iç içe yerleştirme.

Misal

library(tibble)

df_1 <-
  tribble(~key, ~values.male, ~values.female, ~values.red, ~values.green, ~value,
        "gender", 0.5, 0.5, NA, NA, NA,
        "age", NA, NA, NA, NA, "50",
        "color", NA, NA, TRUE, FALSE, NA,
        "time_of_day", NA, NA, NA, NA, "noon")

## # A tibble: 4 x 6
##   key         values.male values.female values.red values.green value
##   <chr>             <dbl>         <dbl> <lgl>      <lgl>        <chr>
## 1 gender              0.5           0.5 NA         NA           NA   
## 2 age                NA            NA   NA         NA           50   
## 3 color              NA            NA   TRUE       FALSE        NA   
## 4 time_of_day        NA            NA   NA         NA           noon 

Bu örnekte, genderya female = 0.5ve male = 0.5. Öte yandan, ageyalnızca tek bir değere sahip olabilir 50. 3. satırdan color, red = TRUEve green = FALSE, ve değerlerine sahip olabileceğini öğreniyoruz time_of_day = noon.

Bu nedenle, özetlenmiş bir tablonun iç içe geçmiş biçimini alması gerekir:

my_pivoted_df <-
  structure(
    list(
      var_name = c("gender", "age", "color", "time_of_day"),
      vals = list(
        structure(
          list(
            level = c("male", "female"),
            value = c(0.5,
                      0.5)
          ),
          row.names = c(NA, -2L),
          class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame")
        ),
        "50",
        structure(
          list(
            level = c("red", "green"),
            value = c(TRUE,
                      FALSE)
          ),
          row.names = c(NA, -2L),
          class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame")
        ),
        "noon"
      )
    ),
    row.names = c(NA, -4L),
    class = c("tbl_df", "tbl",
              "data.frame")
  )


## # A tibble: 4 x 2
##   var_name    vals            
##   <chr>       <list>          
## 1 gender      <tibble [2 x 2]>
## 2 age         <chr [1]>       
## 3 color       <tibble [2 x 2]>
## 4 time_of_day <chr [1]>

Bunu çözme girişimim

İle ilgili birkaç sorun var df_1. İlk olarak, sütunların şu anki isimlendirilmesi uygun değildir. Gibi başlıklar valueideal değildir çünkü pivot_longer()'ın ".value"mekanizması ile çelişirler. İkincisi, df_1sahip valuesolduğunda (çoğul) keybirden fazla seçeneği vardır (örneğin, "kırmızı" ve "yeşil" color), ancak valuesadece tek bir seçenek olduğu zaman (tekil) key(örneğin olduğu gibi age). Aşağıda bu cevaptan ilham alan başarısız kodum var .

library(tidyr)
library(dplyr)

df_1 %>%
  rename_with( ~ paste(.x, "single", sep = "."), .cols = value) %>% ## changed the header because otherwise it breaks
  pivot_longer(cols = starts_with("val"),
               names_to = c("whatevs", ".value"), names_sep = "\\.")


## # A tibble: 8 x 7
##   key         whatevs  male female red   green single
##   <chr>       <chr>   <dbl>  <dbl> <lgl> <lgl> <chr> 
## 1 gender      values    0.5    0.5 NA    NA    NA    
## 2 gender      value    NA     NA   NA    NA    NA    
## 3 age         values   NA     NA   NA    NA    NA    
## 4 age         value    NA     NA   NA    NA    50    
## 5 color       values   NA     NA   TRUE  FALSE NA    
## 6 color       value    NA     NA   NA    NA    NA    
## 7 time_of_day values   NA     NA   NA    NA    NA    
## 8 time_of_day value    NA     NA   NA    NA    noon  

Bunu çözmek için bazı tartışmalı numaralarım yok.

Yanıtlar

4 stefan Jan 04 2021 at 06:10

İstediğiniz sonucu elde etmek için düzenli bir yaklaşım şöyle görünebilir:

library(tibble)

df_1 <-
  tribble(~key, ~values.male, ~values.female, ~values.red, ~values.green, ~value,
          "gender", 0.5, 0.5, NA, NA, NA,
          "age", NA, NA, NA, NA, "50",
          "color", NA, NA, TRUE, FALSE, NA,
          "time_of_day", NA, NA, NA, NA, "noon")

library(tidyr)
library(dplyr)
library(purrr)

df_pivoted <- df_1 %>% 
  mutate(across(everything(), as.character)) %>% 
  pivot_longer(-key, names_to = "level", names_prefix = "^values\\.", values_drop_na = TRUE) %>% 
  group_by(key) %>% 
  nest() %>% 
  mutate(data = map(data, ~ if (all(.x$level == "value")) deframe(.x) else .x))
df_pivoted
#> # A tibble: 4 x 2
#> # Groups:   key [4]
#>   key         data            
#>   <chr>       <list>          
#> 1 gender      <tibble [2 × 2]>
#> 2 age         <chr [1]>       
#> 3 color       <tibble [2 × 2]>
#> 4 time_of_day <chr [1]>

DÜZENLE İstenen sonuç hakkındaki yorumlarınızdaki açıklamayı takiben, son olarak harita ifadesinden kurtulabiliriz (temelde, seviyesiz kategoriler için tibble'ları bir vektöre dönüştürmek için) ve iç içe geçmeden önce bir mutat ifadesi ekleyerek NA düzeyine sahip olmayan kategoriler için level:

pivot_nest <- function(x) {
  mutate(x, across(everything(), as.character)) %>% 
    pivot_longer(-key, names_to = "level", names_prefix = "^values\\.", values_drop_na = TRUE) %>% 
    group_by(key) %>% 
    mutate(level = ifelse(all(level == "value"), NA_character_, level)) %>% 
    nest() 
}

df_pivoted <- df_1 %>% 
  pivot_nest()
df_pivoted
#> # A tibble: 4 x 2
#> # Groups:   key [4]
#>   key         data            
#>   <chr>       <list>          
#> 1 gender      <tibble [2 × 2]>
#> 2 age         <tibble [1 × 2]>
#> 3 color       <tibble [2 × 2]>
#> 4 time_of_day <tibble [1 × 2]>
df_pivoted$data
#> [[1]]
#> # A tibble: 2 x 2
#>   level value
#>   <chr> <chr>
#> 1 male  0.5  
#> 2 male  0.5  
#> 
#> [[2]]
#> # A tibble: 1 x 2
#>   level value
#>   <chr> <chr>
#> 1 <NA>  50   
#> 
#> [[3]]
#> # A tibble: 2 x 2
#>   level value
#>   <chr> <chr>
#> 1 red   TRUE 
#> 2 red   FALSE
#> 
#> [[4]]
#> # A tibble: 1 x 2
#>   level value
#>   <chr> <chr>
#> 1 <NA>  noon

df_2 <- tribble(~key, ~value, "age", "50", "income", "100000", "time_of_day", "noon")

df_pivoted2 <- df_2 %>% 
  pivot_nest()
df_pivoted2
#> # A tibble: 3 x 2
#> # Groups:   key [3]
#>   key         data            
#>   <chr>       <list>          
#> 1 age         <tibble [1 × 2]>
#> 2 income      <tibble [1 × 2]>
#> 3 time_of_day <tibble [1 × 2]>
df_pivoted2$data
#> [[1]]
#> # A tibble: 1 x 2
#>   level value
#>   <chr> <chr>
#> 1 <NA>  50   
#> 
#> [[2]]
#> # A tibble: 1 x 2
#>   level value 
#>   <chr> <chr> 
#> 1 <NA>  100000
#> 
#> [[3]]
#> # A tibble: 1 x 2
#>   level value
#>   <chr> <chr>
#> 1 <NA>  noon
3 tmfmnk Jan 04 2021 at 06:38

Sağlanan girişle aynı tür çıktıyı döndürecek bir seçenek:

df_1 %>%
 group_split(key) %>%
 map_dfr(~ select(., where(~ !all(is.na(.)))) %>%
          pivot_longer(-key, names_to = "level", names_prefix = "^values\\.") %>%
          summarise(key = first(key),
                    vals = if(n() == 1) list(value) else list(tibble(level, value))))

  key         vals            
  <chr>       <list>          
1 age         <chr [1]>       
2 color       <tibble [2 × 2]>
3 gender      <tibble [2 × 2]>
4 time_of_day <chr [1]>  

Çıktının yapısı:

$ key : chr [1:4] "age" "color" "gender" "time_of_day" $ vals:List of 4
  ..$ : chr "50" ..$ : tibble [2 × 2] (S3: tbl_df/tbl/data.frame)
  .. ..$ level: chr [1:2] "red" "green" .. ..$ value: logi [1:2] TRUE FALSE
  ..$ : tibble [2 × 2] (S3: tbl_df/tbl/data.frame) .. ..$ level: chr [1:2] "male" "female"
  .. ..$ value: num [1:2] 0.5 0.5 ..$ : chr "noon"
1 denis Jan 04 2021 at 06:01

İşte bir data.tableben daha rahatım çünkü çözüm meltve dcastfakat kolayca aktarılabilmesi olmalıdır dplyr:

library(data.table)
df <- setDT(df_1)

plouf <- melt(df,measure.vars = patterns("value")) %>%
  .[!is.na(value),.(key,level = gsub("values.","",variable),value)] 

bu şunu verir:

           key  level value
1:      gender   male   0.5
2:      gender female   0.5
3:       color    red  TRUE
4:       color  green FALSE
5:         age  value    50
6: time_of_day  value  noon

Artık keyistediğinizi çıkarmak için benzersiz değerlerin üzerinden geçebilirsiniz :

keylist <- unique(plouf$key)
result <- tibble(varname = keylist,
               vals = lapply(keylist,function(x){
                 if(plouf[x == key,level[1]] != "value"){
                   plouf[x == key,.(level,value)]
                 }else{
                   plouf[x == key,value]
                 }
               })
               
)

Burada iç içe geçmiş tibble'ınızı elde edersiniz (data.tables ve içindeki karakterler ile)