Wie lösche ich eine Auswahl mit Avogadro2 (Ubuntu 20.x)?

Dec 23 2020

Aus einem Grund, den ich nicht verstanden habe, wurde Avogadro aus Ubuntu 20.x auslaufen gelassen und das verfügbare Paket Avogadro2ist stattdessen ein weiterer Zweig des Pakets, der leider nicht alle Funktionen abdeckt. Weiß jemand, ob es noch möglich ist, ausgewählte Atome zu löschen, da es unmöglich erscheint, diese ältere, aber leistungsstärkere Version von Avogadro auf dem letzten Ubuntu zu installieren? Ich bin wirklich überrascht, dass eine solche Grundfunktion "verloren" gegangen ist.

Grundsätzlich können Sie auf Atome klicken und diese auswählen (obwohl sie nicht für einen Anzeigestil ausgewählt erscheinen, sondern für "Ball and Stick"). Wenn Sie jedoch CANCEL drücken, wird das gesamte Modell gelöscht (alle Atome). Ich habe diese Funktion häufig verwendet, um Strukturen über die GUI zu bearbeiten, und jetzt kann ich nur fortfahren, wenn ich meine ältere Ubuntu-Distribution verwende.

Antworten

7 GeoffHutchison Dec 25 2020 at 03:23

Ja, ich habe Ihren Beitrag im Forum gesehen - ich bin mir nicht sicher, warum dieses Commit es nicht geschafft hat, aber ich habe jetzt eine Pull-Anfrage.

Das lange und kurze ist, dass, während die wichtigsten "Eingeweide" von Avogadro 2 fertig sind, viele kleine Teile erledigt werden müssen (ein typisches Beispiel). Hilfe ist immer willkommen - es gibt viele Aufgaben, die in wenigen Stunden für alle Interessierten erledigt werden können.

6 gluuke Dec 23 2020 at 22:25

In der Zwischenzeit habe ich einige Lösungen gefunden und liste sie hier für andere Benutzer auf, da offen gesagt nicht viele Pakete es ermöglichen, Atome einfach (per Maus) auszuwählen und zu löschen.

Sie können verwenden, chimerada es die gleiche Funktion über STRG + Maus bietet:https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/data/downloads/1.15/linux_x86_64.html und dann Menü Aktionen -> Atome / Bindungen -> Löschen.
Wenn Sie weiterhin avogadro2unter Linux arbeiten möchten, können Sie Atome einzeln löschen, indem Sie mit der rechten Maustaste in den "Zeichnen" -Modus klicken:https://discuss.avogadro.cc/t/delete-some-atoms-in-a-supercell/341/2

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Ist es eine gute Idee, mit der HRT mit 18 (Transgender) zu beginnen?

Was ist das Wichtigste, was ein 14-jähriger Teenager beachten sollte?

Ich werde in einem Monat 17 und habe darüber nachgedacht, dass ich mich nicht wirklich anders fühle als 11, ist das normal? Werde ich mich wirklich verändern, wenn ich älter werde?

Ich bin 14 Jahre alt, welchen Rat würden Sie mir gerne geben, der für den Rest meines Lebens hilfreich sein wird?

Ich bin 17 Jahre alt, was soll ich tun, um mehr Wissen zu erlangen?

Was soll passieren, wenn man nie in die Pubertät kommt?

Was sind die negativen Auswirkungen der Pubertät (psychische Gesundheit usw.)?

Wie mache ich einen Arzttermin ohne meine Eltern und ohne dass sie wissen, warum ich gehe? Ich bin 15.

Ich bin 13, transgender (ftm) und gehe seit ein paar Monaten zu einem Therapeuten. Wie kann ich ihr sagen, dass ich transgender bin, und sie bitten, sich zu outen?

Ich bin eine 14-jährige, die sich schnell von ihren Hobbys langweilt. Wie finde ich meine Leidenschaft und mein Talent?

Ich bin 19 und Einzelkind. Ich werde depressiv und mache mir Sorgen, dass meinen Eltern etwas passiert, weil sie alles sind, was ich habe. Ich habe keine Freunde und konnte mir mit der Pandemie auch keine aneignen. Ich habe Angst alleine zu sein, was kann ich tun, um mir selbst zu helfen?

Ich bin ein depressiver 13-Jähriger und möchte deswegen einen Arzt aufsuchen, aber ich habe Angst davor und dass meine Eltern es nur als meine Hormone und so abtun werden. Was soll ich machen?

Ich werde morgen 16. Welchen konkreten Rat können Sie einem 16-jährigen Jungen geben?

Ich bin 23 Jahre alt. Was kann ich jetzt tun, das mein Leben für immer verändern wird?

Was ist das Nützlichste, was ich tun kann, wenn ich 14 bin?

Ich wandle von Frau zu Mann um. Wie soll mein neuer Name lauten?

Was ist der beste Weg, um auf natürliche Weise von Mann zu Frau zu wechseln?

Welche Medikamente können einen Mann ohne Operation in eine Frau verwandeln?

Ich bin 16 und werde nächsten Monat 17. Wie bekomme ich einen Therapeuten, wenn meine Mutter denkt, ich brauche keinen?

Ich bin ein 21-jähriger Student. Was kann ich jetzt tun, das mein Leben für immer verändern wird?

Wenn ich mich informieren möchte, um eine Behandlung zur Geschlechtsumwandlung zu beginnen, welchen Arzt sollte ich aufsuchen?

Ist Spironolacton schlecht für die HRT?

Ist 18 ein gutes Alter, um zu MTF zu wechseln?

Lohnt sich eine Gesäßoperation für einen Mann-zu-Frau-Übergang?

Was ist das beste Alter, um mit dem Übergang von Frau zu Mann zu beginnen?

Wie stoppe ich die Pubertät ohne Pubertätsblocker?

Wie bekomme ich eine HRT, ohne zu sagen, dass ich eine HRT möchte?

Wie kann ich als 13-Jähriger Geld sparen und aufbewahren, ohne dass meine Eltern es wissen?

Was ist Ihrer Meinung nach der schwierigere Geschlechtswechsel, weiblich zu männlich (FzM) oder männlich zu weiblich (MzF)?

Wie starte ich meinen Übergang vom Mann zur Frau? Ich war innerlich immer ein Mädchen. Was muss ich tun?

Kommt jeder durch die Pubertät?

Kann man mit 13 mit MTF HRT-Hormonen beginnen?

Transgender: Was war der schwierigste Teil Ihres Übergangs vom Mann zur Frau?

Wie fühlt es sich an, während des Geschlechtswechsels vom Mann zur Frau Brüste wachsen zu lassen?

Ich bin 30 Jahre alt. Was kann ich jetzt tun, das mein Leben für immer verändern wird?

Ich bin 17 und plane, nach meinem Abschluss dieses Jahr als 18-Jähriger zur HRT zu gehen. Was könnte ich bis dahin tun, um mich weiblicher zu fühlen?

Was sind die notwendigen Lebenskompetenzen, die ich in diesem Sommer von 3 Monaten beherrschen kann? Ich bin 17 Jahre alt.

Ich bin gerade 17 geworden, was tue ich jetzt, um mir das beste Leben zu garantieren?

Wie lebe ich das Leben als 19-Jähriger in vollen Zügen?

Was sind die Vor- und Nachteile der Pubertät?

Welche Änderungen treten auf, wenn Sie mit 13 eine HRT erhalten?

Ist es in Ordnung, dass ich 13 Jahre alt bin, aber im Herzen immer noch ein Kind bin?

Wie kann ich mein Leben mit 17 ändern?

Verläuft die Pubertät in Phasen? Kann es aufhören und dann wieder anfangen?

Warum habe ich noch nie eine Frau-zu-Mann-Transgender-Person gesehen?

Ich bin heute 19. Was ist das Wichtigste, was ich lernen sollte?

Wird HRT für Transgender-Teenager empfohlen?

Bin ich immer noch Transgender (FTM), wenn ich erst in der Pubertät anfing, Anzeichen zu zeigen?

Wie man ein großartiges reproduzierbares R-Beispiel macht

Wie kann ich die SQL-Injection in PHP verhindern?

RegEx stimmt mit offenen Tags überein, mit Ausnahme von in sich geschlossenen XHTML-Tags

Ist die Gleitkomma-Mathematik kaputt?

Werfe ich das Ergebnis von Malloc?

Wie kann man in einem Rückruf auf das richtige "this" zugreifen?

Referenz - Was bedeutet dieser Regex?

So vermeiden Sie die Verwendung von Select in Excel VBA

Die PHP-Mail-Funktion schließt das Senden von E-Mails nicht ab

Warum bleibt meine Variable unverändert, nachdem ich sie innerhalb einer Funktion geändert habe? - Asynchrone Code-Referenz

So beheben Sie den Fehler "Header bereits gesendet" in PHP

Warum wird "Namespace std verwenden"; als schlechte Praxis angesehen?

mysqli_fetch_assoc () erwartet Parameter / Aufruf einer Mitgliedsfunktion bind_param () Fehler. Wie bekomme ich den eigentlichen MySQL-Fehler und behebe ihn?

SQL-Injection, die mysql_real_escape_string () umgeht

Wie man gute reproduzierbare Pandas Beispiele macht

Der Scanner überspringt nextLine (), nachdem next () oder nextFoo () verwendet wurden.

Verwendung von ThreeTenABP in Android Project

Leider hat MyApp aufgehört. Wie kann ich das lösen?

Wie funktioniert das Schlüsselwort "this"?

Bitten Sie den Benutzer um Eingabe, bis er eine gültige Antwort gibt

Liste der Listenänderungen, die unerwartet in Unterlisten angezeigt werden

Was ist das explizite Versprechenskonstruktions-Antimuster und wie vermeide ich es?

Liste Änderungen unerwartet nach Zuweisung. Wie klone oder kopiere ich es, um dies zu verhindern?

Die Verwendung mehrerer JFrames: Gute oder schlechte Praxis? [geschlossen]

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