Menghitung / Memvisualisasikan kerapatan elektronik dari informasi orbital yang ditulis dalam format Molden

Question

Saya mencoba mendapatkan kerapatan elektron dari informasi orbital yang ditulis dalam format Molden dengan rumus, $$ \rho(\mathbf{r}) = \sum_{i}^{occ} |\phi_{i}(\mathbf{r})|^{2}. \tag{1} $$

Apakah ada program pasca-pemrosesan untuk menangani pekerjaan ini?

Saya percaya bahwa saya dapat membuat skrip sendiri, karena file Molden tampaknya menyediakan koefisien GTO, tetapi ingin memeriksa apakah sudah ada contoh yang berfungsi.

Sebaiknya data fungsi kerapatan akhir dalam format yang kompatibel dengan perangkat lunak visualisasi biasa (seperti Molden, VMD, dll.), Tetapi menurut saya data tersebut dapat divisualisasikan jika direpresentasikan dalam kisi 3D.

Answer 1

Saya sangat merekomendasikan cclib yang dapat membaca Molden dan menghitung Densitas.

Meskipun saya belum sering menggunakannya, saya cukup yakin Anda dapat melakukan ini dengan:

• Orbkit
• Horton

Tidak diragukan lagi, ada alat lain - Molden adalah format yang cukup standar untuk pertukaran kimia kuantum.