ベータプリーツ平行シートは常に複数のペプチドから形成されていますか?

Aug 23 2020

左側のN末端から始まり、N末端の反対側のストリングの終わりにあるC末端で終わる、湾曲した長さのストリング、つまり1つのポリペプチドを想像することで、ベータプリーツ逆平行シートを概念的に把握できます。

ベータプリーツ平行シートが1つのポリペプチドのみで形成されている場合、同じことを行うことはできません。一本鎖の折り畳みにより、N末端とC末端が互いに平行になるのはどうしてですか?

それとも、平行シートは常に複数のポリペプチドで構成されているのでしょうか?

シングルチェーンの平行シートは次のようになりますか?

回答

4 KarstenTheis Aug 24 2020 at 10:14

一部の逆平行ベータシートには、一次配列で隣接する隣接ストランドがあることは事実ですが、他の場合も存在します。平行ベータシートに関しては、2本の鎖が一次配列で近接している場合、鎖間のポリペプチド鎖はループまたはヘリックスを介して接続することができます。

一次構造へのストランドのマッピングは徹底的に研究されており、何が起こっているかをすばやく示すために2種類の図があります。「TOPS」図では、ストランドを見下ろすふりをします。上下の三角形は、一方または他方の方向のストランドを表します。

ソース: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/pro.3285

円はらせんを表します。接続線をよく見ると、接続が紙面の上にあるのか下にあるのかがわかります。

他の表現では、紙面にシートがあります。例:

ソース: https://image.slideserve.com/258316/beta-sheet-topology-diagrams-l.jpg

持ち帰りメッセージ

  1. ほとんどのシートは混合されています(平行と逆平行の組み合わせ)。
  2. ほとんどの隣接するストランドは、順番に隣接していません。
  3. 2つの隣接する平行なストランドが順番に隣接している場合、それらの間にループまたはらせん(または別のシートのストランド)があり、それらを適切な方向に接続します。