R lmerモデル:自由度とカイ2乗値はゼロです

Aug 21 2020

次のモデルを作成しました。

full <- lmer(DV~ A*B + (1|speaker), data, REML=FALSE)

A <- lmer(DV~ A+ A:B + (1|speaker), data, REML=FALSE)
B <- lmer(DV~ B+ A:B + (1|speaker), data, REML=FALSE)
interaction <- lmer(DV~ A + B + (1|speaker), data, REML=FALSE)

私はanovaを使用して、最初の完全なモデルを他のモデルと比較します。

anova(full, A)
anova(full, B)
anova(full, interaction)

最初の2つの比較では、以下に示すように、dfとカイ2乗の両方の値がゼロの結果が生成されました。

ただし、ヌルモデルをAまたはBのみを含む別のモデルと比較しようとしました。

null <- lmer(DV~ 1 + (1|speaker), data, REML=FALSE)
AA <- lmer(DV~ A + (1|speaker), data, REML=FALSE)
BB <- lmer(DV~ B + (1|speaker), data, REML=FALSE)
AB <- lmer(DV~ A:B + (1|speaker), data, REML=FALSE)

すべての比較で妥当な結果が生成されました(つまり、0 dfではなく、すべての比較が重要です)

私はオンラインで見て、この投稿を見つけました: https://www.researchgate.net/post/What_is_a_Likelihood_ratio_test_with_0_degree_of_freedom

そして、私の推測では、おそらく私の完全なモデルでは、相互作用は主な効果(AとB)なしですべてを予測できる可能性があります。

いくつかの質問を聞きたいんです:

  1. 私の推測はおそらく本当ですか?
  2. それが本当なら、なぜ帰無モデルとの比較が有意な効果を示したのですか?
  3. より一般的なスケールでは、線形混合効果モデルを作成するときに、ヌルモデルから始めて、一度に因子を追加してから、以前のモデルと比較できますか?または、フルモデルから削減する必要がありますか?
  4. ベースモデルとしてA + Bを使用する場合:
base <- lmer(DV~ A+B + (1|speaker), data, REML=FALSE)

A <- lmer(DV~ A + (1|speaker), data, REML=FALSE)
B <- lmer(DV~ B + (1|speaker), data, REML=FALSE)
interaction <- lmer(DV~ A*B + (1|speaker), data, REML=FALSE)

基本モデルとA、B、相互作用の比較をそれぞれ報告しても大丈夫ですか?


ここでデータファイルとRマークダウンドキュメントを見つけてください:dropbox.com/sh/88m8h6blow2xbn5/AABiNccsUlu3AlfPyamQP4n_a?dl = 0この投稿R lmerモデルのRスクリプトで使用した手順についても質問しました:要素を追加するか減らす要因

助けていただければ幸いです。ありがとうございました!

回答

4 RobertLong Aug 23 2020 at 09:18

これは、モデルを起こるfullAそしてB実際には同じです。それらは単に異なる方法でパラメータ化されています。これを確認するには、完全なモデルの推定値を調べます。

(Intercept)  6.03977    0.34949  17.282
AT2         -0.55051    0.07597  -7.246
AT3         -1.16472    0.07597 -15.331
AT4          0.48228    0.07597   6.348
BS          -0.64024    0.07597  -8.427
AT2:BS       0.35379    0.10744   3.293
AT3:BS       0.47244    0.10824   4.365
AT4:BS       0.05247    0.10744   0.488

モデルAでは、変数の主効果を削除してBから、次のものを取得します。

            Estimate Std. Error t value
(Intercept)  6.03977    0.34949  17.282
AT2         -0.55051    0.07597  -7.246
AT3         -1.16472    0.07597 -15.331
AT4          0.48228    0.07597   6.348
AT1:BS      -0.64024    0.07597  -8.427
AT2:BS      -0.28645    0.07597  -3.770
AT3:BS      -0.16781    0.07710  -2.177
AT4:BS      -0.58777    0.07597  -7.737

私たちはすぐにインターセプトの見積もりがいることを確認AT2-AT4同じです。推定AT1:BS第2のモデルでは、メイン効果の推定値と同一であるBフルモデルにおける(第2のモデルは、のための主要な効果は含まれていないためB)。次に、同じ理由で、2番目のモデルの残りの交互作用項Bは、完全なモデルの主効果と同等の交互作用項の合計になります。

> -0.64024 + 0.35379
[1] -0.28645
> -0.64024 + 0.47244
[1] -0.1678
> -0.64024 + 0.05247
[1] -0.58777

相互作用を含むモデルには、常に両方の主効果を含めることをお勧めします。このタイプの問題は発生しません。