Menggunakan dplyr untuk rata-rata grup deret waktu dengan individu dengan panjang berbeda

Aug 20 2020

Pertimbangkan datdibuat di sini:

set.seed(123)
ID = factor(letters[seq(6)])
time = c(100, 102, 120, 105, 109, 130)
dat <- data.frame(ID = rep(ID,time), Time = sequence(time))
dat$group <- rep(c("GroupA","GroupB"), c(322,344)) dat$values <- sample(100, nrow(dat), TRUE)

Kami memiliki data deret waktu untuk 6 orang (6 IDd), yang termasuk dalam 2 kelompok ( GroupAdan GroupB). Kami ingin membuat plot garis yang menunjukkan deret waktu "rata-rata" dari kedua kelompok (jadi akan ada dua garis). Karena setiap individu memiliki panjang yang berbeda, kita perlu melakukannya dat%>%group_by(group), dan memangkas nilai setelah yang terpendek IDdalam kedua kelompok. Dengan kata lain, ID == aadalah yang terpendek di grup 1, jadi garis "rata-rata" untuk GroupAhanya akan memiliki 100 nilai pada sumbu x; juga ID == dyang terpendek GroupBsehingga deret waktu "rata-rata" GroupBadalah 105 nilai panjang pada sumbu x ( time). Bagaimana kita bisa melakukan ini (sebaiknya melalui dplyrpipa) dan mengirim data ke ggplot()?

Jawaban

4 AllanCameron Aug 20 2020 at 02:11

Kamu bisa mencoba:

library(ggplot2)
library(dplyr)

dat %>% 
  group_by(ID) %>%
  mutate(maxtime = max(Time)) %>%
  group_by(group) %>%
  mutate(maxtime = min(maxtime)) %>%
  group_by(group, Time) %>%
  summarize(values = mean(values)) %>%
  ggplot(aes(Time, values, colour = group)) + geom_line()

2 akrun Aug 20 2020 at 02:07

Kita bisa lakukan

library(dplyr)
dat %>% 
   add_count(group, ID) %>%
   group_by(group) %>%
   mutate(n = min(n)) %>%
   group_by(group, ID) %>% 
   summarise(values = mean(values[seq_len(first(n))]))