Un foglio parallelo pieghettato beta è sempre formato da più di un peptide?

Aug 23 2020

Posso afferrare concettualmente il foglio antiparallelo pieghettato beta immaginando una lunghezza curva di corda, cioè un polipeptide, che inizia con il terminale N a sinistra e termina con il terminale C alla fine della stringa, opposto al terminale N.

Non posso fare lo stesso per il foglio parallelo pieghettato beta se è formato da un solo polipeptide . Come può una piega in un singolo filo far sì che i terminali N e C siano paralleli tra loro?

O è che i fogli paralleli sono sempre composti da più di un polipeptide?

Il foglio parallelo a catena singola sarebbe più simile a questo:

Risposte

4 KarstenTheis Aug 24 2020 at 10:14

Mentre è vero che alcuni fogli beta antiparalleli hanno filamenti adiacenti adiacenti nella sequenza primaria, esistono altri casi. Per quanto riguarda i fogli beta paralleli, la catena polipeptidica tra i fili potrebbe essere collegata tramite un anello o un'elica se i due fili sono vicini nella sequenza primaria.

La mappatura dei filamenti sulla struttura primaria è stata studiata a fondo e ci sono due tipi di diagrammi per mostrare rapidamente cosa sta succedendo. Per il diagramma "TOPS", facciamo finta di guardare i fili in basso, e i triangoli su e giù rappresentano i fili in una o nell'altra direzione:

Fonte: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/pro.3285

I cerchi rappresentano le eliche. Se osservi attentamente le linee di connessione, puoi vedere se la connessione è sopra o sotto il piano della carta.

L'altra rappresentazione ha i fogli nel piano della carta, ad esempio:

Fonte: https://image.slideserve.com/258316/beta-sheet-topology-diagrams-l.jpg

Messaggi da portare a casa

  1. La maggior parte dei fogli sono misti (combinazione di paralleli e antiparalleli).
  2. La maggior parte dei fili vicini non sono adiacenti in sequenza.
  3. Quando due fili paralleli vicini sono adiacenti in sequenza, c'è un anello o un'elica tra di loro (o un filo da un foglio diverso) per collegarli nel corretto orientamento.