リストに保存されている任意の数のデータフレームをrmarkdownのページテーブルとして印刷する
Aug 21 2020
リストに含まれているデータフレームを、rmarkdownドキュメントのページテーブルとして印刷したいことがよくあります。適切なdf_print
オプションが選択されている場合、各データフレームを個別に呼び出すと、目的の出力がレンダリングされます。ただし、リストを持つことのポイントは、データフレームの数がrmarkdownドキュメントに渡されるパラメーターによって異なることです。したがって、それは実際の解決策ではありません。
この質問に対するVincentGuyaderの回答と、この例に基づいてrmarkdown::paged_table
、私は次のことを試みましたが成功しませんでした。
これを達成する方法はありますか?df_print
オプションにリモートで類似したページネーションをサポートするパッケージを使用できれば幸いです。
---
title: "Printing paged tables from a list of dataframes in Rmarkdown"
output:
html_document:
df_print: paged
---
```{r}
library(DT)
library(rmarkdown)
library(purrr)
library(knitr)
df_list <- list("cars" = mtcars, "flowers" = iris)
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE, warning = FALSE, message = FALSE, results='asis')
```
### Desired output but impossible to generalise
```{r}
df_list[["cars"]]
```
```{r}
df_list[["flowers"]]
```
### datatable shows as blanks on the page
```{r}
map(df_list, ~DT::datatable(.x) %>%
htmltools::tagList() %>%
print())
```
### rmarkdown outputs dataframe contents as one very long string
```{r}
map(df_list, rmarkdown::paged_table)
```
回答
2 stefan Aug 22 2020 at 07:56
問題は、Datatableをレンダリングするために必要なJSの依存関係がHTML出力に含まれていないことです。ここから借りた回避策は、コードチャンクを追加することです
```{r init-step, include=FALSE}
DT::datatable(mtcars)
```
JS依存関係が含まれることを保証するループまたはマップステートメントの外側。また、purrr::walk
使用map
するとテーブルが2回プロットされる効果があるため、に切り替えることをお勧めします。
---
title: "Printing paged tables from a list of dataframes in Rmarkdown"
output:
html_document:
df_print: paged
---
```{r}
library(DT)
library(rmarkdown)
library(purrr)
library(knitr)
df_list <- list("cars" = mtcars, "flowers" = iris)
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE, warning = FALSE, message = FALSE, results='asis')
```
### Desired output but impossible to generalise
```{r}
df_list[["cars"]]
```
```{r}
df_list[["flowers"]]
```
### datatable shows as blanks on the page
```{r init-step, include=FALSE}
DT::datatable(mtcars)
```
```{r}
walk(df_list, ~DT::datatable(.x) %>%
htmltools::tagList() %>%
print())
```
1 Waldi Aug 22 2020 at 08:00
results='asis'
引数を使用する場合、レンダラー(ここではDT)は、asis
リストに適用する前に一度初期化する必要があります。
これは一般的な問題のようです。リーフレットでここを、Highcharterでここを参照してください。
この一般的な質問に対する答えはここにあります。
この場合:
---
title: "Printing paged tables from a list of dataframes in Rmarkdown"
output:
html_document:
df_print: paged
---
```{r,}
library(DT)
library(rmarkdown)
library(purrr)
library(knitr)
df_list <- list("cars" = mtcars, "flowers" = iris)
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE, warning = FALSE, message = FALSE, results='asis')
# initialize the renderer
data.frame() %>%
DT::datatable() %>%
knitr::knit_print() %>%
attr('knit_meta') %>%
knitr::knit_meta_add() %>%
invisible()
```
```{r , results='asis'}
#Remove already printed element and print the rest
df_list[[1]] <- NULL
map(df_list, ~DT::datatable(.x) %>%
htmltools::tagList() %>%
print())
```