Visualizza i risultati fMRI con l'atlante AAL3
Ho una sovrapposizione fMRI che è stata prodotta dal software di meta-analisi, quindi ho solo il file dei risultati .nii, nessun dato grezzo. Vorrei visualizzare questo file insieme all'atlante AAL3.
Di solito uso FSL ma non riesco a capire come far funzionare l'atlante AAL3 in FSL (sono riuscito a portare il file aal3v1.nii nel posto giusto ma quando provo a selezionarlo nel riquadro atlante, si blocca) .
Ho meno familiarità con MRICron ma sono riuscito a caricare l'atlante AAL3. Tuttavia, non riesco a mostrare le etichette delle regioni del cervello e sono le etichette di cui ho bisogno.
Non ho mai usato SPM prima. Ho provato a seguire diversi manuali di istruzioni / tutorial ma non riesco nemmeno a capire come visualizzare la mia sovrapposizione. Le istruzioni AAL3 sono per SPM e parlano di come impostare contrasti e così via, ma ho solo il file .nii - non ho dati da analizzare.
Qualcuno può offrire la guida di un idiota alla visualizzazione di una sovrapposizione con l'atlante AAL3, per favore, in qualsiasi programma? Ho passato così tante ore a cercare di risolverlo, ma sono totalmente perso.
Risposte
Penso che usare MRIcorn sia il modo più semplice, puoi mettere AAL3v1.nii.gz e AAL3v1.nii.txt nella cartella mricron-templates.
a proposito, quale software usi per fare la meta-analisi fMRI?
meglio, Hui Zheng Shanghai Mental Health Center