Ehemalige feiern

Nov 25 2022
Nichts – absolut nichts – ist besser, wenn sich ein Forscher in seiner frühen Karriere zu einem brillanten Wissenschaftler und Anführer entwickelt. In dieser Woche standen die Erfolge unserer Labor-Alumni im Fokus.

Nichts – absolut nichts – ist besser, wenn sich ein Forscher in seiner frühen Karriere zu einem brillanten Wissenschaftler und Anführer entwickelt. In dieser Woche standen die Erfolge unserer Labor-Alumni im Fokus.

Zitieren als: Kamoun, S. (2022). Alumni feiern.Zenodo https://doi.org/10.5281/zenodo.7358976

In dieser nasskalten Woche vom 21. November 2022 brachte eine Reihe von Begegnungen und Veranstaltungen im Zusammenhang mit Alumni das herzerwärmende Gefühl, alte Freunde und Kollegen zu treffen, in den Mittelpunkt. Nichts – absolut nichts – ist besser, wenn sich ein Forscher in seiner frühen Karriere zu einem brillanten Wissenschaftler und Anführer entwickelt. Das sind ihre Geschichten.

Oxford-Jäger

Das Labor meines Kollegen Renier van der Hoorn von der Universität Oxford hat bahnbrechende Studien darüber durchgeführt, wie Pflanzenhydrolasen in ein koevolutionäres Wettrüsten mit Inhibitoren von Krankheitserregern verwickelt werden, und so dazu beigetragen, die Bedeutung der apoplastischen Immunität zu definieren. Die Jagd nach neuen Pathogenhemmern geht weiter. Tee und Jie sind Schlüsselfiguren in Reniers Team von Hydrolase-Hemmer-Jägern . Am Montag besuchte ich Reniers Labor, um mich über seine Arbeit zu informieren, und traf mich unter anderem mit Tee und Jie.

Tee Nattapong trat dem Labor im Juli 2014 als Teil der International Undergraduate Summer School bei, einem Programm, das gemeinsam vom John Innes Centre und The Sainsbury Laboratory (TSL) organisiert wird. Er arbeitete eng mit einem erfahrenen Wissenschaftler im Labor Vladimir Nekrasov zusammen – derzeit bei Rothamsted Research.

Unsere Studenten im Sommersemester 2014: Nattapong (Tee) Sanguankiattichai aus Thailand via Imperial College und Egem Ozbudak, Izmir Institute of Technology, Türkei. Nattapong arbeitet mit Vladimir Nekrasov und Egem mit Yasin Dagdas.

Tee machte anschließend einen MSc am Imperial College , forschte und trug zu einer Studie über Pathogen-Effektoren bei, zusammen mit Tolga Bozkurt , einem anderen Labor- Absolventen , bevor er nach Oxford zog, um bei Gail Preston zu promovieren und derzeit Postdoc bei Renier zu sein. Sehen Sie sich Tees jüngsten Übersichtsartikel darüber an, wie Bakterien die Flagellin-Erkennung durch Pflanzen überwinden .

Jie Huang ist ein weiteres Mitglied der Oxford Hunters, das mit unserem Labor verbunden ist. Vor ihrem Umzug nach Oxford arbeitete Jie mit dem Labor- Absolventen Suomeng Dong an der Nanjing Agricultural University (NJAU). An der NJAU veröffentlichte Jie eine Reihe von Artikeln über Effektoren des Pflanzenkillers Phytophthora , in denen er zuletzt zeigte, dass der Erreger das alternative Spleißen der Wirts-mRNA moduliert .

Euro-Gewinner

Die Stipendien des Europäischen Forschungsrates (ERC) bieten Wissenschaftlern aller Karrierestufen eine großzügige 5-Jahres-Förderung. ERC Starting Grants werden Bewerbern mit weniger als 7 Jahren Erfahrung nach ihrer Promotion angeboten. Diese Stipendien können die Arbeit von Early Career Researchers (ECRs) beschleunigen, indem sie eine stabile Finanzierung bereitstellen, die riskante und explorative Forschung ermöglicht – genau das, wozu ECRs ermutigt werden sollten. Der Dienstag brachte die wunderbare Nachricht, dass ein Wissenschaftler des Sainsbury Lab, Thorsten Langner , und zwei Alumni, Miriam Oses-Ruiz und Annis Richardson , in der letzten Finanzierungsrunde 2022 einen #ERCStg erhalten haben .

Wie auf der Website von The Sainsbury Lab zu sehen ist, führte die Nachricht nicht nur bei den erfolgreichen Bewerbern, sondern auch bei ihren Kollegen zu jubelnden Feierlichkeiten:

„ Die aufgeregte Energie bei der spontanen Doppelfeier des Labors machte deutlich, dass die TSL-Mitglieder die Erfolge von Nachwuchsforschern als unsere stolzesten Errungenschaften ansehen. Als zukunftsorientiertes Institut glauben wir, dass unser größter Einfluss auf eine nachhaltige Zukunft in der Entwicklung von Führungskräften in der Pflanzenwissenschaft liegen wird. ”

Was macht mehr Freude, als den Erfolg unserer ECRs mitzuerleben?

Thorsten und Miriam sind Master Blasters, die beide an Aspekten der Biologie und Pathologie des furchterregenden Explosionspilzes Magnaporthe oryzae arbeiten . Das Thorsten-Projekt konzentriert sich auf einen pandemischen Stamm dieses Pilzes, der Weizen in Südostasien und Afrika verwüstet . Wie Thorsten schrieb, plant er, „ Weizen-Immunrezeptoren gegen den pandemischen Weizenbrandpilz zu entwerfen, indem er die Schwachstellen des Wirts in eine Verteidigungsstrategie umwandelt “.

Thorsten Langners PANDEMIC-Projekt zum Weizenbrandpilz.

Thorsten will seine Ziele erreichen, indem er sich auf die Virulenz-Effektor-Gene konzentriert, die der Pilz auf einem fremden Teil seines Genoms, dem so genannten Mini-Chromosom, trägt.

In den letzten Jahren hat sich Thorsten Open Science und Preprint zugewandt, wie in diesem früheren Beitrag besprochen . Beispielsweise gingen seiner Hauptarbeit über Mini-Chromosomen Methoden- und Datensatz-Mini-Arbeiten voraus, die er vor der formellen Veröffentlichung in der Zeitschrift PLOS Pathogens mit der Community teilte. Seine Hinwendung zu Open Science wurde von den ERC-Panelisten gebührend zur Kenntnis genommen, als sie in der Zusammenfassung der Entscheidung schrieben: „ Das Engagement des Antragstellers für die Veröffentlichung vor dem Druck und den offenen Datenaustausch sind besonders lobenswert. „Herzlichen Glückwunsch Thorsten. Vielleicht zeigt dieses Beispiel, dass es mehr braucht, als in bestimmten Zeitschriften zu veröffentlichen, um Gutachter und Diskussionsteilnehmer vom Wert und der Wirkung Ihrer Arbeit zu überzeugen.

Ein Ausblick auf die Zukunft — Förderorganisationen bewerten zunehmend das Engagement der Antragsteller für Open Science.

Miriam ist derzeit Ramon y Cajal Research Fellow an der Universität von Navarra in Spanien. Sie hat ihren Ph.D. im Labor der Universität Exeter des Explosionspilz-Zauberers Nick Talbot , bevor er zu ihm nach Norwich kam, als er den Posten des TSL-Geschäftsführers übernahm. Miriams Verbindung zu TSL geht jedoch auf die Zeit vor ihrer Promotion zurück. Im Jahr 2008 absolvierte sie ein Vordoktorat in unserer Gruppe, wo sie mit Joe Win an Projekten zur molekularen Pflanzenpathologie arbeitete. Lassen Sie sich von Miriam inspirieren, junge Leute! Machen Sie ein Vordoktorat, bevor Sie mit Ihrer Promotion beginnen .

Abschied von Miriam Oses-Ruiz, die nach Abschluss ihres Praktikums nach Pamplona, ​​Spanien, zurückkehrt. [15. Oktober 2008]

Miriam will „den Feind kennen“ . Ihr Ziel ist es, den Prozess der zellulären Heterogenität im Rotpilz zu verstehen und zu bestimmen, wie er mit der Fähigkeit des Pathogens zusammenhängt, Pflanzen zu infizieren. Sie wird dies tun, indem sie die als Appressorien bekannten Pilzstrukturen untersucht , die eine enorme physische Kraft erzeugen, um die Pflanzenoberfläche aufzubrechen und Pflanzengewebe zu durchdringen.

Miriam und die Appressorien.

Annis ist am Institute of Molecular Plant Sciences der University of Edinburgh , wo sie das Plant Shape Lab leitet . Das Lab zielt darauf ab, zu verstehen, wie Blätter und Blüten ihre Form bekommen, ein Forschungsprogramm, das sicherlich durch die ERC-Förderung angekurbelt wird.

Vor über 10 Jahren, bevor sie sich der Pflanzenentwicklung widmete, trat Annis unserem Labor bei, um mit Sylvain Raffaele zu promovieren, einem hochrangigen Mitglied unseres Teams, der einige Jahre später sein eigenes ERC-Stipendium erhielt, während er das Quantitative Immunity in leitete Plants (QIP) Lab am INRAe in Frankreich.

Trotz ihres kurzen Aufenthaltes im Labor leistete Annis wichtige Beiträge zu der Arbeit, die Sylvain, Tolga und andere damals an der Identifizierung von Wirtszellprozessen durchführten, die der irische Kartoffelhunger-Erreger Phytophthora infestans kooptiert, um Pflanzen zu infizieren. Dies führte dazu, dass Annis ein Papier mitverfasste, das auf dem Titelblatt der Zeitschrift Plant Physiology erschien .

Bozkurt, Richardsonet al. Einband, der den mächtigen Krankheitserreger der Kartoffelfäule zeigt, der in Pflanzengewebe eindringt.

Rosalind-Franklin-Preisträgerin

Am Dienstagabend besuchten einige von uns die Royal Society in London, um dem Vortrag von Diane Saunders beizuwohnen, „How to outsmart a cereal killer“. Diane ist Pflanzenpathologin am John Innes Centre. Sie wurde von der Royal Society nicht nur für ihre herausragende Forschung ausgezeichnet – sie ist eine weitere ERC-Preisträgerin –, sondern auch für das #WomeninWheat- Programm, das sie zusammengestellt hat, um die Karrieren von ECRs zu inspirieren und voranzubringen.

Diane trat dem Kamoun Lab im Januar 2010 bei, nachdem sie ihre Promotion bei Nick Talbot – damals an der University of Exeter – abgeschlossen hatte, wo sie über den Explosionspilz arbeitete. Wir sind alle zu einem gewissen Grad miteinander verbunden. Das akademische Netzwerk ist so vernetzt wie ein Netz aus Pilzhyphen.

[3. Januar 2010] Neues Labormitglied: Diane Saunders, zuvor Doktorandin bei Nick Talbot, University of Exeter.

Dianes Vortrag an der Royal Society war eine Meisterklasse der Wissenschaftskommunikation. Sie ist ein weiteres Beispiel dafür, dass es mehr braucht, um ein erfolgreicher Wissenschaftler zu sein, als nur Artikeln in bestimmten Zeitschriften nachzujagen. Ich kann Dianes Liebe zu Scicom auf ihre Arbeit am Ausbruch des Aschesterbens zurückführen, die 2012 begann, als sie bei TSL war. Zu dieser Zeit leistete Diane in Zusammenarbeit mit Kentaro Yoshida – jetzt an der Universität Kyoto – und Dan MacLean von TSL Pionierarbeit bei der Anwendung von Open Science und schneller Genomsequenzierung bei Notfällen im Bereich der Pflanzengesundheit – ein Ansatz, den sie später auf Weizenrostkrankheiten anwandte die wir verwendet haben, um die aktuelle Weizenexplosions-Pandemie zu untersuchen .

Diane Saunders, hier im Hintergrund mit Kentaro Yoshida, Anne Edwards und mit Dan MacLean, die das OpenAshDieback-Projekt präsentieren.

Was für eine Woche, oder?

„Captain, it’s Wednesday“, sagt das berühmte Tim und Struppi-Meme . Es gibt noch viele weitere Alaun-Geschichten zu teilen. Einige davon können über diese Twitter-Suche gefunden werden .

Danksagungen

Dieser Posten ist allen ehemaligen und gegenwärtigen Labormitgliedern gewidmet. Vielen Dank, dass Sie Ihre Leidenschaft für die Wissenschaft teilen und verbreiten.