Resumen de 2022

2022 ha sido un año agridulce para mí.

Hemos hecho un gran progreso en el desarrollo continuo de nuestra plataforma de descubrimiento de fármacos computacional basada en la física y aumentada por ML. Hemos construido un motor de campo de fuerza de próxima generación con una precisión de última generación y una cobertura química integral, hemos rediseñado un programa de predicción de energía libre de unión sólido y adaptativo con un rendimiento, una solidez y una precisión incomparables, hemos desarrollado nuevos métodos para integrar datos experimentales de biofísica en simulaciones de dinámica molecular avanzadas para construir modelos realistas de estructuras y dinámicas de proteínas, y hemos creado métodos y modelos para aplicaciones específicas de modalidad para permitir el diseño racional basado en la estructura y la dinámica de degradadores de proteínas específicos y para ayudar al descubrimiento de inhibidores covalentes.

Más importante aún, hemos aplicado con éxito estas herramientas informáticas para permitir y acelerar drásticamente el descubrimiento real de fármacos, como el diseño de nuevos degradadores activos basados ​​en estructuras complejas ternarias modeladas en nuestras simulaciones que antes no se observaban pero que luego se confirmaron en cristalografía, prediciendo con precisión la eficacia de degradación de nuevos moléculas bifuncionales, y enriqueciendo el porcentaje de diseños de inhibidores activos en 5 veces contra un objetivo oncológico de alto valor pero desafiante.

Hemos publicado una serie de artículos que informan sobre la ciencia que subyace a nuestra plataforma computacional:

• Cálculos precisos de energía libre de unión para múltiples moléculas utilizando una red de medición óptima de diferencias por pares
• Predicción de la base estructural de la degradación de proteínas específicas mediante la integración de simulaciones de dinámica molecular con espectrometría de masa estructural
• Modelado del efecto de la cooperatividad en la formación de complejos ternarios y la degradación de proteínas dirigida mediada por degradadores heterobifuncionales
• Caracterización de la flexibilidad del receptor para predecir mutaciones que conducen a la adaptación humana de la hemaglutinina de la influenza
• El aumento lento pero constante de los cálculos de energía libre vinculante en el descubrimiento de fármacos

La parte amarga del año es que me separé de muchos de mis talentosos y dedicados colegas que comparten la misma pasión por el descubrimiento de fármacos. ¡Les deseo lo mejor a todos, mis amigos!

Ahora espero con ansias un nuevo año de oportunidades. Como grupo independiente centrado en la computación (como contemplé en esta entrada de blog ), llevaremos la plataforma que ha impulsado el descubrimiento de fármacos en Silicon Therapeutics y Roivant Discovery a más proyectos de descubrimiento de fármacos en la amplia comunidad de descubrimiento de fármacos, para ampliar la valor de la plataforma y para ayudar a descubrir más medicamentos para los pacientes, más rápido. Por favor manténgase al tanto.

¡Feliz año nuevo y feliz investigación!