estrazione di file compressi dall'estensione .gz durante il download dal server ftp [duplicato]

Aug 20 2020

Ho creato una funzione che scarica i file .gz da un determinato server ftp e voglio estrarli al volo durante il download ed eliminare i file compressi in seguito. Come lo posso fare?

sinex_domain = "ftp://cddis.gsfc.nasa.gov/gnss/products/bias/2013"

def download(sinex_domain):
    user = getpass.getuser()
    sinex_parse = urlparse(sinex_domain)

    sinex_connetion = FTP(sinex_parse.netloc)
    sinex_connetion.login()
    sinex_connetion.cwd(sinex_parse.path)
    sinex_files = sinex_connetion.nlst()
    sinex_userpath = "C:\\Users\\" + user + "\\DCBviz\\sinex"
    pathlib.Path(sinex_userpath).mkdir(parents=True, exist_ok=True)

    for fileName in sinex_files:
        local_filename = os.path.join(sinex_userpath, fileName)
        file = open(local_filename, 'wb')
        sinex_connetion.retrbinary('RETR '+ fileName, file.write, 1024)
        
        #want to extract files in this loop

        file.close()

    sinex_connetion.quit()

download(sinex_domain)

Risposte

1 alani Aug 20 2020 at 02:09

Sebbene esista probabilmente un modo più intelligente che eviti di archiviare tutti i dati in memoria per ogni file, questi sembrano essere file piuttosto piccoli (poche decine di kilobyte non compressi), quindi sarebbe sufficiente leggere i dati compressi in un BytesIObuffer, quindi decomprimerlo in memoria prima di scriverlo nel file di output. (I dati compressi non vengono mai salvati su disco.)

Dovresti aggiungere queste importazioni:

import gzip
from io import BytesIO

e quindi il tuo ciclo principale diventa:

    for fileName in sinex_files:
        local_filename = os.path.join(sinex_userpath, fileName)
        if local_filename.endswith('.gz'):
            local_filename = local_filename[:-3]
        data = BytesIO()
        sinex_connetion.retrbinary('RETR '+ fileName, data.write, 1024)
        data.seek(0)
        uncompressed = gzip.decompress(data.read())
        with open(local_filename, 'wb') as file:
            file.write(uncompressed)

(Nota che file.close()non è necessario.)