Scritture molto lente su MySQL 8 - in attesa del commit del gestore

Aug 15 2020

Ho installato l'installazione docker di MySQL 8 su un dispositivo periferico che ha le seguenti due tabelle su cui scrivere

video_paths | CREATE TABLE `video_paths` (
  `entry` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `timestamp` bigint(20) NOT NULL,
  `duration` int(11) NOT NULL,
  `path` varchar(255) NOT NULL,
  `motion` int(11) NOT NULL DEFAULT '0',
  `cam_id` varchar(255) NOT NULL DEFAULT '',
  `hd` tinyint(1) NOT NULL DEFAULT '0',
  PRIMARY KEY (`entry`),
  KEY `cam_id` (`cam_id`),
  KEY `timestamp` (`timestamp`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=7342309 DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_0900_ai_ci

E

CREATE TABLE `tracker` (
  `id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `table_name` varchar(255) NOT NULL,
  `primary_key_name` varchar(255) NOT NULL,
  `pointer` int(11) NOT NULL DEFAULT '0',
  PRIMARY KEY (`id`),
  UNIQUE KEY `table_name` (`table_name`)
) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=4 DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_0900_ai_ci

Le seguenti query vengono eseguite ogni pochi secondi per un massimo di 32 telecamere e richiedono molto tempo, come indicato dal registro delle query lente.

UPDATE tracker SET pointer = 7342046 WHERE table_name = 'video_paths'

INSERT INTO video_paths (timestamp,duration,path,cam_id,hd) VALUES (1597548365000,5000,'/s/ss/x-0/v/2020-08-16/3/1.ts','x-1',1)

La maggior parte del tempo viene trascorsa nello waiting for handler commitstato

La dimensione totale dei miei dati (tabelle + indice) è ~ 1 GB e ho le seguenti impostazioni abilitate per l'ottimizzazione per la scrittura

skip-log-bin- Disabilitato il registro del cestino perché non ho una replica e quindi non ne ho bisogno innodb_flush_log_at_trx_commit =2- Sto ottimizzando le prestazioni piuttosto che la coerenza qui. range_optimizer_max_mem_size =0Come menzionato in questa domanda , ho consentito alla memoria massima di ottimizzare l'intervallo. inndo_buffer_pool_size= 512Mb- Questo dovrebbe essere sufficiente per i miei dati ?.
innodb_log_file_size= 96Mb* 2 file

A volte vedo query che impiegano fino a 90-100 secondi.

SET timestamp=1597549337;
INSERT INTO video_paths (timestamp,duration,path,cam_id,hd) VALUES (1597548365000,5000,'/s/ss/x-0/v/2020-08-16/3/1.ts','x-1',1);
# Time: 2020-08-16T03:42:24.533408Z
# Query_time: 96.712976  Lock_time: 0.000033 Rows_sent: 0  Rows_examined: 0

--- AGGIORNAMENTO --- Ecco il file completo my.cnf

my.cnf

[mysqld]
pid-file        = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock
datadir         = /var/lib/mysql
secure-file-priv= NULL
# Disabling symbolic-links is recommended to prevent assorted security risks
symbolic-links=0

skip-log-bin
innodb_buffer_pool_size=536870912
innodb_log_file_size=100663296

# Custom config should go here
!includedir /etc/mysql/conf.d/

conf.d/docker.cnf 
[mysqld]
skip-host-cache
skip-name-resolve 

Il contenitore Docker utilizza la modalità host, quindi la memoria completa da 15 GB è disponibile per il contenitore.

--- AGGIORNAMENTO 2 --- Dopo aver aumentato il innodb_buffer_poo_sizea 2 GB come suggerito da @fyrye, le istruzioni ora hanno iniziato a rimanere bloccate STATE = UPDATEinvece di waiting for handler commit.

---- UPDATE 3 --- Sembra che la CPU stia causando il collo di bottiglia

** ---- AGGIORNAMENTO 4 ---- ** Ulteriori informazioni

  1. Dimensione dell'ariete
              total        used        free      shared  buff/cache   available
Mem:          15909        1711        9385        2491        4813       11600
Swap:             0           0           0
  1. Nessun dispositivo SSD / NVMe collegato
  2. SHOW GLOBAL STATUS - https://pastebin.com/vtWi0PUq
  3. SHOW GLOBAL VARIABLES - https://pastebin.com/MUZeG959
  4. SHOW FULL PROCESSLIST - https://pastebin.com/eebEcYk7
  5. htop - htopqui è per il sistema edge che ha altri 4 contenitori in esecuzione che includono l'app principale, ffmpeg, mqtt, ecc.
  6. ulimit -a:
core file size          (blocks, -c) 0
data seg size           (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority             (-e) 0
file size               (blocks, -f) unlimited
pending signals                 (-i) 62576
max locked memory       (kbytes, -l) 64
max memory size         (kbytes, -m) unlimited
open files                      (-n) 1024
pipe size            (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues     (bytes, -q) 819200
real-time priority              (-r) 0
stack size              (kbytes, -s) 8192
cpu time               (seconds, -t) unlimited
max user processes              (-u) 62576
virtual memory          (kbytes, -v) unlimited
file locks                      (-x) unlimited
  1. opstat -xm 5 4
Linux 4.15.0-106-generic (xxxx)    08/18/2020  _x86_64_    (4 CPU)

avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
         26.97    0.00   22.36   22.53    0.00   28.14

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
loop0             0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     3.20     0.00    2.40    2.40    0.00   0.00   0.00
sda              13.78     9.89   32.24   11.44     0.37     4.10   209.51    47.52 1079.07   44.07 3994.87  22.39  97.81

avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
         19.71    0.00   27.85   40.87    0.00   11.57

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
loop0             0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
sda               0.00     0.00    1.40    4.60     0.03     2.71   934.93   142.66 24221.33  666.29 31390.26 166.67 100.00

avg-cpu:  %user   %nice %system %iowait  %steal   %idle
         20.16    0.00   26.77   28.30    0.00   24.77

Device:         rrqm/s   wrqm/s     r/s     w/s    rMB/s    wMB/s avgrq-sz avgqu-sz   await r_await w_await  svctm  %util
loop0             0.00     0.00    0.00    0.00     0.00     0.00     0.00     0.00    0.00    0.00    0.00   0.00   0.00
sda               0.00     0.00    8.80    5.60     0.03     3.45   496.11   141.28 12507.78  194.00 31858.00  69.44 100.00
  1. mpstat -P ALL 5 3
Linux 4.15.0-106-generic (sn-1f0ce8)    08/18/2020  _x86_64_    (4 CPU)

02:15:47 PM  CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
02:15:52 PM  all   21.48    0.00   20.40   29.01    0.00    7.94    0.00    0.00    0.00   21.17
02:15:52 PM    0   24.95    0.00   20.86    5.32    0.00    0.61    0.00    0.00    0.00   48.26
02:15:52 PM    1   17.59    0.00   18.81   57.67    0.00    5.93    0.00    0.00    0.00    0.00
02:15:52 PM    2   21.28    0.00   17.36    0.21    0.00   24.79    0.00    0.00    0.00   36.36
02:15:52 PM    3   22.34    0.00   24.59   52.46    0.00    0.61    0.00    0.00    0.00    0.00

02:15:52 PM  CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
02:15:57 PM  all   20.56    0.00   20.00   28.26    0.00    7.08    0.00    0.00    0.00   24.10
02:15:57 PM    0   24.44    0.00   18.89   12.32    0.00    0.21    0.00    0.00    0.00   44.15
02:15:57 PM    1   17.73    0.00   15.46   33.20    0.00    4.95    0.00    0.00    0.00   28.66
02:15:57 PM    2   18.93    0.00   22.22   12.35    0.00   22.84    0.00    0.00    0.00   23.66
02:15:57 PM    3   21.06    0.00   23.31   55.21    0.00    0.41    0.00    0.00    0.00    0.00

02:15:57 PM  CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
02:16:02 PM  all   21.81    0.00   18.32   26.42    0.00    7.03    0.00    0.00    0.00   26.42
02:16:02 PM    0   26.43    0.00   19.67    0.20    0.00    0.41    0.00    0.00    0.00   53.28
02:16:02 PM    1   20.57    0.00   17.11   45.21    0.00    5.30    0.00    0.00    0.00   11.81
02:16:02 PM    2   19.67    0.00   16.74    0.21    0.00   21.97    0.00    0.00    0.00   41.42
02:16:02 PM    3   20.45    0.00   19.84   58.91    0.00    0.81    0.00    0.00    0.00    0.00

Average:     CPU    %usr   %nice    %sys %iowait    %irq   %soft  %steal  %guest  %gnice   %idle
Average:     all   21.28    0.00   19.57   27.90    0.00    7.35    0.00    0.00    0.00   23.90
Average:       0   25.27    0.00   19.81    5.94    0.00    0.41    0.00    0.00    0.00   48.57
Average:       1   18.63    0.00   17.13   45.39    0.00    5.39    0.00    0.00    0.00   13.45
Average:       2   19.96    0.00   18.78    4.28    0.00   23.20    0.00    0.00    0.00   33.77
Average:       3   21.28    0.00   22.57   55.54    0.00    0.61    0.00    0.00    0.00    0.00

Risposte

3 WilsonHauck Aug 19 2020 at 15:26

Suggerimenti da considerare per la sezione my.cnf [mysqld]

log_error=/var/lib/mysql/sn-1f0ce8-error.log  # from stderr to have a visible error log
innodb_lru_scan_depth=100  # from 1024 to conserve 90% CPU cycles used for function
innodb_io_capacity=1900  # from 200 to allow more IOPSecond to your storage device
innodb_flush_neighbors=2  # from 0 to expedite writing to current extent
innodb_innodb_max_dirty_pages_pct_lwm=1  # from 10 percent to expedite writes
innodb_innodb_max_dirty_pages_pct=1  # from 90 percent to reduce innodb_buffer_pool_pages_dirty count
innodb_change_buffer_max_size=50  # from 25 percent to expedite your high volume activity

Scoprirai che questi suggerimenti ridurranno la CPU occupata e accelereranno il completamento delle query.

Per ulteriori suggerimenti, visualizzare il profilo, il profilo di rete per le informazioni di contatto e gli script di utilità scaricabili gratuitamente per assistere i miglioramenti delle prestazioni.