errore di argomento non di carattere da Perl sub, ma funziona in R

Question

Ho un banale script R che funziona bene:

library(gplots)
A <- c("dog", "cat", "monkey", "fish", "cow", "frog")
B <- c("cat", "frog", "aardvark", "monkey", "cow", "lizard", "bison", "goat")

png('tmp.png')
venn(list(A=A,B=B))

e sto cercando di scrivere una subroutine perl che eseguirà l'azione sopra in R usando il pacchetto Statistics :: R:

#!/usr/bin/env perl

use strict;
use warnings FATAL => 'all';
use feature 'say';
use autodie ':all';
use Carp 'confess';
use Statistics::R;

my @t1 = ("dog", "cat", "monkey", "fish", "cow", "frog");
my @t2 = ("cat", "frog", "aardvark", "monkey", "cow", "lizard", "bison", "goat");
my %data = (
    A => [@t1],
    B => [@t2]
);
sub venn {
    my ($args) = @_; unless (defined $args->{output_filestem}) {
        confess "venn diagram needs an output filename" 
    }
    if (scalar keys %{ $args->{data} } < 2) { printf("There are %u keys in data.\n", scalar keys %{ $args->{data} });
        confess 'There must be >= 2 keys in data.';
    }
    my $R = Statistics::R->new(); foreach my $key (keys %{ $args->{data} }) { $R -> set("$key", $args->{data}{key});
    }
    say __LINE__;
    if (defined $args->{output_type}) { $R -> run(`$args->{output_type}('$args->{output_stem}.$args->{output_type}')`); } else { # output EPS file is default $args->{output_type} = 'eps';
        $R -> run( q`setEPS()`, qq`postscript('$args->{output_filestem}.eps')`,
        );
    }
    my @venn;
    foreach my $key (sort keys %{ $args->{data} }) {
        push @venn, "$key=$key"
    }
    my $venn_cmd = 'venn(list(' . join (', ', @venn) . '))'; say $venn_cmd;
    $R -> run(q`library(gplots)`); $R -> run(qq`$venn_cmd`); say "wrote $args->{output_filename}";
    return $args->{output_filename}
}

venn({
    data => \%data,
    output_filestem => 'venn'
});

ma l'esecuzione di questo script Perl produce un errore:

venn(list(A=A, B=B))

Error:
strsplit(names(map), character(0), fixed = TRUE) : 
  non-character argument
Calls: venn -> vennMembers -> do.call -> strsplit
Execution halted
Command exited with non-zero status 29

Qualcosa di simile è nell'argomento Non carattere nella funzione di divisione della stringa R (strsplit) ma non vedo come applicare ciò che c'è al mio caso.

Forse questo è un errore in Statistics :: R? L'input del sub Perl dovrebbe essere identico allo script R.

e non ho idea di cosa causi questo, perché i comandi R che sto usando sono identici allo script R funzionante.

Perché il sub Perl fallisce, anche quando fa esattamente lo stesso dello script R?

Answer 1

Sigillo mancante:

$R -> set("$key", $args->{data}{key});

dovrebbe essere

$R -> set("$key", $args->{data}{$key});
#                               ^

In caso contrario, vengono popolati A e B undefche portano all'errore.

BTW, "$key"è lo stesso di $key. Non è necessario citare due volte una variabile.