Consulta CSV directamente con DuckDB
Se le asignó una de las siguientes tareas:
— cargue un nuevo archivo csv en BigQuery para su análisis
— agregue un nuevo archivo a su flujo de datos
— realice algunas verificaciones de calidad de datos de toque ligero en un archivo de proveedores
Alcanza las herramientas más cercanas y familiares que conoce. Por lo general, es para cargarlo todo en Excel, ¿verdad? Lo que te pone en marcha. Pero el archivo tiene 600 MB y más de 1,2 millones de líneas. Excel le dice que solo puede cargar el archivo parcialmente.
Bien, entonces, ¿qué sigue?
Es posible que esté en GCP/BigQuery, por lo que hace clic y droppy, pero BQ le dice que la posición 1023845 no es buena. ¿Cómo encuentras esa posición de byte en un archivo? <suspiro>
Buscas en Stackoverflow y te dicen que uses pandas. Te lleva hasta allí, pero tu velocidad se ve obstaculizada porque has olvidado todos los comandos. Tal vez use ChatGPT, pero necesita respuestas de inmediato, y las necesita rápido.
¿No sería genial simplemente 'seleccionar * de salida.csv'?
Bueno, totalmente puedes.
Paso 1
brew install duckdb
> duckdb
D> select * from ‘output.csv*’
Incluso puede hacer `data/*.csv`, o incluso otras extensiones como `data/*.parquet`.
Solución de problemas
Entonces la carga de csv no va tan bien. Has empezado con duckdb, dice
Error: Invalid Input Error: Could not convert string ‘Column_1’ to INT32
in column “Column_1”, at line 100002.
Lo primero que debemos hacer es crear una vista en la parte superior de su csv con algunos números de línea para que pueda comenzar a verificar el archivo y realizar algunos controles de calidad de toque ligero.
create sequence seq_id start 1;
D> create or replace view test_1 as SELECT nextval(‘seq_id’) as seq_id, *
from read_csv(‘output.csv’, ALL_VARCHAR=1, AUTO_DETECT=TRUE);
couple of things here, of reference is https://duckdb.org/docs/data/csv
- Tienes algunos datos malos. Duckdb muestrea cada 100 líneas y adivina el tipo de columna. Algunos datos en su columna no son lo que se supone que deben ser. `ALL_VARCHAR` le permite cargarlo todo, independientemente del tipo de análisis
: `AUTO_DETECT` significa usar la primera fila, adivine cuántas columnas deberían existir. De lo contrario, tendríamos que escribirlas manualmente, `columns={'Column_1,', 'Column_2…}'`
En este punto, dado que nuestra secuencia siempre cuenta, es un buen momento para bloquearla y materializar la vista con nuestros números de línea.
create table test_1_mv as (select * from test_1);
— it seems that line numbers in errors are zero-indexed
— however you cannot start a sequence from 0
— so we need to subtract `1` from the id
select * from test_1 where seq_id = 100001
┌────────┬───────────────┬──────────────┬──┐
│ seq_id │ Column_1 │ Column_2 │ │
│ int64 │ varchar │ varchar │ │
├────────┼───────────────┼──────────────┼──┤
│ 100001 │ Column_1_text │ Column_2_text│ │
├────────┴───────────────┴──────────────┴──┤
│ 1 rows │
└──────────────────────────────────────────┘
Encontremos todas las filas ofensivas. Mi primer pensamiento es buscar todas las filas que tengan `Column_1_text` en ellas.
select * from test_1 where column_1 = ‘Column_1_text’;
select * from test_1
where regexp_matches(Column_1, ‘[a-zA-Z]’)
delete from test_1_mv where seq_id in (select seq_id from test_1_mv
where regexp_matches(Column_1, ‘[a-zA-Z]’));
Escribiendo el nuevo archivo — Exportar
Para exportar los datos de una tabla a un archivo CSV, use la instrucción `COPY`.
COPY test_1_mv TO ‘output_cleaned.csv’ (HEADER, DELIMITER ‘,’);

![¿Qué es una lista vinculada, de todos modos? [Parte 1]](https://post.nghiatu.com/assets/images/m/max/724/1*Xokk6XOjWyIGCBujkJsCzQ.jpeg)



































