Comment supprimer une sélection avec Avogadro2 (Ubuntu 20.x)?

Dec 23 2020

Pour une raison que je ne comprenais pas qu'Avogadro a été éliminé d'Ubuntu 20.x et que le package disponible Avogadro2est à la place une autre branche du package, qui malheureusement ne couvre pas toutes les fonctionnalités. Comme il semble impossible d'installer cette version plus ancienne mais plus puissante d'Avogadro sur le dernier Ubuntu, est-ce que quelqu'un sait s'il est toujours possible de supprimer les atomes sélectionnés? Je suis vraiment surpris qu'une telle fonctionnalité de base ait été "perdue".

Fondamentalement, vous pouvez cliquer et sélectionner des atomes (bien qu'ils n'apparaissent sélectionnés pour aucun style d'affichage mais "boule et bâton"), mais si vous appuyez sur ANNULER, le modèle entier est supprimé (tous les atomes). J'utilisais beaucoup cette fonctionnalité pour manipuler les structures via l'interface graphique et maintenant je ne peux plus continuer à moins d'utiliser mon ancienne distribution Ubuntu.

Réponses

7 GeoffHutchison Dec 25 2020 at 03:23

Oui, j'ai vu votre message sur le forum - je ne sais pas pourquoi ce commit n'est pas arrivé, mais j'ai une pull-request maintenant.

Le long et court est que même si les principaux "tripes" d'Avogadro 2 sont terminés, il y a beaucoup de petites pièces à faire (par exemple). L'aide est toujours la bienvenue - il y a beaucoup de tâches qui peuvent être effectuées en quelques heures pour toute personne intéressée.

6 gluuke Dec 23 2020 at 22:25

En attendant, j'ai trouvé quelques solutions et je les énumère ici pour d'autres utilisateurs, car franchement peu de paquets permettent de sélectionner facilement (via la souris) des atomes et de les supprimer.

  1. vous pouvez utiliser chimeracar il offre la même fonctionnalité via CTRL + souris:https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/data/downloads/1.15/linux_x86_64.html puis menu Actions -> Atomes / Obligations -> supprimer.

  2. si vous souhaitez toujours utiliser avogadro2sous Linux, vous pouvez en fait supprimer les atomes un par un en utilisant le clic droit en mode "Dessiner":https://discuss.avogadro.cc/t/delete-some-atoms-in-a-supercell/341/2