Score croisé très faible pour la régression avec un grand .corr () entre la caractéristique et le résultat

Aug 18 2020

Im essayant de faire une régression avec sklearn entre une fonctionnalité et un résultat. Voici l'ensemble de données que j'ai:

       bruto  ukupno gradjevinski din
0    2494.98                857951.27
1    2912.60                694473.11
2    3397.50               1310529.72
3    2678.00                199688.14
4    4310.00               1377366.95
5    2086.28                569312.33
6    3061.80                660803.42
7    4095.00               1187732.61
8    3997.00               1304793.08
9    6503.88               1659629.13
10   6732.00               1264178.31
11    940.10                172497.94
12   1543.00                598772.40
13   5903.85                809681.19
14   2861.61                333983.85
15   3682.76               1430771.50
16   2802.00               1145812.21
17   3032.00                356840.54
18   2635.00                543912.80
19   3749.00               1004940.27
20   4300.50               1889560.55
21   9722.00               2137376.95
22   3823.33                891633.50
23   1648.21                335115.40
24  24575.00              19273129.14
25   3926.00               1223803.28
26   3228.00                874000.00
27   4062.00               1090000.00
28   1316.24                332718.54
29   2497.99                519398.70
30  12123.94               2504783.69
31   2057.50                957042.37
32   2495.00                857951.27
33   3770.73               1743978.85
34    864.00                251269.48
35    774.71                192487.26

J'ai trouvé la corrélation entre la fonctionnalité et le résultat avec .corr ():

                            bruto  ukupno gradjevinski din
bruto                    1.000000                 0.878914
ukupno gradjevinski din  0.878914                 1.000000

J'ai un corr de 0,87 et je pense que c'est très décent pour la régression, mais lorsque je crée un modèle de régression et que j'obtiens un score croisé, j'obtiens une valeur pour le score croisé qui est négatif et supérieur à 1 (parfois -50,23) et c'est très étrange pour moi. J'ai essayé avec beaucoup de modèles différents et avec un nombre de plis différent mais les résultats sont les mêmes. Voici le code de la régression:

features = df[['bruto']]
results = df[['ukupno gradjevinski din']]

regressors = [["Linear Regression", LinearRegression(normalize=False)],
              ["Lasso Regression", Lasso(normalize=False)],
              ["Gaussian Process Regressor", GaussianProcessRegressor()],              
              ["SVR linear", SVR(kernel = 'linear', gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR poly 2", SVR(kernel = 'poly', degree=2, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR poly 3", SVR(kernel = 'poly', degree=3, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR poly 4", SVR(kernel = 'poly', degree=4, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR poly 5", SVR(kernel = 'poly', degree=5, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR rbf C=0.01", SVR(kernel = 'rbf', C=0.01, gamma='scale', max_iter = 1500)],              
              ["SVR rbf C=0.1", SVR(kernel = 'rbf', C=0.1, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR rbf C=0.5", SVR(kernel = 'rbf', C=0.5, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR rbf C=1", SVR(kernel = 'rbf', C=1, gamma='scale', max_iter = 1500)],              
              ["SVR rbf C=10", SVR(kernel = 'rbf', C=10.0, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR rbf C=20", SVR(kernel = 'rbf', C=20.0, gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["SVR rbf C=50", SVR(kernel = 'rbf', C=50.0, gamma='scale', max_iter = 1500)],              
              ["SVR sigmoid", SVR(kernel = 'sigmoid', gamma='scale', max_iter = 1500)],
              ["GradientBoostingRegressor", GradientBoostingRegressor()],
              ["RandomForestRegressor", RandomForestRegressor(n_estimators = 150)],
              ["DecisionTreeRegressor", DecisionTreeRegressor(max_depth=10)],
              ["Bagging Regressor TREE", BaggingRegressor(base_estimator = DecisionTreeRegressor(max_depth=15))],
              ["Bagging Regressor FOREST", BaggingRegressor(base_estimator = RandomForestRegressor(n_estimators = 100))],
              ["Bagging Regressor linear", BaggingRegressor(base_estimator = LinearRegression(normalize=True))],
              ["Bagging Regressor lasso", BaggingRegressor(base_estimator = Lasso(normalize=True))],
              ["Bagging Regressor SVR rbf", BaggingRegressor(base_estimator = SVR(kernel = 'rbf', C=10.0, gamma='scale'))],
              ["Extra Trees Regressor", ExtraTreesRegressor(n_estimators = 150)],
              ["K-Neighbors Regressor 1", KNeighborsRegressor(n_neighbors=1)],
              ["K-Neighbors Regressor 2", KNeighborsRegressor(n_neighbors=2)],
              ["K-Neighbors Regressor 3", KNeighborsRegressor(n_neighbors=3)],
              ["AdaBoostRegressor", AdaBoostRegressor(base_estimator=None)],
              ["AdaBoostRegressor tree", AdaBoostRegressor(base_estimator=DecisionTreeRegressor(max_depth=15))],
              ["AdaBoostRegressor forest", AdaBoostRegressor(base_estimator=RandomForestRegressor(n_estimators = 100))],
              ["AdaBoostRegressor lin reg", AdaBoostRegressor(base_estimator=LinearRegression(normalize=True))],
              ["AdaBoostRegressor lasso", AdaBoostRegressor(base_estimator = Lasso(normalize=True))]]


for reg in regressors:

     try:

           scores = cross_val_score(reg[1], features, results, cv=5)
           scores = np.average(scores)
           print('cross val score', scores)
           print()

     except:
          continue

J'ai essayé de mettre à l'échelle mes fonctionnalités avec Normalizer, StandardScaler et MinMaxScaler mais les résultats sont les mêmes. De l'aide?

Réponses

1 Yahya Aug 18 2020 at 06:41

J'étais sur le point de publier ma réponse sur l'autre forum, mais elle a été transférée ici.

Il y a quelques points cruciaux que vous devez garder à l'esprit:

  1. Ce n'est pas qui a le meilleur algorithme qui gagne. C'est celui qui a le plus de données. (Banko et Brill, 2001)

Bank et Brill en 2001 ont fait une comparaison entre 4 algorithmes différents, ils ont continué d'augmenter la taille de l'ensemble d'entraînement à des millions et sont arrivés à la conclusion citée ci-dessus. Et vos données sont trop peu nombreuses !

  1. Chaque fois que vous parlez de modèles linéaires, souvenez-vous simplement de leur ennemi - les valeurs aberrantes . Si vous tracez vos données, vous pouvez le voir clairement.

  1. cross_val_scorerenvoie le R ^ 2 par défaut pour presque tous les modèles linéaires (c'est-à-dire Regressor). La meilleure valeur de cette métrique = 1 (c'est-à-dire totalement ajustée), ou = 0 (c'est-à-dire une ligne horizontale), ou elle peut être négative (c'est-à-dire pire qu'une ligne horizontale). Plus d'infos ici . Ensuite, dans l'expérience que j'ai menée, vous verrez comment les résultats sont valides.

  2. Un modèle alternatif serait le Multi-layer Perceptron Regressor; avec nombre de couches = 3, le modèle mapperait n'importe quelle fonction compliquée.

  3. La validation croisée serait plus utile si vous disposez de suffisamment de données. Cependant, dans votre cas, les scores CV varient sensiblement.

Veuillez méditer sur les résultats de l'expérience explicative suivante:

from sklearn.linear_model import LinearRegression
from sklearn.model_selection import cross_val_score
from sklearn.neural_network import MLPRegressor
from scipy.stats import pearsonr
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

X = np.array([2494.98,2912.6,3397.5,2678,4310,2086.28,3061.8,4095,3997,
              6503.88,6732,940.1,1543,5903.85,2861.61,3682.76,2802,3032,
              2635,3749,4300.5,9722,3823.33,1648.21,24575,3926,3228,4062,1316.24,
              2497.99,12123.94,2057.5,2495,3770.73,864,774.71]).reshape(-1, 1)

y = np.array([857951.27,694473.11,1310529.72,199688.14,1377366.95,569312.33,660803.42,1187732.61,
          1304793.08,1659629.13,1264178.31,172497.94,598772.4,809681.19,333983.85,1430771.5,1145812.21,
          356840.54,543912.8,1004940.27,1889560.55,2137376.95,891633.5,335115.4,19273129.14,1223803.28,
          874000,1090000,332718.54,519398.7,2504783.69,957042.37,857951.27,1743978.85,251269.48,192487.26])

X_, y_ = zip(*sorted(zip(X, y)))
plt.plot(X_, y_, '-x')
plt.title("Plot of Dataset")
plt.show()

print("Linear Regression :: Before Removing An Outlier")
reg = LinearRegression()
print(np.average(cross_val_score(reg, X, y, cv=3)))

X, y = X_[:-1], y_[:-1]
plt.plot(X, y, '-x')
plt.title("Plot of Dataset After Removing Outlier")
plt.show()

print("Linear Regression :: After Removing An Outlier")
reg = LinearRegression()
print(np.average(cross_val_score(reg, np.array(X).reshape(-1, 1), y, cv=3)))

print("Multi-layer Perceptron Regressor :: The Effect of Mapping Complicated / Non-Linear Function")
mlp = MLPRegressor(hidden_layer_sizes=(16, 16, 16), random_state=2020, activation='identity', max_iter=1000)
print(np.average(cross_val_score(mlp, np.array(X).reshape(-1, 1), y, cv=3)))

RÉSULTATS

Ceci après avoir supprimé une seule valeur extrême ( sans autre exploration ni exécution de travaux sophistiqués comme l'utilisation d'un détecteur de valeurs aberrantes ). Comme vous pouvez le voir, il n'y aurait pas de ligne unique qui correspond à tous les points.

Linear Regression :: Before Removing An Outlier
Average CVs Score: -1.7085612243433703

Linear Regression :: After Removing An Outlier
Average CVs Score: -0.12386365189238795

Multi-layer Perceptron Regressor :: The Effect of Mapping Complicated / Non-Linear Function
Average CVs Score: 0.16131374234257037